154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2328 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2328  type I restriction-modification system specificity subunit  100 
 
 
404 aa  817  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  41.28 
 
 
446 aa  320  2e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0031  type I restriction-modification system specificity subunit  41.16 
 
 
411 aa  213  5e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404176  normal  0.032892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0023  type I restriction-modification system specificity subunit  41.16 
 
 
411 aa  213  5e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  30.35 
 
 
420 aa  201  2e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2237  restriction modification system DNA specificity subunit  29.51 
 
 
412 aa  163  4e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  31.67 
 
 
397 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2467  restriction modification system DNA specificity domain  28.64 
 
 
438 aa  135  9e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1941  restriction endonuclease S subunits-like  26.27 
 
 
451 aa  132  8e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0182546  normal  0.0682578 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  31.42 
 
 
414 aa  126  8e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0005  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.32 
 
 
378 aa  118  2e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2909  restriction modification system DNA specificity subunit  24.59 
 
 
440 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  30.48 
 
 
285 aa  115  1e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1778  type I restriction-modification system specificity subunit  25.39 
 
 
419 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.926504  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4007  restriction endonuclease S subunits-like  27.53 
 
 
412 aa  112  2e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.07 
 
 
620 aa  109  8e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3144  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.67 
 
 
412 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527027  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3757  restriction modification system S subunit  23.88 
 
 
436 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.386531  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0223  putative HsdS protein  27.14 
 
 
438 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4348  restriction modification system DNA specificity subunit  28.99 
 
 
363 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0878  type I restriction modification system methylase  23.15 
 
 
424 aa  97.4  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3499  restriction modification system DNA specificity subunit  23.06 
 
 
405 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.082109 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  22.57 
 
 
425 aa  96.7  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2285  hypothetical protein  24.61 
 
 
425 aa  96.3  8e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0313194  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  26.13 
 
 
416 aa  95.1  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0854  restriction modification system DNA specificity subunit  34.43 
 
 
595 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221182  normal  0.0643125 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1032  restriction modification system DNA specificity subunit  33.88 
 
 
457 aa  92.8  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41908  normal  0.322454 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  21.34 
 
 
422 aa  90.1  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  29.78 
 
 
439 aa  89  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2415  restriction modification system DNA specificity domain  24 
 
 
418 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.589349  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0333  restriction modification system DNA specificity subunit  27.38 
 
 
371 aa  89  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1808  restriction modification system DNA specificity subunit  22.84 
 
 
483 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300643  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2791  type I restriction-modification system, S subunit  24 
 
 
418 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2364  restriction modification system DNA specificity subunit  24.47 
 
 
413 aa  85.9  1e-15  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.188022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7555  Restriction endonuclease S subunits-like protein  28.65 
 
 
402 aa  84.7  2e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2508  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  28.05 
 
 
401 aa  82.8  9e-15  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.700746 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.2 
 
 
429 aa  79.3  1e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0549  restriction modification system DNA specificity subunit  27.03 
 
 
385 aa  78.6  2e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4714  restriction modification system DNA specificity domain  30.77 
 
 
380 aa  77.8  3e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232226  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  22.66 
 
 
432 aa  76.6  8e-13  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1360  restriction modification system DNA specificity subunit  28.86 
 
 
453 aa  76.3  8e-13  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.98 
 
 
428 aa  76.3  1e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  23.37 
 
 
447 aa  75.5  2e-12  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0006  restriction modification system, type I  25 
 
 
412 aa  74.7  3e-12  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  22.22 
 
 
374 aa  73.9  4e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  26.23 
 
 
390 aa  73.2  7e-12  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  2.69296e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0845  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.07 
 
 
495 aa  73.2  9e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31571e-19 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2875  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.43 
 
 
390 aa  72.4  1e-11  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  28.28 
 
 
429 aa  70.1  6e-11  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2277  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.07 
 
 
433 aa  68.9  1e-10  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  hitchhiker  6.77276e-06 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2028  restriction modification system DNA specificity subunit  22.16 
 
 
391 aa  68.9  2e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  23.53 
 
 
419 aa  68.2  2e-10  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1061  putative type I restriction-modification system, S subunit  27.13 
 
 
528 aa  67.8  3e-10  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  25.77 
 
