More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3113 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
322 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  97.75 
 
 
322 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  97.2 
 
 
322 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  73.31 
 
 
314 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  56.44 
 
 
325 aa  322  6e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  57.14 
 
 
322 aa  317  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  55.26 
 
 
312 aa  310  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  47.73 
 
 
324 aa  291  8e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  48.73 
 
 
314 aa  288  6e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  49.2 
 
 
319 aa  285  5e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  48.08 
 
 
320 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  50.5 
 
 
319 aa  281  9e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  50.17 
 
 
319 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  49.05 
 
 
333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  56.82 
 
 
247 aa  272  6e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  54.75 
 
 
248 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  48.17 
 
 
308 aa  269  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  57.71 
 
 
255 aa  268  8.999999999999999e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  44.37 
 
 
311 aa  267  2e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  58.11 
 
 
257 aa  267  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  59.03 
 
 
510 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  46.3 
 
 
314 aa  264  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  47.39 
 
 
651 aa  263  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  53.15 
 
 
270 aa  260  2e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  58.85 
 
 
593 aa  256  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  56.82 
 
 
512 aa  255  8e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  43.18 
 
 
307 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  46.15 
 
 
316 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  47.19 
 
 
309 aa  246  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  54.87 
 
 
582 aa  246  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  53.74 
 
 
590 aa  245  8e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  44.81 
 
 
312 aa  245  9e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  51.97 
 
 
599 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  54.59 
 
 
578 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 
350 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  57.08 
 
 
593 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  53.54 
 
 
275 aa  242  5e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  54.3 
 
 
581 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  53.42 
 
 
590 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  52.27 
 
 
580 aa  239  4e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  44.66 
 
 
307 aa  239  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  52.27 
 
 
580 aa  239  5e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  51.52 
 
 
575 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  54.79 
 
 
594 aa  239  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  56.05 
 
 
1106 aa  238  8e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  41.94 
 
 
305 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  44.23 
 
 
307 aa  237  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  52.51 
 
 
578 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  52.51 
 
 
578 aa  237  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  52.51 
 
 
578 aa  236  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  52.51 
 
 
578 aa  237  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  51.34 
 
 
912 aa  237  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  52.51 
 
 
578 aa  237  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  52.51 
 
 
578 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  52.51 
 
 
578 aa  237  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  52.51 
 
 
578 aa  236  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  52.51 
 
 
578 aa  236  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  52.91 
 
 
599 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  53.39 
 
 
585 aa  235  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  42.63 
 
 
314 aa  235  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  50.87 
 
 
579 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  52.49 
 
 
580 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  52.51 
 
 
579 aa  234  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  53.64 
 
 
576 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  50.22 
 
 
578 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  50.22 
 
 
578 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 
578 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  45.02 
 
 
315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  50.22 
 
 
578 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  49.78 
 
 
578 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  51.36 
 
 
589 aa  232  7.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  42.43 
 
 
308 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  39.38 
 
 
335 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  41.61 
 
 
313 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  52.8 
 
 
583 aa  230  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  42.04 
 
 
667 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  42.68 
 
 
323 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  40.51 
 
 
315 aa  229  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  42.62 
 
 
307 aa  229  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  42.67 
 
 
307 aa  229  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  49.56 
 
 
580 aa  229  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  49.56 
 
 
580 aa  229  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  51.13 
 
 
576 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  51.38 
 
 
582 aa  227  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  56.22 
 
 
578 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  50.92 
 
 
583 aa  227  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  42.36 
 
 
323 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  39.09 
 
 
323 aa  226  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  39.87 
 
 
308 aa  226  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  52.05 
 
 
904 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  40.58 
 
 
308 aa  226  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  48.02 
 
 
299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  52.44 
 
 
592 aa  226  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  53.68 
 
 
1171 aa  225  6e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  42.53 
 
 
323 aa  225  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  49.31 
 
 
323 aa  225  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  52.44 
 
 
592 aa  226  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  43.61 
 
 
322 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  47.03 
 
 
255 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  40.52 
 
 
318 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>