More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2785 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2785  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
534 aa  1055    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  73.84 
 
 
523 aa  759    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2958  AMP-dependent synthetase and ligase  72.87 
 
 
523 aa  739    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  70.13 
 
 
530 aa  705    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 
497 aa  302  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441923  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  35.83 
 
 
520 aa  299  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3111  AMP-dependent synthetase and ligase  42.47 
 
 
418 aa  296  6e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0188419 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  34.93 
 
 
520 aa  294  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1082  AMP-dependent synthetase and ligase  36.02 
 
 
526 aa  294  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  44.31 
 
 
490 aa  293  6e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.92 
 
 
514 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  38.16 
 
 
517 aa  271  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 
511 aa  266  7e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  43.91 
 
 
521 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  35.62 
 
 
514 aa  263  6e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 
521 aa  262  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 
520 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.63 
 
 
512 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 
515 aa  257  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 
538 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  32.23 
 
 
490 aa  254  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  36.56 
 
 
585 aa  253  7e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  34.51 
 
 
512 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3648  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 
519 aa  250  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  33.4 
 
 
522 aa  249  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 
662 aa  249  9e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 
525 aa  249  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.23 
 
 
510 aa  247  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0490  AMP-dependent synthetase and ligase  34.54 
 
 
512 aa  244  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 
512 aa  244  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 
495 aa  239  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2710  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 
507 aa  237  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0406608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 
526 aa  237  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 
583 aa  236  7e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.91 
 
 
510 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.91 
 
 
510 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.06 
 
 
510 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 
502 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.91 
 
 
510 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.91 
 
 
510 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.91 
 
 
510 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.91 
 
 
510 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  34.91 
 
 
505 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.91 
 
 
510 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.8 
 
 
510 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 
509 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.35 
 
 
510 aa  233  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3898  AMP-dependent synthetase and ligase  34.01 
 
 
553 aa  233  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 
561 aa  232  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  31.59 
 
 
577 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0267  long-chain fatty-acid-CoA ligase  38.33 
 
 
492 aa  231  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.250834 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  31.81 
 
 
520 aa  231  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  32.52 
 
 
539 aa  231  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  30.92 
 
 
498 aa  230  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 
511 aa  229  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 
565 aa  228  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 
487 aa  228  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 
583 aa  227  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
492 aa  226  5.0000000000000005e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  34.35 
 
 
521 aa  225  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4746  putative o-succinylbenzoate--CoA synthetase  32.08 
 
 
601 aa  226  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  35.79 
 
 
507 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 
1043 aa  225  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 
512 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  32.23 
 
 
504 aa  225  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  29.16 
 
 
569 aa  225  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 
506 aa  225  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  33.33 
 
 
510 aa  224  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.6 
 
 
585 aa  224  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 
515 aa  224  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 
529 aa  224  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 
532 aa  224  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 
533 aa  224  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 
578 aa  223  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 
590 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  30.11 
 
 
559 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  29.84 
 
 
514 aa  222  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  34.57 
 
 
5154 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2020  AMP-dependent synthetase and ligase  30.64 
 
 
523 aa  221  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.256098 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  29.59 
 
 
564 aa  221  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 
499 aa  221  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.6 
 
 
561 aa  220  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.79 
 
 
563 aa  220  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 
504 aa  220  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  34.55 
 
 
532 aa  220  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.6 
 
 
563 aa  220  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.94 
 
 
527 aa  219  7e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 
843 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 
546 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3804  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 
529 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  28.41 
 
 
496 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  30.22 
 
 
551 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.6 
 
 
561 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 
591 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 
585 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10167  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 
554 aa  218  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2709  AMP-dependent synthetase and ligase  37.68 
 
 
531 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0786644  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0702  putative acyl-CoA synthetase  33.89 
 
 
553 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345543  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 
520 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  33.09 
 
 
553 aa  217  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.647475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>