More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3808 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  100 
 
 
163 aa  322  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  95.09 
 
 
161 aa  251  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  93.25 
 
 
161 aa  248  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  87.86 
 
 
156 aa  217  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  58.77 
 
 
176 aa  144  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  45.68 
 
 
151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  45.05 
 
 
177 aa  137  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  55.36 
 
 
201 aa  136  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  57.26 
 
 
151 aa  134  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  59.83 
 
 
171 aa  134  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  59.83 
 
 
178 aa  134  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  59.83 
 
 
178 aa  134  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  59.83 
 
 
178 aa  134  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  59.83 
 
 
178 aa  134  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  59.83 
 
 
178 aa  134  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  59.32 
 
 
178 aa  134  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  59.83 
 
 
178 aa  134  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  59.83 
 
 
178 aa  134  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  59.83 
 
 
178 aa  134  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  54.07 
 
 
172 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  53.85 
 
 
236 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  53.57 
 
 
238 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  53.85 
 
 
234 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  53.85 
 
 
234 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  53.85 
 
 
234 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  64.71 
 
 
182 aa  131  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  46.71 
 
 
168 aa  132  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  45.71 
 
 
173 aa  131  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  64.71 
 
 
182 aa  131  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  64.71 
 
 
182 aa  131  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  53.15 
 
 
236 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  46.59 
 
 
188 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  53.04 
 
 
222 aa  130  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  50.75 
 
 
190 aa  130  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  55.36 
 
 
242 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  58.49 
 
 
186 aa  130  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  62.75 
 
 
182 aa  130  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  43.86 
 
 
163 aa  130  9e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  65.31 
 
 
176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  65.31 
 
 
176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  58.93 
 
 
183 aa  129  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  47.85 
 
 
152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  65.31 
 
 
176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  65.31 
 
 
176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  58.49 
 
 
155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  56.6 
 
 
220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  65.31 
 
 
176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  53.98 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  53.51 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  60.78 
 
 
180 aa  129  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  47.53 
 
 
154 aa  128  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  54.39 
 
 
163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  56.6 
 
 
231 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  56.6 
 
 
225 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  61 
 
 
165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  43.36 
 
 
149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  61.39 
 
 
178 aa  127  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  42.51 
 
 
158 aa  127  6e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  55.66 
 
 
160 aa  127  6e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  43.21 
 
 
154 aa  127  6e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  51.49 
 
 
231 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  57.55 
 
 
167 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  42.38 
 
 
158 aa  127  9.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  55.28 
 
 
222 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  62.38 
 
 
236 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  41.32 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  61.76 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  57.55 
 
 
183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  44.71 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  57.55 
 
 
200 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  61.76 
 
 
180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  62.38 
 
 
236 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  62.38 
 
 
235 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  45.73 
 
 
160 aa  125  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  54.72 
 
 
181 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  55.66 
 
 
181 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  62 
 
 
176 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  61.39 
 
 
234 aa  125  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 
175 aa  125  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  54.72 
 
 
169 aa  124  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  41.76 
 
 
184 aa  124  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  38.89 
 
 
172 aa  124  7e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  56.76 
 
 
181 aa  124  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  55.66 
 
 
196 aa  123  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  40.21 
 
 
180 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  48.15 
 
 
147 aa  123  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  54.78 
 
 
167 aa  123  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  41.67 
 
 
174 aa  123  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  47.33 
 
 
130 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  47.33 
 
 
130 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  54.72 
 
 
175 aa  122  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  46.01 
 
 
164 aa  123  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  60.61 
 
 
180 aa  123  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  55.66 
 
 
179 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  44.58 
 
 
157 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  58.82 
 
 
181 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  41.98 
 
 
157 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  55.66 
 
 
177 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  56.6 
 
 
183 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  56.6 
 
 
184 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>