More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3565 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 209 aa  414  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  96.17 
 
 		 209 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  95.69 
 
 		 209 aa  381  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  75.77 
 
 		 209 aa  289  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  43.16 
 
 		 204 aa  145  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  41.9 
 
 		 188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  41.5 
 
 		 198 aa  138  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  42.35 
 
 		 208 aa  137  7.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  39.02 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4513  Lytic transglycosylase catalytic  42.63 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  41.08 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  41.36 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  41.85 
 
 		 216 aa  128  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  41.85 
 
 		 221 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  38.16 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  43.26 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  38.91 
 
 		 292 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 300 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  40.78 
 
 		 295 aa  124  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  39.68 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  37.91 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  39.69 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  35.03 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  50.77 
 
 		 146 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.76 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  41.15 
 
 		 203 aa  121  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  39.9 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5084  lytic transglycosylase catalytic  39.91 
 
 		 290 aa  121  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0436378  normal  0.0244706 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  39.25 
 
 		 279 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  40.91 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  37.02 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  39.25 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  38.32 
 
 		 260 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  40.11 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  42.35 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  38.42 
 
 		 239 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  38.42 
 
 		 239 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.38 
 
 		 239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  38.5 
 
 		 281 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  38.42 
 
 		 239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  52.89 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  39.01 
 
 		 258 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  38.31 
 
 		 249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  46.94 
 
 		 206 aa  114  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  47.55 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  45.67 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  48.8 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  47.97 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  41.56 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  37.8 
 
 		 284 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  40.13 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  39.78 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  43.31 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  46.67 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  39.78 
 
 		 245 aa  111  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  35.11 
 
 		 215 aa  111  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  48.8 
 
 		 251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  48.8 
 
 		 251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  47.58 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  48.8 
 
 		 251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  52.14 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  39.9 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  39.39 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  45.16 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  43.31 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  42.52 
 
 		 261 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  43.31 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  35.85 
 
 		 280 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  36.65 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  45.83 
 
 		 191 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  52.14 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.25 
 
 		 214 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  41.73 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  51.91 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1133  lytic transglycosylase catalytic  51.28 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  37.69 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  46.61 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  41.73 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  45.16 
 
 		 282 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  47.2 
 
 		 326 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.9 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  47.06 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  49.19 
 
 		 293 aa  104  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  46.83 
 
 		 237 aa  104  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  40.94 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  40.94 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  40.94 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  40.94 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0307  lytic transglycosylase, catalytic  53.64 
 
 		 332 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  47.93 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  44.07 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  45.08 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  48.31 
 
 		 329 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  45 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  37.37 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  47.01 
 
 		 442 aa  102  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  41.21 
 
 		 191 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  56.19 
 
 		 272 aa  101  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  42.34 
 
 		 222 aa  101  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>