91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2002 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2002  cytochrome c family protein  100 
 
 
346 aa  723    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1876  cytochrome C family protein  99.42 
 
 
346 aa  719    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  86.71 
 
 
346 aa  644    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1961  cytochrome C family protein  99.71 
 
 
346 aa  721    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613696  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  29.43 
 
 
658 aa  155  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  30.33 
 
 
757 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  32.31 
 
 
618 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  30.88 
 
 
618 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  29.83 
 
 
619 aa  133  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  29.79 
 
 
616 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  30.96 
 
 
615 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  29.69 
 
 
616 aa  116  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  32.39 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  29.09 
 
 
729 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4073  cytochrome c family protein  26.37 
 
 
662 aa  102  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  28.77 
 
 
688 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  30.03 
 
 
655 aa  97.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  29.24 
 
 
571 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  28.9 
 
 
566 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  28.9 
 
 
566 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  28.57 
 
 
689 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  26.94 
 
 
577 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  28.64 
 
 
670 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  29.59 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  25.24 
 
 
688 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2928  cytochrome c family protein  26.03 
 
 
350 aa  60.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000703284  decreased coverage  2.01033e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  26.05 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  25.25 
 
 
658 aa  52.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  23.43 
 
 
317 aa  52.8  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  26.79 
 
 
337 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  22.71 
 
 
318 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  23.66 
 
 
316 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  23.38 
 
 
314 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  25.63 
 
 
1294 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  27.98 
 
 
656 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  26.49 
 
 
427 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1577  cytochrome c family protein  27.51 
 
 
372 aa  49.7  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  28.02 
 
 
658 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  27.38 
 
 
650 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  23.77 
 
 
335 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  23.25 
 
 
316 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  26.79 
 
 
650 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  24.84 
 
 
307 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  24.4 
 
 
449 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  22.68 
 
 
321 aa  46.6  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  28.28 
 
 
646 aa  46.2  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  26.29 
 
 
442 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  23.83 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  27.78 
 
 
429 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  28.86 
 
 
426 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  23.74 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  21.15 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  23.97 
 
 
434 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0240  formate-dependent nitrite reductase  31.06 
 
 
157 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  30.47 
 
 
883 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  23.53 
 
 
314 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  24.24 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  28.22 
 
 
436 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0689  multiheme cytochrome  28.15 
 
 
359 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000324131 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  23.88 
 
 
326 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  24.75 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  24.15 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  22.38 
 
 
334 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  28.22 
 
 
436 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000515  cytochrome c-type protein NapC  24.22 
 
 
170 aa  44.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2172  nitrate reductase periplasmic cytochrome c-type protein NapC  26.35 
 
 
191 aa  44.3  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.457152  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0217  hydroxylamine oxidase  22.96 
 
 
520 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  28.22 
 
 
436 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  25 
 
 
245 aa  43.9  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  24.24 
 
 
329 aa  43.9  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0619  periplasmic nitrate reductase, cytochrome c-type protein  23.35 
 
 
191 aa  43.9  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  26.47 
 
 
333 aa  43.5  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  23.53 
 
 
315 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  26.49 
 
 
266 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  34.94 
 
 
358 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  25.76 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  25.23 
 
 
299 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  21.64 
 
 
658 aa  42.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  23.45 
 
 
315 aa  43.1  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  29.82 
 
 
304 aa  42.7  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  24.89 
 
 
469 aa  43.1  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  26.47 
 
 
333 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  26.53 
 
 
306 aa  42.7  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3111  cytochrome C family protein  25.56 
 
 
204 aa  42.7  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  26.47 
 
 
333 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  26.47 
 
 
329 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  26.47 
 
 
333 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  26.47 
 
 
333 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  34.88 
 
 
384 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  26.47 
 
 
329 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003115  cytochrome c-type protein nrfB precursor  27.5 
 
 
200 aa  42.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>