More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3846 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3958  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  85.71 
 
 
489 aa  855    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3846  microcin-processing peptidase 2  100 
 
 
486 aa  983    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  97.74 
 
 
486 aa  970    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  98.15 
 
 
486 aa  972    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.81 
 
 
491 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  43.92 
 
 
475 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  45.83 
 
 
481 aa  375  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  45.3 
 
 
481 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0472  TldD protein  43.99 
 
 
485 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0623925  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  43.53 
 
 
479 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  45.86 
 
 
481 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  42.8 
 
 
481 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0412  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.99 
 
 
485 aa  368  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.140999  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.53 
 
 
479 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.34 
 
 
479 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.05 
 
 
480 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.32 
 
 
479 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  42.52 
 
 
483 aa  365  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  44.67 
 
 
491 aa  363  3e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  43.04 
 
 
481 aa  362  7.0000000000000005e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.8 
 
 
486 aa  362  8e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  42.09 
 
 
481 aa  361  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  40.26 
 
 
480 aa  360  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  41.97 
 
 
486 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.06 
 
 
496 aa  360  3e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  40.26 
 
 
480 aa  360  3e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  42.34 
 
 
498 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0850  microcin-processing peptidase 2  42.46 
 
 
486 aa  360  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.140051 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3399  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.11 
 
 
508 aa  360  5e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.700717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2956  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.2 
 
 
486 aa  359  5e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1778  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.16 
 
 
496 aa  359  6e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  43.8 
 
 
481 aa  359  6e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.8 
 
 
481 aa  359  6e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  42.7 
 
 
481 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3646  microcin-processing peptidase 2  41.38 
 
 
486 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  41.65 
 
 
481 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0991  microcin-processing peptidase 2  41.7 
 
 
486 aa  358  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1487  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.95 
 
 
486 aa  357  2.9999999999999997e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  44.49 
 
 
481 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  40.69 
 
 
481 aa  356  5.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  44.71 
 
 
480 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  42.73 
 
 
484 aa  355  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1496  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.52 
 
 
496 aa  355  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.768084  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.7 
 
 
477 aa  355  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0939  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.4 
 
 
487 aa  353  2.9999999999999997e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.86 
 
 
480 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1986  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.23 
 
 
480 aa  353  4e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.312145  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  40.91 
 
 
481 aa  353  5e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002390  TldD protein probably a protease  42.06 
 
 
481 aa  352  8e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  43.68 
 
 
480 aa  352  8e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.45 
 
 
487 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.49 
 
 
481 aa  352  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1145  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.7 
 
 
481 aa  352  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.85 
 
 
490 aa  351  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.25 
 
 
479 aa  349  6e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  40.91 
 
 
481 aa  349  7e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0845  microcin-processing peptidase 2  43.68 
 
 
480 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2490  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.03 
 
 
487 aa  348  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  40.91 
 
 
477 aa  347  2e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3681  protease TldD  40.25 
 
 
481 aa  346  5e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  40.98 
 
 
490 aa  345  8e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.59 
 
 
486 aa  345  8e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0276  microcin-processing peptidase 2  40.04 
 
 
482 aa  345  8e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  40.77 
 
 
481 aa  345  1e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  41.43 
 
 
481 aa  345  1e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1093  microcin-processing peptidase 2  41.85 
 
 
493 aa  345  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0405  protease TldD  41.43 
 
 
481 aa  345  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0472  protease TldD  41.43 
 
 
481 aa  345  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696737  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3972  microcin-processing peptidase 2  41.97 
 
 
488 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  40.72 
 
 
477 aa  343  2.9999999999999997e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  42.42 
 
 
481 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0726  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.54 
 
 
488 aa  343  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.571248 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1129  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.65 
 
 
481 aa  343  5e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00884663  normal  0.442465 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  41.83 
 
 
481 aa  343  5e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2043  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.28 
 
 
486 aa  343  5.999999999999999e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3769  TldD protein  42.95 
 
 
487 aa  342  7e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162647  normal  0.0283692 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  40.43 
 
 
481 aa  342  9e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.43 
 
 
481 aa  342  9e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  40.43 
 
 
481 aa  342  9e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  40.43 
 
 
481 aa  342  9e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  40.43 
 
 
481 aa  342  9e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  40.43 
 
 
481 aa  342  9e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12720  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  43.53 
 
 
480 aa  342  9e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.437341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  40.43 
 
 
481 aa  342  9e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.33 
 
 
488 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  40.43 
 
 
481 aa  339  5e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  42.37 
 
 
479 aa  338  9e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000206078  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3631  protease TldD  40 
 
 
481 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0205399 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0512  putative modulator of DNA gyrase  43.51 
 
 
490 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  40 
 
 
481 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  40 
 
 
481 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  40 
 
 
481 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.85 
 
 
462 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  39.79 
 
 
481 aa  336  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.46 
 
 
490 aa  336  5.999999999999999e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2337  tldD protein  41.49 
 
 
498 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3334  tldD protein  41.49 
 
 
498 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0488  tldD protein  41.49 
 
 
498 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3323  TldD/PmbA family protein  41.49 
 
 
498 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2218  TldD/PmbA family protein  41.49 
 
 
498 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.762939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>