209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2193 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  100 
 
 
166 aa  345  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  97.59 
 
 
166 aa  340  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  96.99 
 
 
166 aa  338  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  74.7 
 
 
166 aa  272  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  59.39 
 
 
165 aa  216  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  56.97 
 
 
165 aa  209  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  59.04 
 
 
166 aa  208  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  57.23 
 
 
166 aa  203  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  55.15 
 
 
165 aa  200  8e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  57.23 
 
 
166 aa  199  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  56.63 
 
 
166 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  55.42 
 
 
166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  57.58 
 
 
166 aa  187  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  56.29 
 
 
164 aa  186  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  57.23 
 
 
166 aa  185  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  55.69 
 
 
164 aa  185  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  56.89 
 
 
165 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  55.42 
 
 
165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  56.63 
 
 
164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  53.33 
 
 
166 aa  181  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  55.15 
 
 
166 aa  181  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  53.94 
 
 
164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  53.61 
 
 
166 aa  177  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  51.83 
 
 
165 aa  176  9e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  55.09 
 
 
168 aa  176  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  56.89 
 
 
168 aa  175  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  51.83 
 
 
165 aa  176  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  53.33 
 
 
166 aa  174  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  52.44 
 
 
166 aa  174  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  50.61 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  51.81 
 
 
166 aa  170  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  50.3 
 
 
167 aa  167  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  54.22 
 
 
168 aa  167  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  54.6 
 
 
168 aa  167  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  53.99 
 
 
167 aa  166  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  55.48 
 
 
158 aa  164  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  51.83 
 
 
172 aa  161  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  52.47 
 
 
164 aa  162  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  48.75 
 
 
167 aa  154  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  48.19 
 
 
163 aa  152  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  48.72 
 
 
166 aa  152  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  54.6 
 
 
169 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  46.01 
 
 
173 aa  151  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  52.44 
 
 
163 aa  150  8e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  45.62 
 
 
167 aa  141  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  45.96 
 
 
168 aa  137  7.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  41.57 
 
 
185 aa  136  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  42.07 
 
 
168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  41.95 
 
 
182 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  41.92 
 
 
170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  41.21 
 
 
170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  41.92 
 
 
170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  38.76 
 
 
185 aa  130  9e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  39.77 
 
 
184 aa  127  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  40.62 
 
 
169 aa  127  7.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  38.98 
 
 
184 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  40.85 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  39.77 
 
 
182 aa  124  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  40.74 
 
 
169 aa  121  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  39.08 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  41.92 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  41.21 
 
 
178 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  40.85 
 
 
178 aa  114  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  37.29 
 
 
184 aa  114  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  40.45 
 
 
228 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  50.76 
 
 
140 aa  112  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  42.46 
 
 
182 aa  108  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  39.29 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  39.29 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  46.97 
 
 
140 aa  106  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  35.96 
 
 
184 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  41.57 
 
 
221 aa  105  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  39.76 
 
 
179 aa  105  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  47.73 
 
 
146 aa  105  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  46.21 
 
 
140 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  39.43 
 
 
202 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  46.27 
 
 
140 aa  104  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  45.65 
 
 
144 aa  104  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  39.63 
 
 
178 aa  104  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  40.72 
 
 
179 aa  103  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  46.97 
 
 
168 aa  104  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  44.03 
 
 
139 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  47.73 
 
 
146 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  44.78 
 
 
139 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  44.7 
 
 
140 aa  101  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  39.53 
 
 
181 aa  101  5e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  36.14 
 
 
179 aa  101  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  44.7 
 
 
140 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  44.7 
 
 
140 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  44.7 
 
 
140 aa  100  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  44.7 
 
 
140 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  44.7 
 
 
140 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  44.7 
 
 
140 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  44.7 
 
 
140 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  44.7 
 
 
140 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  38.41 
 
 
233 aa  100  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  46.21 
 
 
140 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  46.21 
 
 
140 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  37.95 
 
 
179 aa  100  9e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  44.7 
 
 
139 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>