85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3139 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  37.69 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  35.48 
 
 
204 aa  94.7  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  33.16 
 
 
197 aa  91.3  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.2506e-07 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  33.87 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  81.3  1e-14  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  36.42 
 
 
192 aa  80.5  2e-14  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  27.32 
 
 
217 aa  73.9  1e-12  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  31.28 
 
 
201 aa  72  5e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  38.56 
 
 
197 aa  72  6e-12  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  29.57 
 
 
203 aa  71.2  1e-11  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  33.78 
 
 
205 aa  70.9  1e-11  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  29.03 
 
 
188 aa  70.9  1e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  22.4 
 
 
241 aa  67.4  1e-10  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  30.6 
 
 
196 aa  67.8  1e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  21.26 
 
 
241 aa  67  2e-10  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  30.72 
 
 
198 aa  65.1  7e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  32.46 
 
 
195 aa  65.1  7e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  28.57 
 
 
199 aa  64.7  8e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  33.06 
 
 
204 aa  63.5  2e-09  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  36 
 
 
212 aa  62.8  3e-09  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  27.22 
 
 
212 aa  62.4  4e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  29.21 
 
 
236 aa  62.4  5e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43450  hypothetical protein  32.93 
 
 
242 aa  60.8  1e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140988  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  29.32 
 
 
237 aa  59.7  3e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  25.14 
 
 
199 aa  58.9  4e-08  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  27.68 
 
 
236 aa  59.3  4e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  29.23 
 
 
207 aa  58.2  9e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  39.53 
 
 
206 aa  56.6  2e-07  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  30.3 
 
 
207 aa  57  2e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  29.86 
 
 
236 aa  57  2e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  36.07 
 
 
239 aa  56.2  3e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  29.86 
 
 
214 aa  56.2  3e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  34.11 
 
 
242 aa  55.8  4e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  36.07 
 
 
238 aa  55.8  4e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  32.72 
 
 
221 aa  55.1  6e-07  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  32.73 
 
 
240 aa  55.1  7e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  36.22 
 
 
240 aa  54.7  9e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  27.33 
 
 
209 aa  54.7  9e-07  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  35.25 
 
 
238 aa  54.3  1e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  28.47 
 
 
251 aa  53.5  2e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  32.8 
 
 
194 aa  53.9  2e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  29.82 
 
 
208 aa  53.1  3e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  28.47 
 
 
251 aa  52.8  3e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  33.85 
 
 
201 aa  52  6e-06  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  28.47 
 
 
253 aa  51.6  8e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  29.2 
 
 
191 aa  51.2  9e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  28.65 
 
 
232 aa  49.3  3e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  32.65 
 
 
215 aa  49.3  3e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  31.72 
 
 
210 aa  49.3  4e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  36.56 
 
 
243 aa  48.9  6e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  28.65 
 
 
231 aa  48.5  6e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  26.32 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  3.70009e-07 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  32.17 
 
 
252 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  29.92 
 
 
250 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  32.69 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3078  putative lipoprotein  31.33 
 
 
186 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  31.47 
 
 
256 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  31.47 
 
 
256 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  31.47 
 
 
256 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  31.47 
 
 
252 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  31.47 
 
 
252 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  31.47 
 
 
239 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  28.35 
 
 
207 aa  45.1  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  28.1 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  28.1 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  25.39 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  28.38 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  1.61061e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  29.57 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  23.57 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  4.61465e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0600  hypothetical protein  36.05 
 
 
211 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  normal  0.826922 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  23.57 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.76204e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  23.57 
 
 
187 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.27636e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  23.57 
 
 
187 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.85697e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  23.57 
 
 
187 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.40203e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  32.03 
 
 
202 aa  43.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2075  hypothetical protein  22.75 
 
 
191 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00929812  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  37.21 
 
 
233 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  23.57 
 
 
187 aa  43.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.51515e-06  hitchhiker  2.97897e-06 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  23.57 
 
 
187 aa  42.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  4.2581e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  28.85 
 
 
188 aa  42.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  26.46 
 
 
225 aa  42  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  22.86 
 
 
187 aa  42  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  31.43 
 
 
264 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  25.74 
 
 
187 aa  42  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.82452e-07  normal  0.394753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>