More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1653 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  100 
 
 
310 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  97.74 
 
 
310 aa  607  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  97.74 
 
 
310 aa  607  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  82.9 
 
 
310 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  53.14 
 
 
298 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  50.65 
 
 
303 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  53.29 
 
 
299 aa  297  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  49.34 
 
 
297 aa  285  8e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  48.5 
 
 
307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  47.39 
 
 
302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  50.32 
 
 
297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  48.37 
 
 
302 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  49.03 
 
 
307 aa  279  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  50.33 
 
 
303 aa  275  7e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  46.36 
 
 
301 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  45.31 
 
 
300 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  47.02 
 
 
301 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  46.69 
 
 
301 aa  271  7e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  46.69 
 
 
301 aa  271  7e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  46.69 
 
 
301 aa  271  7e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  46.69 
 
 
301 aa  271  7e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  46.69 
 
 
301 aa  271  7e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  46.69 
 
 
301 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  46.36 
 
 
301 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  46.36 
 
 
301 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  47.23 
 
 
296 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  46.03 
 
 
301 aa  268  8e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  47.37 
 
 
303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  48.5 
 
 
299 aa  265  5.999999999999999e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  46.86 
 
 
301 aa  263  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 
296 aa  263  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  47.84 
 
 
299 aa  263  4e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  47.84 
 
 
300 aa  261  6.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  45.36 
 
 
302 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  44.7 
 
 
303 aa  255  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  48.51 
 
 
315 aa  255  7e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 
305 aa  255  8e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  43.09 
 
 
314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  43.09 
 
 
314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  46.01 
 
 
298 aa  251  9.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  43.61 
 
 
303 aa  251  9.000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  43.19 
 
 
298 aa  249  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  46.13 
 
 
298 aa  247  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  39.4 
 
 
294 aa  246  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  43.56 
 
 
298 aa  246  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  44.12 
 
 
303 aa  245  6.999999999999999e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  47.35 
 
 
308 aa  245  9e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  46.18 
 
 
301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  42.72 
 
 
303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  42.19 
 
 
297 aa  243  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  46.25 
 
 
298 aa  241  9e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  41.78 
 
 
299 aa  241  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  41.78 
 
 
299 aa  241  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  44.37 
 
 
293 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  40.26 
 
 
299 aa  240  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  43 
 
 
302 aa  239  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 
295 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  45.7 
 
 
294 aa  236  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  43.2 
 
 
324 aa  236  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 
301 aa  236  5.0000000000000005e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  44.08 
 
 
306 aa  235  8e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  43 
 
 
305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  43.09 
 
 
318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1685  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 
295 aa  232  7.000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  44.44 
 
 
297 aa  231  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  43.52 
 
 
307 aa  230  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  40.59 
 
 
310 aa  230  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 
468 aa  229  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  45.54 
 
 
309 aa  229  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  41.12 
 
 
311 aa  229  6e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  43.71 
 
 
314 aa  228  8e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  43.42 
 
 
293 aa  227  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2244  GTP-binding protein Era  42.57 
 
 
305 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2898  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 
299 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22233  normal  0.295103 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0544  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 
299 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2839  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 
299 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2894  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 
299 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2465  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 
311 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2778  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 
299 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1788  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 
299 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2816  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 
299 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1086  GTP-binding protein Era  41.35 
 
 
299 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  41.64 
 
 
305 aa  226  4e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  42.52 
 
 
303 aa  225  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  42.52 
 
 
303 aa  225  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  42.52 
 
 
303 aa  225  6e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  46.03 
 
 
451 aa  225  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  41.39 
 
 
311 aa  225  6e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  39.74 
 
 
300 aa  225  9e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1434  GTP-binding protein Era  41.8 
 
 
302 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  41.2 
 
 
300 aa  224  1e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  41.2 
 
 
311 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  40.46 
 
 
337 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  40.95 
 
 
314 aa  223  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  43.19 
 
 
300 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  43.33 
 
 
489 aa  223  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  44.48 
 
 
303 aa  223  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3726  GTP-binding protein Era  43.45 
 
 
340 aa  222  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  44.98 
 
 
315 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2169  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 
299 aa  222  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0368513  normal  0.378234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>