37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3059 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3059  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 454 aa  870    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3155  polysaccharide biosynthesis protein  68.94 
 
 		 457 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  33.23 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4598  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2971  O antigen flippase  27 
 
 		 461 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.436606  hitchhiker  0.000000132287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0724  polysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 		 448 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0778  polysaccharide biosynthesis protein  21.05 
 
 		 442 aa  95.9  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.699251  normal  0.0159711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4935  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 		 442 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0311  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.673346  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2844  polysaccharide biosynthesis protein  21.47 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3499  polysaccharide biosynthesis protein  20.39 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  22.46 
 
 		 504 aa  61.6  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2555  polysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 		 513 aa  60.1  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0678  polysaccharide biosynthesis protein  25.44 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0894  hypothetical protein  24.06 
 
 		 522 aa  57  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000463989  hitchhiker  0.00000186641 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 494 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1843  polysaccharide biosynthesis protein  21.61 
 
 		 591 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.12137  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0912  polysaccharide transport protein, putative  23.68 
 
 		 521 aa  54.7  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.798582 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2321  putative O-antigen transporter  19.54 
 
 		 426 aa  53.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0603153  normal  0.0137212 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2213  putative O-antigen transporter  19.54 
 
 		 430 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163882  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13078  putative flippase  21.78 
 
 		 508 aa  51.6  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.402163  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2314  putative O-antigen transporter  19.92 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0335708 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2427  putative O-antigen transporter  19.12 
 
 		 427 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.279606  hitchhiker  0.000454993 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3785  polysaccharide biosynthesis protein  22.42 
 
 		 442 aa  50.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  27.91 
 
 		 504 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2595  polysaccharide biosynthesis protein  26.74 
 
 		 452 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 		 499 aa  47.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  35.48 
 
 		 488 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  35.48 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  30.85 
 
 		 498 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2610  polysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 		 433 aa  45.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151394 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  37.1 
 
 		 488 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  37.1 
 
 		 488 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  37.1 
 
 		 488 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  37.1 
 
 		 488 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  37.1 
 
 		 488 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  33.73 
 
 		 429 aa  43.5  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>