252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2794 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  100 
 
 		 360 aa  671    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  91.67 
 
 		 360 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  91.86 
 
 		 360 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  46.73 
 
 		 369 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  38.2 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  40.57 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  33.49 
 
 		 389 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  37.79 
 
 		 386 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  33.58 
 
 		 365 aa  90.1  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  24.44 
 
 		 486 aa  89.7  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  35.53 
 
 		 554 aa  89.7  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  36.08 
 
 		 219 aa  87.4  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  34.42 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  29.67 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  36.96 
 
 		 569 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  24.92 
 
 		 487 aa  83.2  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  39.21 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  33.77 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  24.92 
 
 		 487 aa  83.2  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  39.26 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  34.43 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  38.26 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  35.14 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  32.37 
 
 		 519 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  40.24 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  39.74 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  35.77 
 
 		 511 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  43.26 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  32.9 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  33.87 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  34.92 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  36.31 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  36.18 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  30.65 
 
 		 523 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  30.43 
 
 		 515 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  32.39 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  36.51 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  32.12 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  39.29 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  35.95 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  35.2 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  34.76 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 376 aa  69.3  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 541 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  31.61 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  35.67 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  36.49 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0904  rhomboid family protein  34.97 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  36.49 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  36.49 
 
 		 289 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  40.35 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  33.33 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  32.98 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  36.13 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  36.84 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  29.82 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  29.9 
 
 		 513 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  32.31 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  39.02 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  34.42 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  33.12 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  29.95 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  32.9 
 
 		 292 aa  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_5543  predicted protein  39.01 
 
 		 141 aa  65.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0202221  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  29.71 
 
 		 236 aa  65.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  45.98 
 
 		 306 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  35.66 
 
 		 625 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  32.69 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  35.66 
 
 		 625 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.66 
 
 		 625 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  37.88 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  32.02 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  29.1 
 
 		 556 aa  64.3  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  32.02 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  29.44 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3651  Rhomboid family protein  41.14 
 
 		 747 aa  63.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.015996 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  34.04 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  34.04 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  35.66 
 
 		 625 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  35.37 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  35.15 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  39.05 
 
 		 579 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  39.33 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  34.56 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  41.74 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  33.33 
 
 		 190 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 205 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 190 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  29.13 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  32.1 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15482  predicted protein  34.97 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  31.91 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  36.99 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48028  predicted protein  36.57 
 
 		 522 aa  60.1  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  33.71 
 
 		 489 aa  59.7  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03630  conserved hypothetical protein  33.79 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1385  Rhomboid family protein  31.45 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  32.5 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0591  peptidase, S54 (rhomboid) family  33.33 
 
 		 625 aa  58.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  29.96 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>