More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0077 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0077  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 138 aa  265  2e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  45.08 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4565  histidine triad (HIT) protein  45.67 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  46.4 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  41.13 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0432  histidine triad (HIT) protein  45.04 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0296  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  43.85 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1435  histidine triad (HIT) protein  46.15 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  37.4 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0651  histidine triad (HIT) protein  42.02 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0007662  unclonable  0.000000000136009 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1483  hypothetical protein  45.76 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  38.17 
 
 		 182 aa  92.8  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2227  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  39.02 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0450  hypothetical protein  42.62 
 
 		 124 aa  90.9  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  37.1 
 
 		 289 aa  88.2  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0365  histidine triad (HIT) protein  40.8 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5377  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1000  hypothetical protein  41.13 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  40.48 
 
 		 1077 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0920  histidine triad (HIT) protein  35.85 
 
 		 174 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0142  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1659  histidine triad (HIT) protein  39.32 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.490499  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0929  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  35.83 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.685079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1420  histidine triad (HIT) protein  32.69 
 
 		 179 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1025  histidine triad (HIT) protein  33.96 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  45.45 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  32.76 
 
 		 284 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2074  histidine triad (HIT) protein  38.78 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165381  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0743  histidine triad (HIT) protein  32.76 
 
 		 168 aa  72  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120261  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  41.82 
 
 		 1418 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1701  HIT family protein  38.26 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652784  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  41.41 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1488  histidine triad (HIT) protein  47.92 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000559646  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2598  histidine triad (HIT) protein  36.84 
 
 		 169 aa  67  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14523  predicted protein  33.96 
 
 		 160 aa  67  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2400  histidine triad (HIT) protein  36.94 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  hitchhiker  0.0085284 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2126  histidine triad (HIT) protein  36.94 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  34.21 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  39.78 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0562  histidine triad (HIT) protein  36.21 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1191  histidine triad (HIT) protein  32.76 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00599383  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1553  histidine triad (HIT) protein  35.78 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.906837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1657  histidine triad (HIT) protein  34.21 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.411198  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1617  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.634502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  37.84 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1878  histidine triad (HIT) protein  35.79 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10458  predicted protein  37.37 
 
 		 171 aa  63.5  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.013689  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  28.89 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0449  diadenosine tetraphosphate hydrolase  31.62 
 
 		 194 aa  63.5  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  27.35 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5156  histidine triad (HIT) protein  33.93 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00760567  hitchhiker  0.000469823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1360  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  41.98 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  36.84 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0551  histidine triad (HIT) protein  39.78 
 
 		 181 aa  62  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12632  hypothetical protein  37.63 
 
 		 195 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0100073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  36.45 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1357  histidine triad (HIT) protein  35.14 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.474283 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1325  histidine triad (HIT) protein  37.27 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0365255  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1228  histidine triad (HIT) protein  34.82 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0074  histidine triad (HIT) protein  42.05 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2958  histidine triad (HIT) protein  38.18 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0711  histidine triad (HIT) protein  43.21 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0363676  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1342  histidine triad (HIT) protein  38.78 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.187699  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1183  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.970277  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1784  histidine triad (HIT) protein  34.23 
 
 		 190 aa  60.8  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.238238  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1612  histidine triad (HIT) protein  30.53 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  42.35 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1504  HIT (HINT, histidine triad) family protein  32 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6595  histidine triad (HIT) protein  36.11 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3837  histidine triad (HIT) protein  34.41 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.868089  normal  0.143653 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1638  histidine triad (HIT) protein  37.76 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000357011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13910  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  32.14 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128023  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  48.57 
 
 		 1348 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1462  histidine triad (HIT) protein  32.76 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  34.55 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  36.79 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1725  histidine triad (HIT) protein  35.78 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  35.78 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2098  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118589  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0925  histidine triad (HIT) protein  32.41 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.220033 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  35.78 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  36.7 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3187  histidine triad (HIT) protein  32.43 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2525  histidine triad (HIT) protein  37.62 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.184582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2372  histidine triad (HIT) protein  32.43 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2559  histidine triad (HIT) protein  34.41 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  35.78 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10680  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  30.26 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000753626  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0141  histidine triad (HIT) protein  32.73 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1387  histidine triad (HIT) protein  27.1 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.026049  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2105  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1065  histidine triad (HIT) protein  36.11 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2243  histidine triad (HIT) protein  36.05 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118301  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2290  histidine triad (HIT) protein  40.43 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0845631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0641  Hit family protein  29.06 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.7817  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2282  histidine triad (HIT) protein  36.05 
 
 		 244 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.983913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2290  histidine triad (HIT) protein  36.05 
 
 		 244 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0327  histidine triad (HIT) protein  40.74 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0007671  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0837  histidine triad (HIT) protein  31.58 
 
 		 173 aa  57  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>