More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1944 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
97 aa  197  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  98.97 
 
 
97 aa  195  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  98.97 
 
 
97 aa  195  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  93.81 
 
 
97 aa  187  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  55.79 
 
 
94 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  52.69 
 
 
94 aa  102  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  54.17 
 
 
98 aa  101  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
94 aa  99  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947106  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 
94 aa  97.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4003  Ribosomal protein L25/L23  49.06 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.68966 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  48.96 
 
 
97 aa  96.7  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  48.96 
 
 
97 aa  96.7  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 
95 aa  95.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
95 aa  94.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 
94 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  47.25 
 
 
96 aa  94  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 
94 aa  93.6  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 
94 aa  93.6  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0329  50S ribosomal protein L23  55 
 
 
97 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0499  50S ribosomal protein L23  55 
 
 
97 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.173851  hitchhiker  0.00000000336824 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  53.26 
 
 
94 aa  91.3  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 
94 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
94 aa  88.6  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  50.55 
 
 
99 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0325  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 
100 aa  89  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000118373  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 
100 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  51.11 
 
 
95 aa  88.6  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 
100 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000248684  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 
100 aa  88.6  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108369  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0407  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 
100 aa  88.6  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00180319  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  47.92 
 
 
97 aa  87.4  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  48.96 
 
 
98 aa  87  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0662  50S ribosomal protein L23  47.37 
 
 
96 aa  87  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4542  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 
100 aa  86.7  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172317  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  50.55 
 
 
96 aa  87  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3993  Ribosomal protein L25/L23  48.39 
 
 
94 aa  86.3  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  52.22 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  52.22 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3820  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000460172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3999  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000101961  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2322  ribosomal L23 protein  52.38 
 
 
98 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0061  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 
101 aa  84  6e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000105028  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03169  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 
100 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000759178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0395  Ribosomal protein L25/L23  48.31 
 
 
100 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000225919  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  51.72 
 
 
97 aa  83.6  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3801  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 
100 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000749996  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3703  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 
100 aa  83.6  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0395  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 
100 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000080861  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03120  hypothetical protein  48.31 
 
 
100 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000565358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 
95 aa  83.6  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3613  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 
100 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000847098  hitchhiker  0.00309782 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4641  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 
100 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287124  normal  0.0460173 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3512  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 
100 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000392959  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3707  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 
100 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000802937  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3805  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 
100 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000686351  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  48.31 
 
 
98 aa  82.8  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3742  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 
100 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.344368  normal  0.0150111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3634  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 
100 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000793915  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  47.73 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3634  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 
100 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00980054  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  44.09 
 
 
98 aa  82.4  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3749  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 
100 aa  82  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000048697  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 
94 aa  81.3  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2322  50S ribosomal protein L23  52.44 
 
 
98 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000334931  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 
94 aa  80.5  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0871  50S ribosomal protein L23  53.57 
 
 
100 aa  80.5  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
113 aa  80.5  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00732  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 
100 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001740  LSU ribosomal protein L23p (L23Ae)  50.56 
 
 
100 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000423409  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0856  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 
98 aa  80.1  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483725  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_419  ribosomal protein L23  48.96 
 
 
94 aa  80.5  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0245207  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0453  50S ribosomal protein L23  48.96 
 
 
94 aa  80.5  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00013155  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 
100 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0761  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 
98 aa  79.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679128  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_002936  DET0476  50S ribosomal protein L23  47.42 
 
 
94 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00880639  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2370  ribosomal protein L23  47.56 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  46.07 
 
 
93 aa  79.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0278  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
98 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0471  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000395002  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0215  50S ribosomal protein L23  52.38 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000957762  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2172  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 
100 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267938  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  48.86 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0186  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 
100 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  49.44 
 
 
95 aa  78.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  39.36 
 
 
96 aa  78.2  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  48.86 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06270  50S ribosomal protein L23  47.5 
 
 
99 aa  78.2  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219554  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0172  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243767  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0281  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000926616  hitchhiker  0.00000149946 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0201  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 
101 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000698801  unclonable  0.0000000000184888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0196  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 
101 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000848979  decreased coverage  0.000284829 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  50.53 
 
 
101 aa  77.4  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1228  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 
98 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.195733  unclonable  0.00000945894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>