219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4012 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4154  putative RNA methylase  97.67 
 
 
387 aa  711  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4012  putative RNA methylase  100 
 
 
387 aa  759  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4128  putative RNA methylase  97.42 
 
 
387 aa  709  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0412  putative RNA methylase  79.84 
 
 
382 aa  562  1e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  44.82 
 
 
375 aa  314  2e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.18402e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  44.19 
 
 
376 aa  302  5e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  44.19 
 
 
376 aa  302  6e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  45.08 
 
 
389 aa  300  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  44.82 
 
 
391 aa  295  9e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  40.83 
 
 
393 aa  277  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  44 
 
 
713 aa  273  4e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  40.57 
 
 
393 aa  273  4e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  37.56 
 
 
375 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  37.56 
 
 
375 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2090  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.32 
 
 
725 aa  252  7e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  38.6 
 
 
375 aa  246  7e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00510  predicted N6-adenine-specific DNA methylase  41.94 
 
 
729 aa  244  2e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.563195  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  34.72 
 
 
385 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0249  putative RNA methylase  36.69 
 
 
374 aa  240  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0789594  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  39.53 
 
 
374 aa  240  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.62 
 
 
738 aa  238  9e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00768  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.05 
 
 
711 aa  235  1e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192916  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.51 
 
 
749 aa  234  2e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0579  putative RNA methylase  39.8 
 
 
430 aa  234  2e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3009  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.03 
 
 
725 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30746  hitchhiker  1.88031e-11 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1615  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.85 
 
 
730 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  5.68261e-05 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1608  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.85 
 
 
730 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0282  putative RNA methylase:THUMP  36.01 
 
 
380 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377639  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2096  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.6 
 
 
730 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  36.36 
 
 
399 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3643  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.6 
 
 
730 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.698608 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2108  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.19 
 
 
750 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.949067  decreased coverage  0.00266929 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1699  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.41 
 
 
722 aa  226  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18930  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.1 
 
 
738 aa  226  5e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2311  methylase, putative  38.93 
 
 
762 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9895  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0683  putative RNA methylase  35.47 
 
 
426 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  38.18 
 
 
387 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4180  putative RNA methylase  39.42 
 
 
440 aa  223  5e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1322  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.24 
 
 
712 aa  222  1e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0919587 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2495  putative RNA methylase  33.33 
 
 
387 aa  221  1e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1788  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.99 
 
 
756 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3378  THUMP domain-containing protein  39.58 
 
 
430 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.270297  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0288  THUMP domain-containing protein  39.58 
 
 
430 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.53 
 
 
721 aa  219  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1150  THUMP domain-containing protein  39.58 
 
 
430 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2557  THUMP domain-containing protein  39.58 
 
 
430 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3387  N6-adenine-specific DNA methylase  39.58 
 
 
430 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2374  THUMP domain-containing protein  39.58 
 
 
430 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0339  putative RNA methylase  35.96 
 
 
437 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.179905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3344  THUMP domain-containing protein  39.31 
 
 
430 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615958  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0350  putative RNA methylase  35.96 
 
 
440 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.69 
 
 
699 aa  218  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0422  putative RNA methylase  34.89 
 
 
441 aa  217  3e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2537  putative RNA methylase  37.02 
 
 
425 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03361  RNA methylase family protein  35.31 
 
 
374 aa  216  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00591  RNA methylase family protein  33.93 
 
 
374 aa  215  1e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1265  THUMP domain-containing protein  38.4 
 
 
430 aa  214  3e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0499  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.6 
 
 
734 aa  214  3e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.639423  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.69 
 
 
712 aa  213  6e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01161  RNA methylase family protein  31.11 
 
 
374 aa  213  6e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3255  RNA methylase family protein  32.11 
 
 
392 aa  212  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710684  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.22 
 
 
708 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1649  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.29 
 
 
705 aa  210  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0688  putative RNA methylase  40.97 
 
 
734 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0808112 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0623  putative RNA methylase  36.23 
 
 
432 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244531  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.99 
 
 
711 aa  209  7e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1415  putative RNA methylase  31.44 
 
 
374 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.941781  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0598  putative RNA methylase  35.99 
 
 
432 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116947  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2967  putative RNA methylase  36.12 
 
 
419 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2828  putative RNA methylase:THUMP  35.78 
 
 
417 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.76 
 
 
713 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4484  putative RNA methylase  31.92 
 
 
468 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0054  putative RNA methylase  29.46 
 
 
374 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.28 
 
 
701 aa  206  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.76 
 
 
711 aa  206  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.76 
 
 
713 aa  206  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.76 
 
 
713 aa  206  8e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1791  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.91 
 
 
705 aa  205  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0473  putative RNA methylase  34.89 
 
 
413 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2677  putative RNA methylase  36.41 
 
 
432 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0779  putative RNA methylase  34.53 
 
 
428 aa  204  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0429  putative RNA methylase  36.81 
 
 
380 aa  203  4e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000469504  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2424  N6-adenine-specific DNA methylase  35.94 
 
 
398 aa  203  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.25 
 
 
711 aa  203  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0708  putative RNA methylase  35.42 
 
 
434 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2064  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.09 
 
 
705 aa  202  9e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0224  putative RNA methylase  35.42 
 
 
434 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219183  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1680  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.47 
 
 
707 aa  201  1e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.68 
 
 
711 aa  202  1e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0675  putative RNA methylase  35.42 
 
 
434 aa  202  1e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.936037  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0696  putative RNA methylase  35.41 
 
 
433 aa  201  2e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273634  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08561  putative N6-adenine-specific DNA methylase  33.68 
 
 
381 aa  201  2e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3711  putative RNA methylase  36.05 
 
 
471 aa  200  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.770893  normal  0.0760034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.99 
 
 
709 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.68014e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.9 
 
 
711 aa  200  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.74 
 
 
709 aa  200  4e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.99 
 
 
709 aa  200  4e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4003  hypothetical protein  35.75 
 
 
430 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656935  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.74 
 
 
709 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00641  RNA methylase family protein  29.72 
 
 
374 aa  199  7e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>