More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2036 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2036  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 		 779 aa  1463    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0247082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1842  glycosyl transferase family 51  92.45 
 
 		 782 aa  1263    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0117542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1927  glycosyl transferase family 51  93.4 
 
 		 782 aa  1247    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0285568  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0836  penicillin-binding protein 1C  38.94 
 
 		 719 aa  461  9.999999999999999e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0734378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2356  penicillin-binding protein 1C  37.83 
 
 		 762 aa  426  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1168  penicillin-binding protein 1C  38.71 
 
 		 798 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.676311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2139  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.88 
 
 		 774 aa  358  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.911102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2226  glycosyl transferase family protein  40.95 
 
 		 759 aa  356  8.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  35.91 
 
 		 860 aa  355  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2518  glycosyl transferase family 51  29.27 
 
 		 857 aa  344  5e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011285  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  39.39 
 
 		 853 aa  342  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  35.79 
 
 		 801 aa  334  4e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09670  penicillin-binding protein 1C  33.38 
 
 		 770 aa  318  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  35.94 
 
 		 855 aa  313  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  34.25 
 
 		 952 aa  312  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2789  penicillin-binding protein 1C  41.04 
 
 		 771 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0400715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2901  penicillin-binding protein 1C  41.04 
 
 		 771 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2683  penicillin-binding protein 1C  40.86 
 
 		 771 aa  308  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1149  penicillin-binding protein 1C  39.15 
 
 		 770 aa  307  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391736  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2726  penicillin-binding protein 1C  40.86 
 
 		 771 aa  307  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1158  penicillin-binding protein 1C  39.15 
 
 		 770 aa  307  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.729598  normal  0.0485769 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02411  fused transglycosylase/transpeptidase  39.15 
 
 		 770 aa  307  6e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02373  hypothetical protein  39.15 
 
 		 770 aa  307  6e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2670  penicillin-binding protein 1C  39.15 
 
 		 770 aa  306  7e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2894  penicillin-binding protein 1C  39.15 
 
 		 770 aa  306  7e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2770  penicillin-binding protein 1C  40.86 
 
 		 771 aa  306  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3748  penicillin-binding protein 1C  39.33 
 
 		 770 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2671  penicillin-binding protein 1C  38.98 
 
 		 770 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.122147 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2803  penicillin-binding protein 1C  39.29 
 
 		 770 aa  304  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  36.57 
 
 		 861 aa  303  7.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2824  penicillin-binding protein 1C  38.61 
 
 		 680 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3013  penicillin-binding protein 1C  38.78 
 
 		 774 aa  295  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.928991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3903  penicillin-binding protein 1C  32.09 
 
 		 766 aa  295  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3614  penicillin-binding protein 1C  35.93 
 
 		 774 aa  295  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.355013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0508  peptidoglycan glycosyltransferase  31.82 
 
 		 927 aa  294  4e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3627  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 		 908 aa  290  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2639  penicillin-binding protein 1C  36.97 
 
 		 793 aa  287  5.999999999999999e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3142  penicillin-binding protein 1C  36.24 
 
 		 742 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0543  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC  35.97 
 
 		 780 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3981  penicillin-binding protein 1C  37.05 
 
 		 745 aa  283  9e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.187688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3260  penicillin-binding protein 1C  41.81 
 
 		 696 aa  282  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247594  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1435  bifunctional penicillin-binding protein 1C precursor  40.15 
 
 		 794 aa  282  2e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.443847  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1366  penicillin-binding protein 1C  40.15 
 
 		 794 aa  281  4e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0369246  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1290  penicillin-binding protein 1C  37.33 
 
 		 747 aa  279  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00589164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5076  penicillin-binding protein 1C  32.35 
 
 		 816 aa  279  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.634438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1534  penicillin-binding protein 1C  37.97 
 
 		 706 aa  279  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232379  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2077  penicillin-binding protein 1C  37.41 
 
