More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2214 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2214  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
300 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000844726  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1660  transcriptional regulator, LysR family  96.68 
 
 
301 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0094894  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1733  transcriptional regulator, LysR family  96.01 
 
 
301 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368943  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0542  transcription regulator protein  46.67 
 
 
305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164617  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0437  transcriptional regulator, LysR family  47.55 
 
 
305 aa  225  8e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.704934  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0423  transcriptional regulator, LysR family  47.55 
 
 
305 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  hitchhiker  0.000106922 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  43.54 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2190  transcriptional regulator, LysR family  48.95 
 
 
304 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0283977  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2482  transcriptional regulator, LysR family  46.82 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0991  transcriptional regulator, LysR family  48.1 
 
 
300 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00933399  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1967  transcriptional regulator, LysR family  42.81 
 
 
297 aa  210  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0256766 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0931  LysR family transcriptional regulator  47.75 
 
 
300 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0988  transcriptional regulator, LysR family  47.4 
 
 
300 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.882538  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2575  LysR family transcriptional regulator  46.59 
 
 
298 aa  209  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2734  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 
306 aa  205  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5239  transcriptional regulator, LysR family  44.41 
 
 
310 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.1 
 
 
299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  42.09 
 
 
304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  40.75 
 
 
335 aa  199  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  42.12 
 
 
299 aa  198  7.999999999999999e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2697  transcriptional regulator, LysR family  37.85 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
301 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2366  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 
300 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0908002 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  37.59 
 
 
307 aa  195  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  39.73 
 
 
299 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
298 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2356  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 
307 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118407  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6327  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 
291 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2679  transcriptional regulator, LysR family  40.6 
 
 
310 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2132  transcriptional regulator, LysR family  41.14 
 
 
298 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  37.63 
 
 
302 aa  192  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.7 
 
 
302 aa  191  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
301 aa  191  9e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2223  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 
310 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.499839  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 
294 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  41.58 
 
 
293 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  41.29 
 
 
297 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
309 aa  188  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  41.39 
 
 
299 aa  188  9e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
306 aa  188  9e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  41.2 
 
 
301 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  41.57 
 
 
313 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3640  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 
298 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.101202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  41.57 
 
 
294 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2957  transcriptional regulator, LysR family  40.6 
 
 
306 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014906 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0938  transcriptional regulator, LysR family  39.65 
 
 
306 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  42.54 
 
 
299 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2542  LysR family transcriptional regulator  44.04 
 
 
311 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal  0.053524 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 
296 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
298 aa  186  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
316 aa  185  6e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  38.28 
 
 
302 aa  185  6e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  35.46 
 
 
298 aa  185  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3332  transcription regulator protein  42.44 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2286  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0257  LysR family transcriptional regulator  38.73 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  39.4 
 
 
305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  39.4 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2339  LysR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  39.4 
 
 
305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0458  transcriptional regulator, LysR family  41.69 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.512377  normal  0.930115 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1970  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
399 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0474  LysR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
294 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  39.58 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1442  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.14 
 
 
315 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 
300 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2545  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
303 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2679  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0566483  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0806  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 
312 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1066  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
298 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001225  transcriptional regulator LysR family  37.15 
 
 
299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338504  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  40.64 
 
 
296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3170  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
303 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 
298 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
296 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06237  transcriptional regulator  37.76 
 
 
337 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
298 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01082  transcriptional regulator  37.76 
 
 
337 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000539431  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1518  transcriptional regulator, LysR family  41.86 
 
 
317 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  41.01 
 
 
294 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  41.09 
 
 
294 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 
300 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
295 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0005  LysR, substrate-binding  40.15 
 
 
290 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4901  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
303 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.795056  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0833  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 
300 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4145  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 
315 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.687298  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2698  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 
303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
307 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 
298 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3755  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31030  Transcriptional regulator, LysR family  39.06 
 
 
297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 
313 aa  179  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 
301 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>