More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4329 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  100 
 
 
242 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  89.75 
 
 
244 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4475  GrpE protein  67.69 
 
 
224 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323495  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  42.31 
 
 
190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  43.21 
 
 
210 aa  129  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  43.17 
 
 
208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  43.38 
 
 
199 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  44.78 
 
 
188 aa  126  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  41.34 
 
 
181 aa  123  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 
186 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  35.26 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  43.57 
 
 
200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  46.48 
 
 
189 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  42.96 
 
 
198 aa  118  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  44.85 
 
 
173 aa  117  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  41.73 
 
 
213 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  41.67 
 
 
192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  38.73 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  38.18 
 
 
231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  41.35 
 
 
189 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  36.84 
 
 
204 aa  111  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  37.58 
 
 
192 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 
192 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  39.6 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  39.6 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  39.6 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  39.6 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  39.6 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  39.6 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  39.6 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  39.6 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  39.6 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  43.57 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  40.29 
 
 
260 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  37.59 
 
 
208 aa  108  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  37.59 
 
 
208 aa  108  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  42.18 
 
 
171 aa  108  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  41.5 
 
 
186 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  40.82 
 
 
189 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  45.39 
 
 
194 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  41.26 
 
 
194 aa  106  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  41.26 
 
 
179 aa  105  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  37.58 
 
 
210 aa  105  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  35 
 
 
217 aa  105  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 
200 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  35.8 
 
 
206 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  34.92 
 
 
195 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  42.86 
 
 
208 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  34.09 
 
 
206 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  34.09 
 
 
206 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  34.09 
 
 
206 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  40.94 
 
 
207 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  42.36 
 
 
204 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  34.09 
 
 
206 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  34.8 
 
 
195 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  40.14 
 
 
186 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  40.79 
 
 
190 aa  103  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.71 
 
 
189 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  34.91 
 
 
210 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  32.83 
 
 
221 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  37.96 
 
 
191 aa  102  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  34.97 
 
 
190 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  41.67 
 
 
208 aa  102  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  38.51 
 
 
184 aa  102  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  39.35 
 
 
181 aa  102  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  36.81 
 
 
178 aa  102  7e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  35.23 
 
 
206 aa  101  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  35.8 
 
 
181 aa  101  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  37.2 
 
 
222 aa  101  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  33.92 
 
 
187 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  36.56 
 
 
187 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  36.98 
 
 
200 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  45.93 
 
 
203 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  38.36 
 
 
197 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 
195 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  36.67 
 
 
192 aa  101  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  36.31 
 
 
192 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  33.92 
 
 
187 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  36.31 
 
 
192 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  38.03 
 
 
187 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  36.31 
 
 
192 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 
203 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  38.93 
 
 
156 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  29.65 
 
 
226 aa  99.4  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  32.8 
 
 
189 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 
228 aa  99.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  34.59 
 
 
196 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  35.76 
 
 
203 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  35.76 
 
 
206 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  35.23 
 
 
189 aa  99  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  43.36 
 
 
181 aa  99  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  34.92 
 
 
186 aa  99  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  42.65 
 
 
191 aa  98.6  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  43.75 
 
 
172 aa  98.6  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  36.3 
 
 
245 aa  98.6  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  33.54 
 
 
198 aa  98.6  8e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  34.38 
 
 
223 aa  98.6  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  33.74 
 
 
197 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  38.16 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  37.14 
 
 
200 aa  98.2  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>