More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0097 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  100 
 
 		 306 aa  601  1.0000000000000001e-171  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  50.18 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  49.08 
 
 		 277 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  49.08 
 
 		 277 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  46.55 
 
 		 276 aa  219  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  40.21 
 
 		 303 aa  215  8e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  42.96 
 
 		 272 aa  208  9e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  36.3 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  45.36 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  44.96 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  41.85 
 
 		 355 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  42.23 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.28 
 
 		 362 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  45.65 
 
 		 706 aa  193  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  44.72 
 
 		 372 aa  192  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.93 
 
 		 387 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.93 
 
 		 371 aa  192  8e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  39.19 
 
 		 364 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  39.56 
 
 		 364 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  44.96 
 
 		 279 aa  191  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  39.19 
 
 		 367 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  43.07 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  40.29 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  39.56 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  39.19 
 
 		 364 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  39.13 
 
 		 402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  39.56 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  39.56 
 
 		 371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  38.83 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  38.83 
 
 		 382 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  41.64 
 
 		 279 aa  189  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  43.22 
 
 		 280 aa  189  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  39.19 
 
 		 364 aa  188  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.19 
 
 		 364 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  41.49 
 
 		 279 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  41.52 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  39.07 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  42.65 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  38.46 
 
 		 365 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  38.46 
 
 		 374 aa  185  7e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  41.38 
 
 		 315 aa  185  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  43.43 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  40.44 
 
 		 371 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  38.1 
 
 		 374 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  41.52 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  38.1 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  46.67 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  41.82 
 
 		 360 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  38.27 
 
 		 277 aa  182  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.34 
 
 		 358 aa  182  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.15 
 
 		 373 aa  182  7e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  40.2 
 
 		 349 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0697  prephenate dehydratase  39.48 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  40.15 
 
 		 358 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.56 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  39.64 
 
 		 355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  38.99 
 
 		 381 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.88 
 
 		 360 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.52 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  37.04 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.52 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.52 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.52 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  39.56 
 
 		 359 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.52 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.52 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.52 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1905  prephenate dehydratase  38.69 
 
 		 279 aa  178  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  39.35 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  38.49 
 
 		 293 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  41.97 
 
 		 371 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  36.26 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  39.42 
 
 		 358 aa  176  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  40.93 
 
 		 285 aa  176  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2048  Prephenate dehydratase  40.43 
 
 		 383 aa  174  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  37.76 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08570  prephenate dehydratase  37.68 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  39.19 
 
 		 359 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  39.49 
 
 		 280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1274  Prephenate dehydratase  38.91 
 
 		 283 aa  172  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.143438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  40.93 
 
 		 326 aa  172  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  35.9 
 
 		 274 aa  172  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.29 
 
 		 355 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  38.41 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.51 
 
 		 368 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  38.99 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  43.64 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  38.41 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  38.41 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  39.93 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  40.29 
 
 		 316 aa  170  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  41.58 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  40.74 
 
 		 359 aa  169  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  35.66 
 
 		 356 aa  168  9e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0794  prephenate dehydratase  38.46 
 
 		 552 aa  168  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  36.13 
 
 		 393 aa  168  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0100  Prephenate dehydratase  45.49 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863601  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.79 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.79 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0771  prephenate dehydratase  38.46 
 
 		 552 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>