127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0084 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0084  adenine deaminase  100 
 
 		 572 aa  1131    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1744  adenine deaminase  36.74 
 
 		 570 aa  404  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2495  adenine deaminase  41.04 
 
 		 575 aa  389  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0717  adenine deaminase  38.46 
 
 		 571 aa  382  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.8271  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0791  adenine deaminase  38.05 
 
 		 571 aa  379  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0522  adenine deaminase  39.34 
 
 		 567 aa  369  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_697  adenine deaminase  37.17 
 
 		 571 aa  372  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0615  adenine deaminase  40 
 
 		 613 aa  360  3e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.942349  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1461  adenine deaminase  40.77 
 
 		 581 aa  358  1.9999999999999998e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223433  normal  0.788122 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2318  adenine deaminase  39.68 
 
 		 565 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.793181 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0768  adenine deaminase  39.35 
 
 		 581 aa  357  3.9999999999999996e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0417  adenine deaminase  39.65 
 
 		 576 aa  356  6.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3297  adenine deaminase  39.18 
 
 		 564 aa  356  7.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0653  adenine deaminase  39.89 
 
 		 581 aa  355  1e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3735  adenine deaminase  39.47 
 
 		 563 aa  351  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1216  adenine deaminase  34.95 
 
 		 576 aa  350  4e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0967  adenine deaminase  39.65 
 
 		 573 aa  350  5e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.489657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2226  adenine deaminase  41.25 
 
 		 564 aa  347  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.261365  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0985  adenine deaminase  38.72 
 
 		 565 aa  346  6e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2645  adenine deaminase  38.72 
 
 		 565 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0463  adenine deaminase  37.76 
 
 		 596 aa  343  5.999999999999999e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0688218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3101  adenine deaminase  39.32 
 
 		 565 aa  342  9e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0385  adenine deaminase  41.78 
 
 		 565 aa  342  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0136  adenine deaminase  39.05 
 
 		 570 aa  340  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.213614  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2831  adenine deaminase  39.14 
 
 		 565 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611398  normal  0.396572 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  36.28 
 
 		 576 aa  335  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0998  adenine deaminase  39.47 
 
 		 564 aa  332  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00442285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1063  adenine deaminase  38.91 
 
 		 569 aa  332  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833113  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0428  adenine deaminase  37.41 
 
 		 573 aa  330  3e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1731  adenine deaminase  33.91 
 
 		 574 aa  330  4e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.820357  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3359  adenine deaminase  37.13 
 
 		 603 aa  329  8e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.234108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2849  adenine deaminase  38.83 
 
 		 573 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0733  adenine deaminase  35.12 
 
 		 584 aa  323  7e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.992989  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1539  adenine deaminase  40.19 
 
 		 518 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196939  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1575  adenine deaminase  37.8 
 
 		 558 aa  318  2e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.944979 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1972  adenine deaminase  37.07 
 
 		 601 aa  315  1.9999999999999998e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.500438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2771  adenine deaminase  36.13 
 
 		 588 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153366  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2799  adenine deaminase  38.39 
 
 		 601 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1778  adenine deaminase  36.54 
 
 		 567 aa  306  9.000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1712  adenine deaminase  33.51 
 
 		 566 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000241505  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1555  adenine deaminase  32.1 
 
 		 568 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5277  adenine deaminase  39.05 
 
 		 595 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.899857 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0034  cryptic adenine deaminase  35.13 
 
 		 588 aa  303  8.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03549  cryptic adenine deaminase  35.3 
 
 		 588 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0038  adenine deaminase  35.3 
 
 		 588 aa  302  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03491  hypothetical protein  35.3 
 
 		 588 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3878  cryptic adenine deaminase  35.13 
 
 		 588 aa  302  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4030  cryptic adenine deaminase  35.6 
 
 		 588 aa  302  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.377933 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3342  adenine deaminase  37.12 
 
 		 551 aa  301  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0903349  decreased coverage  0.00263783 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4254  cryptic adenine deaminase  35.25 
 
