67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3163 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3353  hypothetical protein  89.29 
 
 
856 aa  1589    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3279  hypothetical protein  88.47 
 
 
854 aa  1547    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  100 
 
 
857 aa  1762    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  28.11 
 
 
762 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  27.38 
 
 
731 aa  90.5  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  24.41 
 
 
826 aa  87  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  26.42 
 
 
820 aa  84  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  24.59 
 
 
782 aa  74.3  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0409  hypothetical protein  25.4 
 
 
782 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2992  hypothetical protein  26.2 
 
 
781 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.507941  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  25.52 
 
 
758 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3097  hypothetical protein  26.7 
 
 
781 aa  67.8  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  24.79 
 
 
639 aa  65.5  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0438  hypothetical protein  25.38 
 
 
791 aa  65.1  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.398757  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  34.82 
 
 
816 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  23.84 
 
 
885 aa  63.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0437  hypothetical protein  25.28 
 
 
791 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  24.2 
 
 
639 aa  62  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  25.26 
 
 
762 aa  61.6  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  25.95 
 
 
646 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  25.48 
 
 
639 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  25.48 
 
 
639 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  22.49 
 
 
770 aa  60.1  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  21.94 
 
 
893 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  24.49 
 
 
766 aa  58.9  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  24 
 
 
764 aa  58.5  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  37.04 
 
 
898 aa  57.8  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  37.04 
 
 
898 aa  57.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  23.8 
 
 
764 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  24.74 
 
 
895 aa  57  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  37.04 
 
 
898 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  23.8 
 
 
761 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  22.2 
 
 
936 aa  57.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  35.59 
 
 
742 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  23.12 
 
 
714 aa  56.6  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  25.04 
 
 
765 aa  56.2  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  23.6 
 
 
761 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  23.36 
 
 
762 aa  55.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  34.75 
 
 
742 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  35.04 
 
 
742 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  29.19 
 
 
789 aa  53.5  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  23.29 
 
 
639 aa  52.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  28.1 
 
 
788 aa  51.2  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  23.4 
 
 
755 aa  50.8  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  30.07 
 
 
762 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2907  hypothetical protein  23.83 
 
 
793 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  21.82 
 
 
639 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4161  hypothetical protein  23.82 
 
 
785 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0782432 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  23.48 
 
 
639 aa  48.5  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  29.5 
 
 
788 aa  48.1  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  48 
 
 
2851 aa  48.1  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  25.4 
 
 
1111 aa  48.1  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  23.06 
 
 
639 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  28.23 
 
 
789 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  29.41 
 
 
719 aa  47.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  23.27 
 
 
639 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  32.89 
 
 
809 aa  45.8  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  26.53 
 
 
741 aa  45.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  35.44 
 
 
730 aa  45.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  35.44 
 
 
730 aa  45.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  35.44 
 
 
730 aa  45.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  26.19 
 
 
639 aa  45.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  24.55 
 
 
727 aa  45.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  30.47 
 
 
722 aa  44.7  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  40.58 
 
 
2914 aa  44.7  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  34.18 
 
 
735 aa  44.7  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  22.95 
 
 
822 aa  44.7  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>