More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4110 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4110  SugE protein  100 
 
 
106 aa  197  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4261  small multidrug resistance protein  98.11 
 
 
106 aa  193  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4238  small multidrug resistance protein  94.34 
 
 
106 aa  189  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.644322  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00930  cation/cationic drug transporter  71.29 
 
 
122 aa  143  8.000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8161  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 
114 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.32554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8162  transporter  47.57 
 
 
106 aa  90.1  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7227  small multidrug resistance protein  48.28 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3948  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7226  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0570  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 
101 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2659  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188052  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  39.05 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 
104 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  40.2 
 
 
104 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 
105 aa  67.4  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  36.54 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 
105 aa  67  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 
106 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4237  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.492024  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4260  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  35.24 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 
104 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 
104 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0281  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3796  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.38629  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  38.24 
 
 
104 aa  62.8  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1005  sugE protein  37.86 
 
 
104 aa  63.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  34.91 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00910  cation/cationic drug transporter  38.46 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4733  transporter  42.57 
 
 
101 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4109  cation membrane transporter  38.1 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 
105 aa  62  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0100  sugE protein  32.08 
 
 
114 aa  61.6  0.000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 
153 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  35 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  35 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  33.98 
 
 
104 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  33.98 
 
 
104 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  33.64 
 
 
106 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  35.24 
 
 
105 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 
109 aa  60.5  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 
105 aa  60.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 
109 aa  60.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  35.92 
 
 
146 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  35.92 
 
 
146 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  34.95 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  35.29 
 
 
105 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  34.91 
 
 
105 aa  60.1  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54110  transporter  40.59 
 
 
101 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  33.01 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  33.02 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  32.69 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1502  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  33.96 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  32.08 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 
105 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  36.54 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  32.08 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  36.27 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  35.58 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  30.69 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  34.31 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2650  small multidrug resistance protein  34.31 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  37.74 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  34.31 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  36.27 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 
106 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3646  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 
104 aa  57.8  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3601  SugE protein  32.35 
 
 
105 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.51586  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  33.01 
 
 
105 aa  57.4  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2705  small multidrug resistance protein  39.24 
 
 
99 aa  57  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2515  small multidrug resistance protein  33.96 
 
 
105 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.686448  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  33.01 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  32.08 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3825  small multidrug resistance protein  34.95 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  31.13 
 
 
120 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  34.31 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  34.31 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  31.13 
 
 
106 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  34.62 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3008  small multidrug resistance protein  29.52 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>