 		 706 aa  278  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145944  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2552  penicillin-binding protein 1C  37.86 
 
 		 750 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0465357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3812  penicillin-binding protein 1C  37 
 
 		 747 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.596  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5748  penicillin-binding protein 1C  37 
 
 		 747 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4556  penicillin-binding protein 1C  37 
 
 		 747 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2543  penicillin-binding protein 1C  37.02 
 
 		 696 aa  273  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.845119  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3916  penicillin-binding protein 1C (PBP-1C)  37.65 
 
 		 745 aa  272  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.787281 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1163  penicillin-binding protein 1C  40.29 
 
 		 705 aa  272  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22385  normal  0.584003 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4091  penicillin-binding protein 1C  40.45 
 
 		 745 aa  272  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1576  penicillin-binding protein, putative  38.11 
 
 		 713 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.772594  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3022  penicillin-binding protein 1C  37.37 
 
 		 793 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505998 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1584  penicillin-binding protein 1C  35.22 
 
 		 844 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2383  penicillin-binding protein 1C  39.79 
 
 		 729 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.977643  normal  0.393038 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4445  penicillin-binding protein 1C  36.77 
 
 		 745 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  34.97 
 
 		 728 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4387  penicillin-binding protein 1C  35.07 
 
 		 782 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0107  penicillin-binding protein 1C  33.06 
 
 		 762 aa  269  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1192  glycosyltransferase  27.64 
 
 		 774 aa  269  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.224348  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3922  penicillin-binding protein  37.89 
 
 		 695 aa  269  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.731246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  32.16 
 
 		 648 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0572  penicillin-binding protein 1C  37.83 
 
 		 784 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0390  penicillin-binding protein 1C  37.91 
 
 		 780 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2918  penicillin-binding protein 1C  36.7 
 
 		 731 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0611  penicillin-binding protein 1C  39.07 
 
 		 784 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  33.44 
 
 		 980 aa  266  8.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  36.25 
 
 		 739 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4592  penicillin-binding protein 1C  37.5 
 
 		 784 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0233923 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3299  penicillin-binding protein 1C  37.41 
 
 		 758 aa  265  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3383  penicillin-binding protein 1C  36.28 
 
 		 746 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  34.06 
 
 		 770 aa  264  6e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0617  penicillin-binding protein 1C  37.29 
 
 		 784 aa  264  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701974  normal  0.0771525 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3529  penicillin-binding protein 1C  36.46 
 
 		 726 aa  264  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5300  penicillin-binding protein 1C  39.37 
 
 		 774 aa  262  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4628  penicillin-binding protein 1C  37.14 
 
 		 684 aa  262  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.170087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0941  penicillin-binding protein 1C  35.59 
 
 		 785 aa  262  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237946  normal  0.754349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  36.38 
 
 		 728 aa  261  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  36.75 
 
 		 720 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  35.45 
 
 		 727 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2652  penicillin-binding protein 1C  37.31 
 
 		 768 aa  260  7e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.447412  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2472  penicillin-binding protein 1C  39.47 
 
 		 799 aa  260  9e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462783 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1343  penicillin-binding protein 1C  34.54 
 
 		 747 aa  259  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00458316  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  32.71 
 
 		 649 aa  259  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2192  penicillin-binding protein 1C  31.55 
 
 		 794 aa  259  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  36.24 
 
 		 714 aa  259  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4847  penicillin-binding protein  36.96 
 
 		 782 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  31.31 
 
 		 661 aa  259  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0732  penicillin-binding protein 1C  38.54 
 
 		 774 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0605  penicillin-binding protein 1C  37.21 
 
 		 691 aa  257  5e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  35.1 
 
 		 727 aa  257  7e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2557  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1B  33.23 
 
 		 778 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207966  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1629  hypothetical protein  30.43 
 
 		 772 aa  255  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  35.32 
 
 		 735 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  33.84 
 
 		 730 aa  255  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  33.84 
 
 		 763 aa  254  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>