More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0042 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0042  ribosomal protein L9  100 
 
 		 150 aa  288  2e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  43.42 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0007  50S ribosomal protein L9  43.33 
 
 		 151 aa  110  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 153 aa  107  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 148 aa  107  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3812  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 197 aa  105  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.136797 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1246  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00525572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1185  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.105379 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 148 aa  104  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1310  50S ribosomal protein L9  43.28 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 195 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  40.54 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  42.47 
 
 		 148 aa  100  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  34.44 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 147 aa  99.4  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 149 aa  98.6  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2453  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0207068  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2415  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 202 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295062  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 151 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  40 
 
 		 150 aa  97.8  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  41.33 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0914  50S ribosomal protein L9  38.81 
 
 		 150 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334096 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 168 aa  97.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  35.1 
 
 		 148 aa  97.1  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 171 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 165 aa  97.1  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 151 aa  97.1  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 151 aa  96.7  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  34.25 
 
 		 147 aa  95.9  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1694  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 202 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0817246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1620  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 211 aa  96.7  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0645747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2196  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 150 aa  95.9  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0214296  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 191 aa  96.7  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1976  50S ribosomal protein L9  42.54 
 
 		 150 aa  95.9  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.391403  normal  0.167749 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  35.17 
 
 		 151 aa  95.9  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  39.33 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2249  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128176  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  39.86 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 189 aa  95.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2003  50S ribosomal protein L9  44.44 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499343  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 151 aa  94.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 193 aa  94.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1529  50S ribosomal protein L9P  39.55 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00288476  normal  0.135454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 150 aa  94.4  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  37.01 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  38.26 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  34.44 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2461  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 196 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 188 aa  94  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 194 aa  94  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 189 aa  93.6  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 189 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 191 aa  93.6  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 174 aa  93.6  9e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  34.25 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 189 aa  93.2  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 189 aa  92  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  39.86 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0083  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 202 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  36.05 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2988  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 194 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0423  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  36.67 
 
 		 160 aa  92  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>