 
492 aa  68.2  3e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1536  hypothetical protein  22.06 
 
 
380 aa  67.8  4e-10  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00344436  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0836  type I restriction-modification system S subunit  25.15 
 
 
416 aa  67.8  4e-10  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2249  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.08 
 
 
384 aa  67.4  4e-10  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4778  restriction modification system DNA specificity subunit  23.53 
 
 
415 aa  67.4  5e-10  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16943  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4472  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.6 
 
 
428 aa  66.6  7e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0268  restriction endonuclease S subunits  28.24 
 
 
444 aa  65.9  1e-09  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277222  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1492  restriction modification system DNA specificity subunit  25.41 
 
 
479 aa  65.9  1e-09  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  22.05 
 
 
549 aa  65.9  1e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  22.55 
 
 
430 aa  65.5  2e-09  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0501  restriction modification system DNA specificity subunit  27.78 
 
 
612 aa  63.9  4e-09  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.435558 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3914  Restriction endonuclease S subunit  26.22 
 
 
405 aa  62.8  9e-09  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2009  restriction modification system DNA specificity domain  20.56 
 
 
423 aa  62.8  9e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.999718  normal  0.91224 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2378  type I restriction-modification system, S subunit  20.56 
 
 
383 aa  62.4  1e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1204  restriction modification system DNA specificity subunit  25.49 
 
 
547 aa  60.5  5e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340549  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1122  restriction endonuclease S subunits-like  32 
 
 
428 aa  60.1  6e-08  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.878738  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2421  restriction modification system DNA specificity subunit  24.82 
 
 
402 aa  60.1  7e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  24.43 
 
 
464 aa  60.1  8e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2742  type I restriction-modification system specificity determinant  24.06 
 
 
398 aa  59.3  1e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971087  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1087  type I restriction-modification system, S subunit  25.84 
 
 
422 aa  59.3  1e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5008  Restriction endonuclease S subunits-like protein  26.6 
 
 
465 aa  58.9  1e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1103  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.32 
 
 
400 aa  58.5  2e-07  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0442932  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3180  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.44 
 
 
390 aa  57.8  3e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0951  restriction modification system DNA specificity subunit  22.19 
 
 
419 aa  57.4  4e-07  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  4.06123e-05 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0835  restriction modification system DNA specificity domain  27.78 
 
 
563 aa  57.8  4e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.835919  normal  0.945638 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0686  type I restriction-modification system, S subunit, putative  27.78 
 
 
561 aa  57.4  4e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.840975  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3199  restriction modification system DNA specificity subunit  23.86 
 
 
400 aa  57  5e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365834  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0614  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.88 
 
 
401 aa  57  6e-07  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  22.48 
 
 
476 aa  57  6e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2257  restriction endonuclease S subunits-like protein  21.94 
 
 
413 aa  56.6  7e-07  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  24.41 
 
 
425 aa  56.2  9e-07  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  23.83 
 
 
428 aa  56.2  1e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2744  type I restriction-modification system, S subunit  21.71 
 
 
532 aa  55.8  1e-06  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181132  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03610  type I site-specific deoxyribonuclease  21.24 
 
 
360 aa  55.8  1e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.2 
 
 
453 aa  55.8  1e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4241  restriction modification system DNA specificity subunit  22.38 
 
 
411 aa  55.5  2e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.491612  hitchhiker  0.00127278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2409  restriction modification system DNA specificity subunit  24.1 
 
 
442 aa  54.7  3e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0287  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  25 
 
 
471 aa  54.3  4e-06  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2016  restriction modification system DNA specificity subunit  23.93 
 
 
417 aa  54.3  4e-06  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0839323  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2910  putative type I restriction-modification system, S subunit  35.79 
 
 
373 aa  53.9  5e-06  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  23.49 
 
 
393 aa  53.9  5e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  30.89 
 
 
435 aa  53.5  6e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  1.59098e-06 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  19.89 
 
 
417 aa  53.5  7e-06  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  25.35 
 
 
456 aa  52.8  1e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3081  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.03 
 
 
415 aa  52.8  1e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  24.88 
 
 
477 aa  52.8  1e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2548  restriction modification system DNA specificity domain  29.03 
 
 
405 aa  51.6  2e-05  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>