More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3830 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  97.91 
 
 
396 aa  736  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  97.91 
 
 
396 aa  736  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  86.74 
 
 
388 aa  642  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  100 
 
 
383 aa  763  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  56.35 
 
 
405 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  43.26 
 
 
386 aa  348  1e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.39 
 
 
387 aa  256  4e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.23 
 
 
385 aa  233  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.96 
 
 
388 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  36.8 
 
 
382 aa  229  7e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.32 
 
 
390 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2485  succinyldiaminopimelate transaminase  38.74 
 
 
400 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  35.48 
 
 
388 aa  217  3e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  35.15 
 
 
390 aa  217  3e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  36.92 
 
 
400 aa  215  1e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  35.69 
 
 
388 aa  214  2e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  4.00869e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  35.29 
 
 
388 aa  214  3e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  34.05 
 
 
389 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  37.43 
 
 
388 aa  209  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  40.23 
 
 
359 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  42.86 
 
 
363 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  42.65 
 
 
359 aa  207  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  35.69 
 
 
403 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  42.27 
 
 
368 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  33.67 
 
 
407 aa  204  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  33.88 
 
 
385 aa  203  5e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  36.94 
 
 
398 aa  202  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  36.27 
 
 
382 aa  202  9e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  33.24 
 
 
392 aa  201  1e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1491  succinyldiaminopimelate transaminase  37.07 
 
 
398 aa  201  2e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.997861  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.89 
 
 
391 aa  200  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  36.49 
 
 
382 aa  200  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  33.33 
 
 
400 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  34.25 
 
 
402 aa  199  8e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0132  aminotransferase  35.54 
 
 
404 aa  198  1e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926406  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2515  succinyldiaminopimelate transaminase  35.07 
 
 
407 aa  198  1e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  35.41 
 
 
392 aa  198  2e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  35.37 
 
 
382 aa  197  2e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0044  succinyldiaminopimelate transaminase  33.42 
 
 
405 aa  197  2e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.47 
 
 
391 aa  197  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1889  succinyldiaminopimelate transaminase  37.89 
 
 
404 aa  197  4e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  33.07 
 
 
390 aa  197  4e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.1377e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.62 
 
 
389 aa  197  4e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3617  succinyldiaminopimelate transaminase  34.84 
 
 
401 aa  196  5e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115899  normal  0.0503817 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2066  succinyldiaminopimelate transaminase  37.61 
 
 
404 aa  196  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.595829 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  32.55 
 
 
388 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  34.04 
 
 
391 aa  196  8e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2061  succinyldiaminopimelate transaminase  35.77 
 
 
387 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1930  succinyldiaminopimelate transaminase  35.77 
 
 
420 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1143  succinyldiaminopimelate transaminase  34.11 
 
 
399 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385883  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.4 
 
 
370 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0082  aminotransferase, class I and II  35.91 
 
 
423 aa  193  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4085  succinyldiaminopimelate transaminase  33.94 
 
 
398 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  32.42 
 
 
401 aa  193  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  35.85 
 
 
399 aa  192  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  32.15 
 
 
399 aa  192  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5101  succinyldiaminopimelate transaminase  33.06 
 
 
390 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.26447 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2029  succinyldiaminopimelate transaminase  34.09 
 
 
410 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2048  succinyldiaminopimelate transaminase  34.09 
 
 
410 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0555  succinyldiaminopimelate transaminase  33.78 
 
 
409 aa  192  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147864 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6048  succinyldiaminopimelate transaminase  34.09 
 
 
410 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  38.79 
 
 
365 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  35.6 
 
 
409 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  32.7 
 
 
392 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2466  succinyldiaminopimelate transaminase  35 
 
 
405 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138526 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5338  succinyldiaminopimelate transaminase  34.09 
 
 
410 aa  190  3e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1588  succinyldiaminopimelate transaminase  33.85 
 
 
398 aa  191  3e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133702  normal  0.347765 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  33.88 
 
 
397 aa  190  3e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1267  succinyldiaminopimelate transaminase  34.17 
 
 
399 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589506  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  38.9 
 
 
379 aa  190  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  33.33 
 
 
399 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1813  succinyldiaminopimelate transaminase  35 
 
 
402 aa  189  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1671  succinyldiaminopimelate transaminase  35.15 
 
 
405 aa  189  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4189  succinyldiaminopimelate transaminase  33.59 
 
 
398 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.199864  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  33.89 
 
 
399 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1248  succinyldiaminopimelate transaminase  35.79 
 
 
410 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0393  succinyldiaminopimelate transaminase  32.16 
 
 
408 aa  187  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0439  succinyldiaminopimelate transaminase  32.35 
 
 
412 aa  187  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  32.24 
 
 
394 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  32.24 
 
 
394 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0089  aminotransferase, class I and II  35.26 
 
 
423 aa  187  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.789487  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  38.78 
 
 
368 aa  187  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  39.02 
 
 
376 aa  186  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  33.85 
 
 
398 aa  186  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  34.57 
 
 
391 aa  186  7e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  35.23 
 
 
387 aa  186  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  31.91 
 
 
388 aa  186  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  32.61 
 
 
399 aa  186  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.57199e-05 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  34.07 
 
 
417 aa  186  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2551  aminotransferase, class I and II  33.89 
 
 
400 aa  185  9e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138065  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  33.16 
 
 
384 aa  185  9e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  38.89 
 
 
396 aa  185  1e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39020  succinyldiaminopimelate transaminase  34.96 
 
 
398 aa  185  1e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0524021  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  33.07 
 
 
397 aa  185  1e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1424  succinyldiaminopimelate transaminase  35.54 
 
 
410 aa  184  2e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000365494  normal  0.0284066 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  33.33 
 
 
399 aa  184  2e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  32.35 
 
 
399 aa  184  2e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.95 
 
 
433 aa  184  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  34.75 
 
 
399 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2047  succinyldiaminopimelate transaminase  34.05 
 
 
409 aa  183  4e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>