110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2402 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2402  nitrous-oxide reductase  100 
 
 		 620 aa  1269    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00162507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0244  nitrous-oxide reductase  87.12 
 
 		 647 aa  1097    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1803  nitrous-oxide reductase  59.53 
 
 		 648 aa  768    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.625051  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1461  Nitrous-oxide reductase  97.42 
 
 		 620 aa  1196    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0209  Nitrous-oxide reductase  58.45 
 
 		 632 aa  701    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1556  Nitrous-oxide reductase  97.26 
 
 		 620 aa  1196    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.298548  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  48.05 
 
 		 663 aa  538  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0693  Nitrous-oxide reductase  44.12 
 
 		 658 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1571  cytochrome c oxidase, subunit II  41.84 
 
 		 760 aa  486  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1575  cytochrome c oxidase, subunit II  41.84 
 
 		 760 aa  486  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1729  methyl-accepting chemotaxis protein  42.41 
 
 		 862 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.371209  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0010  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.07 
 
 		 863 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0271061  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1770  nitrous-oxide reductase NosZ  41.92 
 
 		 864 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  42.03 
 
 		 865 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0440  nitrous-oxide reductase  40.73 
 
 		 864 aa  449  1.0000000000000001e-124  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.136119  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1928  nitrous-oxide reductase  37.74 
 
 		 673 aa  414  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1165  nitrous-oxide reductase  38.32 
 
 		 699 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.804263  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2861  nitrous-oxide reductase  34.39 
 
 		 645 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0428  nitrous-oxide reductase  34.21 
 
 		 649 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.859318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3142  nitrous-oxide reductase  35.02 
 
 		 648 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2351  nitrous-oxide reductase  33.33 
 
 		 645 aa  350  5e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1389  nitrous-oxide reductase  36.49 
 
 		 646 aa  349  8e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0275  nitrous-oxide reductase  35.87 
 
 		 639 aa  348  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.275953  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3078  nitrous-oxide reductase  35.68 
 
 		 631 aa  348  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6008  nitrous-oxide reductase  35.5 
 
 		 639 aa  348  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180938  normal  0.0225703 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3400  nitrous-oxide reductase  36.02 
 
 		 628 aa  347  3e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4346  nitrous-oxide reductase  35.7 
 
 		 638 aa  346  6e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0394445  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2219  nitrous-oxide reductase  34.87 
 
 		 628 aa  345  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000181055  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1074  nitrous-oxide reductase  35.18 
 
 		 640 aa  345  1e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.198434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0251  nitrous-oxide reductase  35.7 
 
 		 639 aa  345  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4732  nitrous-oxide reductase  35.52 
 
 		 617 aa  343  5.999999999999999e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1738  nitrous-oxide reductase  36.09 
 
 		 636 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20200  nitrous-oxide reductase  35.78 
 
 		 636 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.89249 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1428  nitrous-oxide reductase  35.64 
 
 		 630 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2325  nitrous-oxide reductase  36.88 
 
 		 690 aa  332  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1483  nitrous-oxide reductase  36.59 
 
 		 644 aa  332  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150565 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2255  nitrous-oxide reductase  36.95 
 
 		 691 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2060  nitrous-oxide reductase  36.95 
 
 		 693 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.840269  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2115  nitrous-oxide reductase  36.95 
 
 		 655 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3199  nitrous-oxide reductase  36.47 
 
 		 650 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.324425  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2564  nitrous-oxide reductase  36.82 
 
 		 628 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164032  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0995  nitrous-oxide reductase  36.79 
 
 		 660 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599003  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1139  nitrous-oxide reductase  36.08 
 
 		 646 aa  326  8.000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.494075 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4917  nitrous-oxide reductase  35.22 
 
 		 646 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1060  nitrous-oxide reductase  36.24 
 
 		 645 aa  323  6e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.620388  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4059  nitrous-oxide reductase  35.93 
 
 		 649 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00566192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4171  nitrous-oxide reductase  35.93 
 
 		 649 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1368  nitrous-oxide reductase  35.26 
 
 		 646 aa  316  9e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0664  nitrous-oxide reductase  35.9 
 
 		 652 aa  313  6.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3319  nitrous-oxide reductase  34.93 
 
 		 644 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0698213  normal  0.2184 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4219  nitrous-oxide reductase  34.46 
 
 		 652 aa  303  8.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3194  nitrous-oxide reductase  33.44 
 
 		 647 aa  298  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  34.19 
 
 		 266 aa  60.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  32.67 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  28.79 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  30.69 
 
 		 156 aa  57  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  36.59 
 
 		 162 aa  55.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  29.91 
 
 		 160 aa  54.3  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  34.78 
 
 		 168 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1601  chain A, red copper protein nitrosocyanin  43.55 
 
 		 137 aa  51.6  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000567409  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  36.78 
 
 		 307 aa  51.2  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  30.95 
 
 		 124 aa  50.8  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  30.19 
 
 		 244 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  29.41 
 
 		 158 aa  50.4  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  30.95 
 
 		 168 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.71 
 
 		 316 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 155 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  34.62 
 
 		 172 aa  48.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 		 389 aa  48.5  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  30.21 
 
 		 125 aa  48.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 		 347 aa  48.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  31.03 
 
 		 371 aa  47.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  29.7 
 
 		 314 aa  47.4  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  31.11 
 
 		 171 aa  47.4  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  31 
 
 		 160 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  31.82 
 
 		 322 aa  47  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  30.51 
 
 		 300 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  26.58 
 
 		 311 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  29.35 
 
 		 370 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  31.94 
 
 		 342 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1408  cytochrome c oxidase family protein  29.41 
 
 		 141 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4253  cytochrome c oxidase, subunit II  31.82 
 
 		 124 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2422  cytochrome c oxidase family protein  29.41 
 
 		 141 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1899  cytochrome c oxidase family protein  29.41 
 
 		 141 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3408  cytochrome c oxidase family protein  29.41 
 
 		 141 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2257  putative cytochrome c oxidase subunit  29.41 
 
 		 141 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0923001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2296  putative cytochrome c oxidase subunit  29.41 
 
 		 141 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1172  cytochrome c oxidase family protein  29.41 
 
 		 141 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  28.28 
 
 		 313 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  31.58 
 
 		 364 aa  45.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  35.94 
 
 		 334 aa  45.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  32.2 
 
 		 310 aa  45.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.99 
 
 		 348 aa  45.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  31.58 
 
 		 362 aa  44.7  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  29.41 
 
 		 346 aa  44.3  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 		 321 aa  44.7  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  28.74 
 
 		 323 aa  44.3  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.52 
 
 		 340 aa  44.3  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  29.11 
 
 		 351 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.52 
 
 		 340 aa  44.3  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>