224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4267 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_4267  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 180 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0981  excinuclease ABC subunit C  51.09 
 
 		 137 aa  110  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0376  excinuclease ABC subunit C  62.22 
 
 		 104 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.604182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1648  excinuclease ABC subunit C  51.61 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.732413  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0811  hypothetical protein  54.12 
 
 		 93 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0782  hypothetical protein  54.12 
 
 		 93 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4258  excinuclease ABC subunit C  54.44 
 
 		 100 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00754458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7672  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.06 
 
 		 104 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3649  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.45 
 
 		 131 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  42.55 
 
 		 107 aa  90.5  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4162  Excinuclease ABC C subunit domain protein  47.83 
 
 		 97 aa  86.3  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3525  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.45 
 
 		 143 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.506874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3514  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.19 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3325  excinuclease ABC subunit C  49.43 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.369654 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2665  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.94 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0964299  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1038  hypothetical protein  48.1 
 
 		 93 aa  77.4  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.67 
 
 		 88 aa  77  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0126  hypothetical protein  37.66 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  45.35 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1867  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.11 
 
 		 80 aa  74.7  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000216284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  41.56 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  41.56 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  45.45 
 
 		 83 aa  74.3  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2851  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.68 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2943  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.68 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3490  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2245  excinuclease ABC subunit C  42.86 
 
 		 108 aa  70.5  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.33 
 
 		 80 aa  70.9  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3752  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.33 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  46.75 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.33 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0452  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.87 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122957  normal  0.760356 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1970  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.56 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.712679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  47.37 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  34.88 
 
 		 90 aa  67  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  39.74 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2084  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.75 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000359134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1525  endonuclease  40.26 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  41.03 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.11 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21070  predicted endonuclease containing a URI domain  38.75 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3763  excinuclease ABC subunit C  42.86 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4370  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 		 84 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  40 
 
 		 97 aa  62  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  40 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4363  excinuclease ABC, C subunit-like protein  48.1 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1312  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.16 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.12439  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1103  excinuclease ABC subunit C  40.7 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0446  excinuclease ABC subunit C  42.11 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4401  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  38.96 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0778  hypothetical protein  35.8 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.68184  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2126  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.23 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5558  excinuclease ABC subunit C  38.16 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0448  excinuclease ABC subunit C  40.54 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3055  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.64 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0682  excinuclease ABC subunit C  31.87 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000227073  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0879  endo/excinuclease domain-containing protein  37.66 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0606  hypothetical protein  32.05 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.383877  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2011  endonuclease  37.97 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000274341  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0080  excinuclease ABC subunit C  38.71 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.76446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  33.75 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4129  excinuclease ABC subunit C  44.87 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0737  endo/excinuclease domain-containing protein  36.36 
 
 		 298 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2276  endo/excinuclease domain-containing protein  36.36 
 
 		 304 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3008  endo/excinuclease domain-containing protein  36.36 
 
 		 334 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.975273  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1079  excinuclease ABC, C subunit, N-terminal  36.36 
 
 		 264 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1589  endo/excinuclease domain-containing protein  36.36 
 
 		 322 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.942614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2278  excinuclease ABC subunit C  40.26 
 
 		 89 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0732686  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3398  hypothetical protein  40.26 
 
 		 116 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3382  excinuclease ABC subunit C  36.9 
 
 		 120 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114521  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3617  putative excinuclease, subunit C  38.89 
 
 		 98 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  37.18 
 
 		 96 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1115  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.96 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0133  excinuclease ABC subunit C  35.9 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5276  GIY-YIG nuclease superfamily protein  36.99 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0145  endonuclease  39.47 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0040  GIY-YIG nuclease superfamily protein  36.99 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.573766  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4762  excinuclease ABC subunit C  37.18 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000128421 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0033  GIY-YIG nuclease superfamily protein  36 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  35.9 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3553  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.47 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.158193 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1238  endo/excinuclease domain-containing protein  35.06 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02157  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.02 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  32.91 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0979  GIY-YIG nuclease superfamily protein  36.71 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2171  excinuclease ABC subunit C  38.67 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000951078 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0675  hypothetical protein  37.66 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  35.9 
 
 		 330 aa  54.7  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0544  excinuclease ABC subunit C  37.04 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0141  excinuclease ABC subunit C  34.62 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0131  excinuclease ABC subunit C  33.75 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3608  GIY-YIG nuclease superfamily protein  37.66 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.942188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0019  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1277  Excinuclease ABC C subunit domain protein  34.09 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.129449  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2226  excinuclease ABC subunit C  37.97 
 
 		 119 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.163339  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0137  excinuclease ABC subunit C  32.05 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0489368 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2824  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 92 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0136  excinuclease ABC subunit C  30.86 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>