257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3442 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3442  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
380 aa  758    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0817  DNA-cytosine methyltransferase  57.29 
 
 
385 aa  401  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0833  DNA-cytosine methyltransferase  57.29 
 
 
385 aa  401  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0472  DNA-cytosine methyltransferase  55.04 
 
 
390 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0352  DNA-cytosine methyltransferase  55.67 
 
 
390 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24513  predicted protein  33.26 
 
 
820 aa  168  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.558259  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_25785  predicted protein  33.18 
 
 
778 aa  155  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00893206 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  32.9 
 
 
315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_25721  predicted protein  30.49 
 
 
848 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.185267  normal  0.216666 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  30.97 
 
 
427 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  32.35 
 
 
490 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  29.63 
 
 
320 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  30.61 
 
 
416 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  23.72 
 
 
324 aa  100  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  31.67 
 
 
437 aa  97.1  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.4 
 
 
451 aa  95.9  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.55 
 
 
328 aa  95.9  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  28.21 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  34.91 
 
 
483 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  29.68 
 
 
727 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  27.74 
 
 
320 aa  94.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  29.69 
 
 
313 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0230  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.98 
 
 
283 aa  94.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  31.21 
 
 
331 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  31.9 
 
 
438 aa  93.6  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  26.6 
 
 
657 aa  93.6  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  35.19 
 
 
423 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  25.4 
 
 
311 aa  92  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  35.19 
 
 
423 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  32.96 
 
 
318 aa  91.3  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  31.33 
 
 
406 aa  90.5  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  26.33 
 
 
329 aa  90.5  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  28.24 
 
 
308 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  32.37 
 
 
313 aa  90.1  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  27.33 
 
 
310 aa  89.4  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  30.43 
 
 
329 aa  89  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  25.23 
 
 
338 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  28.83 
 
 
313 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.71 
 
 
435 aa  87.8  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  34.55 
 
 
389 aa  87  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1017  DNA-cytosine methyltransferase  33.71 
 
 
407 aa  87  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000173246  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  35.4 
 
 
350 aa  87  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  26.43 
 
 
336 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  32 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  35.23 
 
 
419 aa  85.5  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  38.69 
 
 
417 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  31.87 
 
 
327 aa  85.9  0.000000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  31.03 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  32.18 
 
 
345 aa  84  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  25.44 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  30.27 
 
 
413 aa  83.6  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl308  modification methylase Sau3AI (GATC cytosine-specific methyltransferase)  31.98 
 
 
404 aa  82.8  0.00000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00656674  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0330  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.52 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0129199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  27.97 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  25.91 
 
 
417 aa  80.5  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  31.29 
 
 
460 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  31.29 
 
 
460 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  30.51 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  30.43 
 
 
467 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  28.4 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  25.47 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2854  DNA-cytosine methyltransferase  34.1 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  25.55 
 
 
495 aa  77  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2841  DNA-cytosine methyltransferase  26.27 
 
 
719 aa  77  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  32.96 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.98 
 
 
357 aa  75.5  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0061  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.56 
 
 
236 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346771  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  24.78 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  32.95 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  32.6 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1364  DNA methyltransferase  33.78 
 
 
535 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513353  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  32.29 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  23.55 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  31.33 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  24.09 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0393  DNA-cytosine methyltransferase  25.81 
 
 
719 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  34.15 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3182  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.09 
 
 
495 aa  72.8  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  26.86 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.84 
 
 
362 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  27.08 
 
 
323 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0452  DNA-cytosine methyltransferase  33.53 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  hitchhiker  0.00155723 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  34.68 
 
 
428 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  27.36 
 
 
456 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  32.77 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  27.36 
 
 
456 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  29.67 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0557  DNA-cytosine methyltransferase  31.67 
 
 
486 aa  72  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1422  DNA-cytosine methyltransferase  28.13 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0062681  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  34.52 
 
 
426 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  31.95 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  21.82 
 
 
465 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  34.73 
 
 
438 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3372  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.66 
 
 
502 aa  70.1  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1523  DNA-cytosine methyltransferase  26.95 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00206279  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 
632 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  34.32 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1359  site-specific DNA methylase  30.15 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000354899  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  32.39 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 
412 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>