57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4045 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4188  thiamine biosynthesis protein  98.01 
 
 		 351 aa  693    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329777  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4161  thiamine biosynthesis protein  98.01 
 
 		 351 aa  693    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4045  thiamine biosynthesis protein  100 
 
 		 351 aa  706    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0384  thiamine biosynthesis protein  85.75 
 
 		 351 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.624695  hitchhiker  0.00868448 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1299  thiamine biosynthesis protein  52.76 
 
 		 355 aa  323  2e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.122436  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3145  hypothetical protein  49.69 
 
 		 346 aa  314  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.221645  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0405  thiamine biosynthesis protein  50.47 
 
 		 345 aa  299  5e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1219  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  47.27 
 
 		 354 aa  293  4e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0065  thiamine biosynthesis protein  48.29 
 
 		 334 aa  286  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.96842e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0082  thiamine biosynthesis protein  47.85 
 
 		 334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2654  hypothetical protein  44.19 
 
 		 347 aa  282  7.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00416391  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0434  hypothetical protein  49.52 
 
 		 334 aa  279  5e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4272  thiamine biosynthesis protein  45.85 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3402  thiamine biosynthesis protein  45.58 
 
 		 334 aa  277  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1496  protein of unknown function DUF814  42.86 
 
 		 327 aa  258  9e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1071  thiamine biosynthesis protein  46.34 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324094  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0026  thiamine biosynthesis protein:ExsB  43.64 
 
 		 326 aa  246  3e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1163  hypothetical protein  42.94 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1170  Thiamine biosynthesis protein-like protein  43.87 
 
 		 329 aa  237  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2797  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase  43.58 
 
 		 331 aa  235  9e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000576654  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1061  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase / fibronectin/fibrinogen-binding protein  41.64 
 
 		 329 aa  233  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.391536  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2450  thiamine biosynthesis protein  45.05 
 
 		 352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2184  argininosuccinate synthase  38.05 
 
 		 326 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3219  thiamine biosynthesis protein  43.81 
 
 		 333 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2474  thiamin biosynthesis protein ThiI  37.76 
 
 		 326 aa  226  7e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1725  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  41.21 
 
 		 337 aa  225  9e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0801  ATP-binding protein  42.95 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1992  hypothetical protein  38.81 
 
 		 349 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1746  thiamine biosynthesis protein:ExsB  38.04 
 
 		 329 aa  219  6e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1805  hypothetical protein  40.76 
 
 		 327 aa  219  7.999999999999999e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1624  hypothetical protein  40.76 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.425475  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1498  hypothetical protein  38.84 
 
 		 327 aa  216  4e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2769  hypothetical protein  39.4 
 
 		 325 aa  216  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778027  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1979  thiamine biosynthesis protein:ExsB  40.32 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2075  thiamine biosynthesis protein:ExsB  44.24 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1609  thiamine biosynthesis protein:ExsB  40.76 
 
 		 327 aa  204  3e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1904  thiamine biosynthesis protein  39.71 
 
 		 368 aa  192  8e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0309  hypothetical protein  38.54 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0875  thiamine biosynthesis protein  40.61 
 
 		 368 aa  186  5e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.408938 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0292  thiamine biosynthesis protein  40.79 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000151674  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2372  hypothetical protein  42.38 
 
 		 357 aa  182  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000114865  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3179  thiamine biosynthesis protein  41.96 
 
 		 357 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1938  hypothetical protein  31.68 
 
 		 212 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.186563  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1718  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  30.6 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.530012  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1987  hypothetical protein  30 
 
 		 213 aa  50.1  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1858  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  31.58 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000793578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  28.67 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0737  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyltransferase  25 
 
 		 353 aa  47.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0367  hypothetical protein  25.51 
 
 		 404 aa  47  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0401  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  33.33 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00780363  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0464  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  31.37 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000807441  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  31.91 
 
 		 237 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  29.41 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0417  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  32.38 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000611049  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  21.6 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1249  hypothetical protein  27.64 
 
 		 302 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  19.31 
 
 		 383 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>