 		 569 aa  301  3e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5095  cryptic adenine deaminase  35.25 
 
 		 588 aa  300  6e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0272837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5735  adenine deaminase  38.62 
 
 		 542 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.101601 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4173  cryptic adenine deaminase  34.96 
 
 		 588 aa  298  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2836  adenine deaminase  36.73 
 
 		 597 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0420  adenine deaminase  37.85 
 
 		 564 aa  294  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0418  adenine deaminase  37.4 
 
 		 551 aa  293  6e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1198  adenine deaminase  38.43 
 
 		 545 aa  291  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0683  adenine deaminase  33.39 
 
 		 551 aa  290  4e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.458453  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0338  adenine deaminase  36.56 
 
 		 608 aa  289  9e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3930  Adenine deaminase  38.96 
 
 		 555 aa  287  4e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.265205  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3451  Adenine deaminase  35.69 
 
 		 593 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K13  adenine deaminase  32.69 
 
 		 548 aa  270  4e-71  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297334  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0377  adenine deaminase  39.4 
 
 		 606 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0158  adenine deaminase  31.41 
 
 		 553 aa  266  5.999999999999999e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1360  Adenine deaminase  36.88 
 
 		 598 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4610  adenine deaminase  38.1 
 
 		 593 aa  260  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3164  Adenine deaminase  37.12 
 
 		 595 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1476  putative adenine deaminase  30.62 
 
 		 568 aa  253  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0153306  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1116  adenine deaminase  37.61 
 
 		 595 aa  246  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.535005  hitchhiker  0.000000296634 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0932  adenine deaminase  32.59 
 
 		 596 aa  238  2e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3584  adenine deaminase  33.12 
 
 		 601 aa  238  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  0.0653025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3118  adenine deaminase  34.94 
 
 		 600 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.597443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0239  adenine deaminase  38.6 
 
 		 565 aa  229  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.747545  normal  0.606049 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1462  adenine deaminase  30.52 
 
 		 567 aa  227  5.0000000000000005e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1082  adenine deaminase  34.33 
 
 		 600 aa  226  8e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1928  Adenine deaminase  34.73 
 
 		 564 aa  226  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5424  adenine deaminase  32.6 
 
 		 599 aa  223  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.851483  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3626  Adenine deaminase  34.65 
 
 		 601 aa  213  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0436104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4006  Adenine deaminase  32.65 
 
 		 598 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275128  normal  0.23839 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1578  adenine deaminase  25.91 
 
 		 571 aa  211  2e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3431  adenine deaminase  34.06 
 
 		 601 aa  211  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3740  Adenine deaminase  34.18 
 
 		 601 aa  209  9e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5275  adenine deaminase  31.27 
 
 		 600 aa  208  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2141  Adenine deaminase  32.65 
 
 		 582 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2201  adenine deaminase  30.65 
 
 		 594 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000218331  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3233  adenine deaminase  30.46 
 
 		 623 aa  171  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0973  Adenine deaminase  26.75 
 
 		 592 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.796039  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1744  adenine deaminase  29.08 
 
 		 588 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.454715  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1650  Adenine deaminase  28.11 
 
 		 641 aa  164  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2826  Adenine deaminase  26.9 
 
 		 592 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0266  Adenine deaminase  24.69 
 
 		 581 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000208487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1142  Adenine deaminase  26.11 
 
 		 581 aa  147  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2218  putative adenine deaminase  22.82 
 
 		 584 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000470713 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3063  putative adenine deaminase  22.26 
 
 		 582 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154725  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2753  adenine deaminase  22.99 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.584086  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2766  adenine deaminase  22.78 
 
 		 584 aa  124  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.103156  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3029  putative adenine deaminase  21.72 
 
 		 585 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3026  putative adenine deaminase  22.64 
 
 		 584 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2818  adenine deaminase  22.64 
 
 		 584 aa  122  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3032  adenine deaminase  22.64 
 
 		 584 aa  122  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>