More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2493 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  98.43 
 
 
446 aa  868    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  80.41 
 
 
440 aa  687    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  98.88 
 
 
446 aa  872    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
446 aa  884    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  42.2 
 
 
443 aa  327  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  44.05 
 
 
434 aa  319  6e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  43.03 
 
 
434 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  41.49 
 
 
458 aa  315  9e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  40.95 
 
 
438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  41.23 
 
 
434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  40.09 
 
 
434 aa  312  9e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  40.05 
 
 
434 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  41.47 
 
 
434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  41.47 
 
 
421 aa  307  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  42.54 
 
 
436 aa  301  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  41.81 
 
 
436 aa  301  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  40.05 
 
 
454 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  36.6 
 
 
441 aa  294  2e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  42.79 
 
 
436 aa  291  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  38.86 
 
 
443 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  41.57 
 
 
446 aa  291  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  38.17 
 
 
450 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  37.73 
 
 
443 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  38.53 
 
 
458 aa  287  2.9999999999999996e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  40.24 
 
 
432 aa  285  9e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  39.95 
 
 
461 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  40.85 
 
 
442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  39.23 
 
 
420 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  39.72 
 
 
440 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  36.19 
 
 
464 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  42.25 
 
 
442 aa  282  9e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  40.34 
 
 
430 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  40.28 
 
 
443 aa  278  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  37.62 
 
 
432 aa  277  3e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  36.41 
 
 
432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  36.3 
 
 
464 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  38.13 
 
 
416 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  39.8 
 
 
434 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  39.8 
 
 
434 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  39.8 
 
 
434 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  39.8 
 
 
434 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  39.8 
 
 
434 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  39.51 
 
 
432 aa  270  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  38.65 
 
 
428 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  38.96 
 
 
432 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  39.21 
 
 
432 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  39.23 
 
 
432 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  37.92 
 
 
451 aa  268  1e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  39.23 
 
 
432 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  38.41 
 
 
428 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  38.04 
 
 
418 aa  267  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  40.28 
 
 
398 aa  268  2e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  38.01 
 
 
429 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  38.71 
 
 
432 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  38.71 
 
 
432 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  38.46 
 
 
432 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  39.95 
 
 
441 aa  266  5.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  39.95 
 
 
427 aa  264  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  36.78 
 
 
429 aa  263  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  38.21 
 
 
432 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  36.75 
 
 
414 aa  262  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  37.72 
 
 
432 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  35 
 
 
420 aa  259  7e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  38.42 
 
 
449 aa  259  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  35.32 
 
 
465 aa  258  2e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  33.57 
 
 
434 aa  258  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2065  glutamyl-tRNA reductase  34.93 
 
 
431 aa  257  3e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  35.15 
 
 
420 aa  256  5e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  35.61 
 
 
444 aa  256  6e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  35.85 
 
 
444 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  35.61 
 
 
444 aa  256  6e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  35.61 
 
 
444 aa  256  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  34.99 
 
 
426 aa  255  9e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  40.3 
 
 
443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  40.3 
 
 
443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  34.48 
 
 
444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3200  glutamyl-tRNA reductase  38.98 
 
 
450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  35.61 
 
 
444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  35.61 
 
 
444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  35.61 
 
 
444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  35.61 
 
 
444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  35.61 
 
 
444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  37.17 
 
 
446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0118  glutamyl-tRNA reductase  34.87 
 
 
413 aa  253  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000526977  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  37.71 
 
 
421 aa  253  6e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  39.85 
 
 
422 aa  252  8.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2492  glutamyl-tRNA reductase  36.21 
 
 
416 aa  251  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.59007  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  38.19 
 
 
428 aa  252  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  32.94 
 
 
426 aa  251  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  34.99 
 
 
419 aa  252  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2900  glutamyl-tRNA reductase  37.85 
 
 
435 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  38.32 
 
 
434 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  38.8 
 
 
424 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  34.32 
 
 
423 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  34.81 
 
 
443 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1845  glutamyl-tRNA reductase  41.02 
 
 
445 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.346182 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  35.25 
 
 
418 aa  250  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0894  glutamyl-tRNA reductase  35.24 
 
 
423 aa  250  4e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  38.43 
 
 
446 aa  249  6e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2797  glutamyl-tRNA reductase  36.92 
 
 
435 aa  249  9e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>