More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0041 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0041  replicative DNA helicase  100 
 
 		 585 aa  1164    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2896  replicative DNA helicase  40.34 
 
 		 602 aa  417  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0132552  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3529  replicative DNA helicase  40.17 
 
 		 593 aa  396  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0449592  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1083  replicative DNA helicase  37.01 
 
 		 610 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.247036  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  41.61 
 
 		 903 aa  375  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0931  replicative DNA helicase  36.84 
 
 		 610 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  39.92 
 
 		 844 aa  360  6e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  40.51 
 
 		 874 aa  351  3e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  45.76 
 
 		 445 aa  350  6e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  46.49 
 
 		 452 aa  346  6e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  46.23 
 
 		 452 aa  346  8e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  43.01 
 
 		 446 aa  345  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  44.44 
 
 		 454 aa  345  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  47.93 
 
 		 444 aa  344  2.9999999999999997e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  46.11 
 
 		 442 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2587  replicative DNA helicase  41.75 
 
 		 879 aa  339  9e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00388825  normal  0.462592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  44.44 
 
 		 451 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0015  replicative DNA helicase  41.81 
 
 		 945 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.756014  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  45.85 
 
 		 452 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  44.68 
 
 		 447 aa  335  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  43.08 
 
 		 460 aa  335  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  43.64 
 
 		 453 aa  334  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  44.44 
 
 		 456 aa  333  5e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  42.82 
 
 		 461 aa  332  8e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  44.44 
 
 		 459 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  42.68 
 
 		 459 aa  332  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  45.31 
 
 		 449 aa  331  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  42.97 
 
 		 448 aa  329  7e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  41.86 
 
 		 461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  45.22 
 
 		 453 aa  327  5e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  44.33 
 
 		 451 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  43.12 
 
 		 457 aa  326  8.000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  44.33 
 
 		 451 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5742  replicative DNA helicase  41.86 
 
 		 460 aa  324  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  42.41 
 
 		 462 aa  324  3e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  43.93 
 
 		 456 aa  323  6e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  41.6 
 
 		 455 aa  323  7e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  40.97 
 
 		 468 aa  321  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  40.97 
 
 		 457 aa  320  3.9999999999999996e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  42.08 
 
 		 469 aa  320  6e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  42.86 
 
 		 481 aa  319  7e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  43.73 
 
 		 474 aa  319  7e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  43.56 
 
 		 453 aa  318  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1462  primary replicative DNA helicase  42.72 
 
 		 2605 aa  318  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.695864 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  43.15 
 
 		 453 aa  317  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  43.15 
 
 		 449 aa  317  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  42.89 
 
 		 453 aa  317  4e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  42.89 
 
 		 453 aa  317  4e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  42.89 
 
 		 453 aa  317  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  42.89 
 
 		 453 aa  317  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  42.89 
 
 		 453 aa  317  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  42.89 
 
 		 453 aa  317  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  42.89 
 
 		 453 aa  317  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  41.82 
 
 		 445 aa  316  9e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  43.15 
 
 		 449 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  43.15 
 
 		 454 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5558  replicative DNA helicase  40.05 
 
 		 464 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  42.49 
 
 		 444 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  41.16 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  43.56 
 
 		 454 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5469  replicative DNA helicase  41.34 
 
 		 448 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.430835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5868  replicative DNA helicase  41.34 
 
 		 464 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  43.67 
 
 		 442 aa  313  6.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  41.86 
 
 		 449 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  43.19 
 
 		 471 aa  311  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  42.38 
 
 		 449 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  45.24 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2007  replicative DNA helicase  42.23 
 
 		 458 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  40.78 
 
 		 441 aa  310  6.999999999999999e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  43.33 
 
 		 456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  40.67 
 
 		 456 aa  307  3e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  42.64 
 
 		 440 aa  306  9.000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  45.55 
 
 		 469 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  39.85 
 
 		 525 aa  304  3.0000000000000004e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  41.31 
 
 		 480 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  44.16 
 
 		 447 aa  301  2e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  41.92 
 
 		 462 aa  301  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  42.61 
 
 		 461 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  40.47 
 
 		 481 aa  301  3e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0041  replicative DNA helicase  39.59 
 
 		 514 aa  300  5e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  42.82 
 
 		 457 aa  300  6e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  42.82 
 
 		 457 aa  300  6e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  39.74 
 
 		 513 aa  298  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0517  replicative DNA helicase  42.46 
 
 		 445 aa  299  1e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0466276  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  39.39 
 
 		 509 aa  298  3e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  41.15 
 
 		 456 aa  298  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  43.52 
 
 		 446 aa  297  4e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  40.75 
 
 		 456 aa  296  5e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0013  replicative DNA helicase  42.56 
 
 		 457 aa  296  7e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000449355 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  43.33 
 
 		 470 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  41.33 
 
 		 443 aa  295  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  44.39 
 
 		 444 aa  294  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  42.64 
 
 		 508 aa  293  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  41.97 
 
 		 450 aa  293  6e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  38.85 
 
 		 439 aa  293  6e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  38.56 
 
 		 481 aa  292  1e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  38.3 
 
 		 444 aa  292  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4119  replicative DNA helicase  41.41 
 
 		 444 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  43.11 
 
 		 463 aa  291  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  42.01 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>