More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1588 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2275  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
148 aa  295  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2363  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
148 aa  295  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.206524  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1588  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
148 aa  295  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2225  50S ribosomal protein L11  97.3 
 
 
148 aa  290  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901746 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  68.49 
 
 
140 aa  201  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  66.44 
 
 
141 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  66.44 
 
 
141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  65.31 
 
 
141 aa  197  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  65.75 
 
 
140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  65.75 
 
 
140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  64.38 
 
 
141 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  63.01 
 
 
140 aa  191  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  64.38 
 
 
140 aa  191  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  66.44 
 
 
142 aa  190  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  65.75 
 
 
140 aa  190  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  65.99 
 
 
141 aa  189  8e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  65.99 
 
 
143 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3360  50S ribosomal protein L11  62.16 
 
 
149 aa  187  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711541  normal  0.0993173 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  65.75 
 
 
141 aa  187  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  63.7 
 
 
141 aa  187  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  63.7 
 
 
141 aa  187  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  67.83 
 
 
140 aa  186  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  65.07 
 
 
143 aa  186  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  65.07 
 
 
142 aa  186  9e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  63.7 
 
 
141 aa  186  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  62.33 
 
 
141 aa  185  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  63.45 
 
 
140 aa  185  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  63.27 
 
 
143 aa  184  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  63.01 
 
 
142 aa  184  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  65.31 
 
 
143 aa  184  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  66.9 
 
 
140 aa  184  5e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  61.9 
 
 
143 aa  183  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  61.22 
 
 
143 aa  183  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  67.12 
 
 
142 aa  183  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  64.83 
 
 
141 aa  183  8e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 
143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  61.22 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  67.13 
 
 
140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  67.13 
 
 
140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0268  50S ribosomal protein L11P  62.59 
 
 
143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00815832  hitchhiker  0.0013988 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 
140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1209  50S ribosomal protein L11  59.86 
 
 
142 aa  181  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  62.07 
 
 
141 aa  181  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_004310  BR1248  50S ribosomal protein L11  59.86 
 
 
142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208102  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  61.22 
 
 
143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  63.27 
 
 
148 aa  181  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1823  50S ribosomal protein L11  58.5 
 
 
142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0169  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 
142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000273225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  64.14 
 
 
141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  64.14 
 
 
141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  64.14 
 
 
141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  64.14 
 
 
141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  64.14 
 
 
141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  64.14 
 
 
141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  64.14 
 
 
141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  64.14 
 
 
141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  64.14 
 
 
141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  64.14 
 
 
141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 
143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  64.14 
 
 
141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  59.59 
 
 
141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  61.22 
 
 
143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  63.45 
 
 
141 aa  180  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  62.07 
 
 
141 aa  180  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  61.22 
 
 
143 aa  180  7e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  61.22 
 
 
143 aa  180  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  61.22 
 
 
143 aa  180  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0755  50S ribosomal protein L11  59.18 
 
 
143 aa  180  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  61.22 
 
 
143 aa  180  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  61.22 
 
 
143 aa  180  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 
143 aa  180  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  61.22 
 
 
143 aa  180  7e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  61.22 
 
 
143 aa  180  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  61.22 
 
 
143 aa  180  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  61.22 
 
 
143 aa  179  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  62.76 
 
 
141 aa  179  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0826  50S ribosomal protein L11  61.9 
 
 
143 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08720  50S ribosomal protein L11  61.9 
 
 
143 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444282  hitchhiker  0.00204472 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  60 
 
 
141 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  63.95 
 
 
141 aa  178  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  61.22 
 
 
143 aa  178  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  60 
 
 
141 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3889  ribosomal protein L11  62.76 
 
 
142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0323173  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0315  50S ribosomal protein L11  60.54 
 
 
143 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000167318  normal  0.214276 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3435  50S ribosomal protein L11  60.54 
 
 
143 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0613372  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0920  50S ribosomal protein L11  60.54 
 
 
143 aa  177  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000795353  hitchhiker  0.00000174139 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2806  50S ribosomal protein L11  63.95 
 
 
142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221343  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3656  50S ribosomal protein L11  61.9 
 
 
143 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00490061  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0273  ribosomal protein L11  62.76 
 
 
142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225698  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2771  50S ribosomal protein L11  60.54 
 
 
143 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  60.54 
 
 
143 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0255  50S ribosomal protein L11  60.54 
 
 
143 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0336  50S ribosomal protein L11  60.54 
 
 
143 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3735  ribosomal protein L11  62.76 
 
 
142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257354  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2111  50S ribosomal protein L11  59.86 
 
 
169 aa  177  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000939777  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3455  50S ribosomal protein L11P  58.5 
 
 
143 aa  177  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175537  normal  0.270352 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2040  50S ribosomal protein L11  61.9 
 
 
143 aa  177  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000854354  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  63.45 
 
 
140 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1891  50S ribosomal protein L11  61.9 
 
 
143 aa  177  5.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0335  50S ribosomal protein L11  63.27 
 
 
142 aa  177  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00120454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>