58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2048 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1831  glycoside hydrolase family 57  96.29 
 
 
812 aa  1459    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699985  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  73.42 
 
 
823 aa  1159    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2048  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
816 aa  1601    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1916  glycoside hydrolase family 57  94.58 
 
 
812 aa  1458    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900625  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4705  glycoside hydrolase family protein  42.29 
 
 
820 aa  635    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3268  glycoside hydrolase family protein  42.63 
 
 
817 aa  630  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  44.18 
 
 
811 aa  628  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0121928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4460  glycoside hydrolase family protein  44.32 
 
 
811 aa  617  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0202939 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0038  glycoside hydrolase family 57  42.75 
 
 
807 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  41.37 
 
 
811 aa  602  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  44.13 
 
 
794 aa  601  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2093  glycoside hydrolase family 57  42.03 
 
 
812 aa  600  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0133  glycoside hydrolase family 57  40.23 
 
 
814 aa  598  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2350  glycoside hydrolase family protein  40.1 
 
 
807 aa  587  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1884  glycoside hydrolase family 57  42.14 
 
 
900 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  41.97 
 
 
813 aa  588  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0114  glycoside hydrolase family 57  39.95 
 
 
814 aa  588  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0789579 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0696  glycoside hydrolase family 57  40.13 
 
 
862 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602449 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2438  family 57 glycoside hydrolase  38.57 
 
 
902 aa  560  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.178015  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4559  glycoside hydrolase family protein  39.9 
 
 
907 aa  552  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0553  glycoside hydrolase family protein  35.93 
 
 
850 aa  528  1e-148  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330945  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0021  glycoside hydrolase family protein  34.96 
 
 
786 aa  525  1e-147  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1295  glycoside hydrolase family protein  38.07 
 
 
871 aa  518  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701988  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0544  glycoside hydrolase family 57  38.88 
 
 
790 aa  491  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1264  glycoside hydrolase family protein  47.01 
 
 
791 aa  464  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2603  hypothetical protein  45.53 
 
 
771 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106323  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3241  glycoside hydrolase family 57  42.47 
 
 
709 aa  386  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  32.31 
 
 
766 aa  368  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0769  glycoside hydrolase family protein  40.92 
 
 
779 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276229  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0935  glycoside hydrolase family 57  43.08 
 
 
821 aa  361  3e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0112  glycoside hydrolase family 57  32.45 
 
 
682 aa  288  2.9999999999999996e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0904172  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  38.14 
 
 
485 aa  252  2e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  37.56 
 
 
472 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  37.36 
 
 
471 aa  242  2.9999999999999997e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  37.36 
 
 
485 aa  240  5.999999999999999e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  24.22 
 
 
1162 aa  63.5  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  29.51 
 
 
706 aa  55.1  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  25.41 
 
 
747 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2118  hypothetical protein  27.21 
 
 
407 aa  52  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  27.75 
 
 
722 aa  51.6  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  26.88 
 
 
577 aa  51.2  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  29.07 
 
 
726 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  41.67 
 
 
935 aa  48.1  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  24.76 
 
 
686 aa  48.1  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  23.17 
 
 
749 aa  48.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  23.17 
 
 
749 aa  48.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  29.07 
 
 
726 aa  47.8  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0802  4-alpha-glucanotransferase  27.64 
 
 
588 aa  47.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0708796  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  23.88 
 
 
729 aa  46.6  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1537  Alpha-amylase  23.78 
 
 
484 aa  46.2  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  26.07 
 
 
726 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0433  glycoside hydrolase family 57  31.78 
 
 
514 aa  45.8  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.188798  hitchhiker  0.0014488 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  23.43 
 
 
744 aa  45.8  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1370  4-alpha-glucanotransferase  24.49 
 
 
677 aa  45.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0791  glycoside hydrolase family protein  27.98 
 
 
598 aa  45.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 
1000 aa  44.7  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  25.52 
 
 
994 aa  44.3  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  25.99 
 
 
734 aa  44.3  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.392002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>