More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4225 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4225  histidine kinase  100 
 
 
245 aa  474  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4358  histidine kinase  91.02 
 
 
245 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00933399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4381  histidine kinase  91.43 
 
 
245 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.030036  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4375  histidine kinase  63.03 
 
 
246 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821141  decreased coverage  0.0094806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0819  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.33 
 
 
393 aa  95.5  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  35.66 
 
 
627 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
634 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
634 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
627 aa  92.4  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
492 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  35.43 
 
 
439 aa  89.4  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
638 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
551 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
734 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0941  sensor histidine kinase, putative  31.71 
 
 
248 aa  86.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
631 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4376  histidine kinase  32.37 
 
 
667 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314442  normal  0.0171304 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0914  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
771 aa  87  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
441 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
588 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  34.01 
 
 
369 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
486 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0900  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 
409 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0246  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
573 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 
652 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  35.98 
 
 
634 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
514 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
760 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.808443 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
627 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  36.5 
 
 
621 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2710  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
756 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.438958  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  28.32 
 
 
592 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  35.96 
 
 
626 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0119  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
571 aa  82  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.412791  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1376  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
499 aa  82  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.20257  normal  0.926367 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 
592 aa  82  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2392  histidine kinase  31.68 
 
 
502 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  34.83 
 
 
630 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2216  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
475 aa  81.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
623 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
468 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
364 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1992  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
372 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.834527  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1172  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
450 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2254  histidine kinase  52.75 
 
 
478 aa  80.1  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
621 aa  80.5  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0073  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
505 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  35.47 
 
 
621 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4673  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
713 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  31.58 
 
 
517 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
494 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  34.3 
 
 
659 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
630 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2564  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
559 aa  79.7  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.382353  hitchhiker  0.0000221302 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
635 aa  79.7  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 
801 aa  79.3  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.42 
 
 
695 aa  79.3  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3279  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
608 aa  79  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00154728  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0738  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
991 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000340339 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
491 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2176  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
551 aa  79  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  32.84 
 
 
367 aa  79  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
378 aa  79  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0368  histidine kinase  31.36 
 
 
466 aa  78.6  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99767  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  32.46 
 
 
623 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
571 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2682  histidine kinase  29.2 
 
 
635 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249281 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 
680 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 
635 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
607 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  33.95 
 
 
615 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  30.92 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
567 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
873 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00758089  normal  0.057217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
991 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  hitchhiker  0.0000734254 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  37.93 
 
 
506 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5455  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 
571 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0104043  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1365  histidine kinase  25.21 
 
 
496 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1893  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
985 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.426931  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1844  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 
714 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.257508  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 
619 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2370  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
672 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4771  histidine kinase  37.44 
 
 
624 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.415438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4694  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
991 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000630671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 
933 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 
441 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2841  ATPase domain-containing protein  36.49 
 
 
577 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.274853  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3588  two-component sensor kinase CbrA  33.64 
 
 
984 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.883039 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 
577 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
803 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.623752 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0283  sensor histidine kinase  28.57 
 
 
600 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2824  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
645 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4807  two-component sensor kinase CbrA  34.27 
 
 
982 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0111257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0914  signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51298  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
713 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
622 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>