More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1631 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1631  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  750    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.212269  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2317  radical SAM enzyme, Cfr family  97.85 
 
 
372 aa  738    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2229  radical SAM enzyme, Cfr family  97.85 
 
 
372 aa  736    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2180  radical SAM protein  80.94 
 
 
377 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1111  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  51.45 
 
 
360 aa  358  9e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2685  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50.58 
 
 
346 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000061721  normal  0.591184 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2558  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50.43 
 
 
351 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.150479999999999e-35 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1581  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50.15 
 
 
343 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000011547  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.57 
 
 
351 aa  348  7e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0167472  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2311  radical SAM protein  49.42 
 
 
371 aa  330  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  47.98 
 
 
376 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5856  radical SAM enzyme, Cfr family  50.29 
 
 
378 aa  328  8e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0427  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.56 
 
 
347 aa  327  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273579  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1623  hypothetical protein  48.12 
 
 
362 aa  324  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271207 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2022  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.18 
 
 
371 aa  323  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2379  hypothetical protein  48.12 
 
 
365 aa  323  3e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3329  hypothetical protein  48.75 
 
 
428 aa  322  5e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  49.13 
 
 
377 aa  322  5e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1602  radical SAM enzyme, Cfr family  50.44 
 
 
363 aa  319  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.113295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1930  radical SAM enzyme, Cfr family  50.44 
 
 
362 aa  319  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3610  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.61 
 
 
351 aa  318  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2611  hypothetical protein  47.86 
 
 
382 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00319585  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  47.66 
 
 
342 aa  317  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  47.86 
 
 
383 aa  317  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1167  radical SAM protein  47.86 
 
 
374 aa  317  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1253  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.76 
 
 
373 aa  316  5e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.405878  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1225  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.92 
 
 
373 aa  316  5e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.461537  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0591  hypothetical protein  49.29 
 
 
372 aa  315  7e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.196855  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3151  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.92 
 
 
373 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00905599  hitchhiker  0.00812914 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1370  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.92 
 
 
373 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3008  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.63 
 
 
373 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00899057  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1296  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.63 
 
 
373 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499019  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1226  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.63 
 
 
373 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173043  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3315  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.92 
 
 
373 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2184  radical SAM enzyme, Cfr family  48.48 
 
 
382 aa  313  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0035  hypothetical protein  46.2 
 
 
399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.63 
 
 
373 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1869  radical SAM protein  46.72 
 
 
382 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.63 
 
 
373 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.563776  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0093  hypothetical protein  47.01 
 
 
399 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82991  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0709  hypothetical protein  46.91 
 
 
398 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.35 
 
 
373 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0888845  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  45.45 
 
 
349 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  47.53 
 
 
373 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1287  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.35 
 
 
373 aa  310  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0401  radical SAM enzyme, Cfr family  46.2 
 
 
399 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.213699  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1290  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.09 
 
 
398 aa  308  8e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1183  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.09 
 
 
398 aa  308  8e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0421  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.09 
 
 
398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.662236  hitchhiker  0.00298691 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2993  radical SAM protein  44.94 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00523882  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0241  putative pyruvate formate lyase activating enzyme 2 (yfgB)  45.92 
 
 
403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.283575  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3612  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.24 
 
 
398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1999  hypothetical protein  48.97 
 
 
394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.175204 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.06 
 
 
373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106958  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1113  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.79 
 
 
373 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.686108  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2740  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46 
 
 
393 aa  305  6e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2700  radical SAM protein  45.89 
 
 
390 aa  305  7e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83245  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  44.48 
 
 
382 aa  305  9.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2089  hypothetical protein  46.42 
 
 
384 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1541  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.79 
 
 
373 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.865101  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1249  radical SAM protein  47.81 
 
 
360 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  48.1 
 
 
359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.22 
 
 
372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000522962  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  43.73 
 
 
382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0398  radical SAM protein  45.87 
 
 
414 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0578367  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5022  radical SAM protein  46.72 
 
 
397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380261  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2783  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.2 
 
 
388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.355164  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2720  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.2 
 
 
388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.564025  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2895  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.2 
 
 
388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1148  radical SAM enzyme, Cfr family  46.55 
 
 
383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  0.550837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2764  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.2 
 
 
388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2668  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.14 
 
 
384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02409  predicted enzyme  45.14 
 
 
384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1151  radical SAM enzyme, Cfr family  45.14 
 
 
384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.390398  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2669  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.14 
 
 
384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.253648 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2806  hypothetical protein  44.57 
 
 
427 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1160  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.14 
 
 
384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0206768 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02371  hypothetical protein  45.14 
 
 
384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2892  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.14 
 
 
384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1056  radical SAM enzyme, Cfr family  46.26 
 
 
383 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0486076  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2801  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.14 
 
 
384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1212  hypothetical protein  46.13 
 
 
383 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2871  radical SAM protein  46.81 
 
 
393 aa  302  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2109  hypothetical protein  46.38 
 
 
384 aa  302  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1353  radical SAM protein  44.44 
 
 
371 aa  303  5.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000160208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1429  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.5 
 
 
373 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0876618 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1115  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.66 
 
 
392 aa  301  8.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2677  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.38 
 
 
388 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3626  hypothetical protein  44.6 
 
 
397 aa  301  9e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  45.8 
 
 
364 aa  301  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3742  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.86 
 
 
384 aa  301  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3393  radical SAM enzyme, Cfr family  45.82 
 
 
382 aa  300  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0620  hypothetical protein  44 
 
 
370 aa  300  2e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180215  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0185  radical SAM protein  46.22 
 
 
404 aa  300  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3017  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.38 
 
 
419 aa  300  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1255  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.38 
 
 
400 aa  299  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1122  radical SAM protein  45.9 
 
 
430 aa  299  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0900  hypothetical protein  47.84 
 
 
372 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.22 
 
 
388 aa  298  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2232  radical SAM protein  46.84 
 
 
378 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.750735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>