More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3427 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  96.2 
 
 
395 aa  741  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  100 
 
 
395 aa  769  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  96.96 
 
 
395 aa  749  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  80.31 
 
 
393 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  39.25 
 
 
389 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  38.48 
 
 
386 aa  285  1e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  40.86 
 
 
377 aa  283  5e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  37.96 
 
 
386 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  38.98 
 
 
391 aa  280  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  38.69 
 
 
379 aa  277  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  43.09 
 
 
373 aa  276  5e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.96511e-08  decreased coverage  1.76162e-05 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  41.85 
 
 
370 aa  276  7e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  33.6 
 
 
390 aa  273  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  39.52 
 
 
371 aa  267  3e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  41.27 
 
 
390 aa  265  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  8.45672e-07 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  34.99 
 
 
388 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  39.1 
 
 
395 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  38.8 
 
 
403 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  41.62 
 
 
370 aa  259  5e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  38.38 
 
 
403 aa  259  5e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  41.05 
 
 
390 aa  259  6e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  35.92 
 
 
373 aa  259  8e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  35.48 
 
 
373 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  38.04 
 
 
403 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  34.23 
 
 
373 aa  255  8e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  39.73 
 
 
406 aa  255  1e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  36 
 
 
390 aa  254  2e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  35.82 
 
 
389 aa  249  6e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  34.48 
 
 
380 aa  249  6e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  39.3 
 
 
373 aa  249  7e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  43.77 
 
 
380 aa  248  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  36.8 
 
 
395 aa  247  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  32.82 
 
 
398 aa  245  9e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  39.28 
 
 
380 aa  245  1e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  38.71 
 
 
369 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  34.21 
 
 
392 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  39.34 
 
 
378 aa  240  3e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  34.32 
 
 
391 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  34.59 
 
 
391 aa  236  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  33.51 
 
 
391 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  33.78 
 
 
391 aa  235  1e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  33.24 
 
 
391 aa  234  2e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  33.24 
 
 
391 aa  234  2e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  33.24 
 
 
391 aa  234  2e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  41.1 
 
 
811 aa  233  4e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  33.51 
 
 
391 aa  232  7e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  32.63 
 
 
374 aa  232  7e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  34.29 
 
 
395 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  37.87 
 
 
376 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  33.33 
 
 
375 aa  231  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  33.24 
 
 
391 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  37.08 
 
 
387 aa  230  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  38.21 
 
 
380 aa  227  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  38.8 
 
 
851 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  38.56 
 
 
433 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  36.24 
 
 
411 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  36.79 
 
 
389 aa  223  5e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  34.59 
 
 
408 aa  223  5e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  36.2 
 
 
389 aa  222  8e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  40.53 
 
 
388 aa  221  1e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  36.2 
 
 
389 aa  221  2e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  38.02 
 
 
387 aa  221  2e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  36.2 
 
 
389 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  36.2 
 
 
389 aa  221  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  36.2 
 
 
389 aa  220  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  36.2 
 
 
389 aa  220  4e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  36.2 
 
 
389 aa  220  4e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  36.2 
 
 
389 aa  220  4e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  36.18 
 
 
389 aa  220  4e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  43.75 
 
 
849 aa  219  8e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  38.46 
 
 
379 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  41.67 
 
 
388 aa  217  3e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  37.22 
 
 
384 aa  217  3e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  37.27 
 
 
384 aa  214  2e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  36.69 
 
 
375 aa  214  2e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  34.15 
 
 
364 aa  214  2e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  33.42 
 
 
379 aa  213  7e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  42.39 
 
 
366 aa  212  8e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2981  alanine racemase  42.93 
 
 
844 aa  210  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  35.25 
 
 
389 aa  210  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  31.51 
 
 
369 aa  210  4e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.00581e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  36.31 
 
 
834 aa  209  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  31.28 
 
 
378 aa  208  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  36.29 
 
 
384 aa  209  1e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  33.33 
 
 
402 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  36.1 
 
 
434 aa  207  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  29.89 
 
 
399 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  35.54 
 
 
376 aa  207  3e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  34.95 
 
 
441 aa  206  4e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1620  alanine racemase  30.43 
 
 
399 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  37.53 
 
 
382 aa  206  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  37.4 
 
 
383 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  37.4 
 
 
383 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  37.4 
 
 
383 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0203  alanine racemase  36.9 
 
 
365 aa  203  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  31.71 
 
 
402 aa  202  7e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  40.27 
 
 
358 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  36.61 
 
 
375 aa  201  2e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17351  alanine racemase  30.16 
 
 
399 aa  201  2e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  40.16 
 
 
402 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>