111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2701 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 440 aa  880    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  95.68 
 
 		 440 aa  753    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  96.14 
 
 		 440 aa  756    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  65.22 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0501  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.9 
 
 		 429 aa  199  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3691  peptidoglycan-binding LysM  30.92 
 
 		 340 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000027016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0530  peptidoglycan-binding LysM  31.3 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2551  LysM domain-containing protein  31.7 
 
 		 335 aa  152  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0889  peptidoglycan-binding LysM  29.86 
 
 		 333 aa  147  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000030411  hitchhiker  0.00000000000323717 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0409  LysM domain-containing protein  30.35 
 
 		 333 aa  144  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000322112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  31.48 
 
 		 335 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  31.52 
 
 		 338 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0044  peptidoglycan-binding LysM  30.35 
 
 		 338 aa  133  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3268  Peptidoglycan-binding LysM  30.28 
 
 		 339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000361142  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3879  peptidoglycan-binding LysM  29.74 
 
 		 430 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0194  peptidoglycan-binding LysM  29.94 
 
 		 383 aa  126  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4640  peptidoglycan-binding LysM  29.48 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2274  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.7 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0056  peptidoglycan-binding LysM  28.2 
 
 		 345 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00210  lysin domain-containing protein  30.61 
 
 		 341 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  30.05 
 
 		 420 aa  124  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0021  hypothetical protein  30.61 
 
 		 341 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156222  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3861  peptidoglycan-binding LysM  27.98 
 
 		 409 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0537  peptidoglycan-binding LysM  30.34 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201658  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2087  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  25.82 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3013  peptidoglycan-binding LysM  29.97 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4687  peptidoglycan-binding LysM  28.35 
 
 		 417 aa  117  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0022  hypothetical protein  29.46 
 
 		 352 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.124597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5114  Peptidoglycan-binding LysM  28.21 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0176  LysM domain protein  28.82 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0018  peptidoglycan-binding LysM  29.06 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2629  peptidoglycan-binding LysM  29.06 
 
 		 338 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.829323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4050  peptidoglycan-binding LysM  26.07 
 
 		 426 aa  113  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.021914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0020  peptidoglycan-binding LysM  28.03 
 
 		 341 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00180  peptidoglycan-binding LysM protein  28.08 
 
 		 341 aa  113  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0309659  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0025  peptidoglycan-binding LysM  26.39 
 
 		 368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0834  peptidoglycan-binding LysM  26.3 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  30.26 
 
 		 395 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  30.26 
 
 		 364 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  26.78 
 
 		 394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3395  Peptidoglycan-binding LysM  25.06 
 
 		 419 aa  110  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  28.17 
 
 		 390 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0021  LysM domain-containing protein  25.51 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  28.94 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  28.57 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  29.97 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2842  LysM domain-containing protein  26.91 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0019  Peptidoglycan-binding LysM  28.45 
 
 		 349 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0018  LysM domain protein  28.45 
 
 		 349 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00390  hypothetical protein  26.16 
 
 		 364 aa  101  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002058  LysM domain-containing protein  27.09 
 
 		 364 aa  99  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2519  hypothetical protein  28.45 
 
 		 345 aa  97.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0077  peptidoglycan-binding LysM  24.86 
 
 		 360 aa  97.1  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2136  hypothetical protein  26.57 
 
 		 377 aa  96.7  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0020  peptidoglycan-binding LysM  24.05 
 
 		 343 aa  96.7  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0033  LysM domain-containing protein  27.22 
 
 		 378 aa  96.3  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2649  hypothetical protein  28.45 
 
 		 345 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0032  peptidoglycan-binding LysM  26.11 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2464  peptidoglycan-binding LysM  25.22 
 
 		 377 aa  94.4  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0033  peptidoglycan-binding LysM  26.11 
 
 		 376 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0025  peptidoglycan-binding LysM  26.35 
 
 		 374 aa  94.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0028  peptidoglycan-binding LysM  26.11 
 
 		 376 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0032  Peptidoglycan-binding LysM  26.03 
 
 		 376 aa  93.6  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235775 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  24.92 
 
 		 350 aa  92.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2472  hypothetical protein  26.65 
 
 		 391 aa  92.8  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0076  putative cell wall degradation enzyme  26.69 
 
 		 353 aa  92.8  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0024  peptidoglycan-binding LysM  27.72 
 
 		 359 aa  91.3  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  63.46 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  27.6 
 
 		 349 aa  88.6  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0025  peptidoglycan-binding LysM  56.25 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0028  peptidoglycan-binding LysM  56.25 
 
 		 374 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0036  peptidoglycan-binding LysM  56.25 
 
 		 374 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243599 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0036  peptidoglycan-binding LysM  26.58 
 
 		 367 aa  87.8  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971795  normal  0.107314 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  24.93 
 
 		 358 aa  87.4  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0030  peptidoglycan-binding LysM  26.39 
 
 		 374 aa  87.4  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04054  LysM domain protein  65.31 
 
 		 366 aa  87  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3735  peptidoglycan-binding LysM  54.69 
 
 		 365 aa  87  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.315042  hitchhiker  0.00230648 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0044  LysM domain-containing protein  57.14 
 
 		 346 aa  86.3  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.764087  normal  0.149636 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0032  peptidoglycan-binding LysM  53.12 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0039  peptidoglycan-binding LysM  54.69 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.357546 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1930  hypothetical protein  48.44 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00023  Peptidoglycan-binding LysM  58.33 
 
 		 367 aa  75.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.574097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1866  peptidoglycan-binding LysM  46.88 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2915  Peptidoglycan-binding LysM  42.25 
 
 		 566 aa  53.9  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  36.71 
 
 		 935 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0662  putative cell wall turnover protein  44.23 
 
 		 185 aa  47.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1910  peptidoglycan-binding LysM  42.31 
 
 		 382 aa  47.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2281  LysM domain-containing protein  40.82 
 
 		 357 aa  46.6  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0169093  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3277  lysM domain-containing protein  42.55 
 
 		 235 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  35.29 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0582  Peptidoglycan-binding LysM  41.51 
 
 		 193 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.628153  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  39.58 
 
 		 166 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0326  LysM domain protein  36.36 
 
 		 377 aa  45.8  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0219877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  40.91 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  40.82 
 
 		 143 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4808  Peptidoglycan-binding LysM  36.51 
 
 		 235 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  39.66 
 
 		 543 aa  43.9  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2785  LysM domain/BON superfamily protein  35.82 
 
 		 149 aa  43.5  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.267708 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02521  hypothetical protein  35.82 
 
 		 149 aa  43.1  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2800  LysM domain/BON superfamily protein  35.82 
 
 		 149 aa  43.1  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>