More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1532 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  100 
 
 
253 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  93.28 
 
 
253 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  93.68 
 
 
253 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  84.58 
 
 
253 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  63.56 
 
 
249 aa  299  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  56.18 
 
 
250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  57.26 
 
 
252 aa  285  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  56.85 
 
 
251 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  59.04 
 
 
257 aa  281  5.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  56.45 
 
 
251 aa  281  9e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  58.1 
 
 
257 aa  280  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  56.45 
 
 
251 aa  278  9e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  55.78 
 
 
250 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  60.16 
 
 
654 aa  275  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  54.84 
 
 
251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  56.35 
 
 
251 aa  271  5.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  55.24 
 
 
251 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  56.8 
 
 
252 aa  271  6e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  55.87 
 
 
254 aa  270  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  55.24 
 
 
250 aa  270  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  55.65 
 
 
251 aa  268  8e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  54.44 
 
 
250 aa  264  8e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  55.38 
 
 
249 aa  264  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  52.42 
 
 
248 aa  263  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  55.47 
 
 
254 aa  263  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  55.24 
 
 
251 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  54.8 
 
 
251 aa  261  6.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  56 
 
 
252 aa  261  8.999999999999999e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  52.99 
 
 
251 aa  260  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  52.82 
 
 
254 aa  260  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  52.42 
 
 
252 aa  259  2e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  55.06 
 
 
249 aa  259  4e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  54.44 
 
 
250 aa  257  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  52.78 
 
 
256 aa  254  8e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  53.23 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  52.26 
 
 
243 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0891  triosephosphate isomerase  49.62 
 
 
274 aa  249  3e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  52.4 
 
 
250 aa  249  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 
250 aa  249  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  51.61 
 
 
248 aa  249  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  51.61 
 
 
248 aa  249  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  51.85 
 
 
255 aa  248  8e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
646 aa  247  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  50 
 
 
253 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
251 aa  246  4e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  48.8 
 
 
250 aa  245  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 
249 aa  244  6.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.37 
 
 
655 aa  244  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
275 aa  242  3e-63  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  50.62 
 
 
243 aa  243  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
253 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
253 aa  243  3e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  50.39 
 
 
256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  53.88 
 
 
245 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  51.97 
 
 
240 aa  240  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  47.22 
 
 
253 aa  240  1e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  49.42 
 
 
257 aa  241  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  52.65 
 
 
245 aa  239  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
255 aa  240  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 
253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 
253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 
249 aa  239  4e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  52.61 
 
 
251 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  52.61 
 
 
251 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 
253 aa  239  4e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  48.18 
 
 
250 aa  238  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  53.6 
 
 
251 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 
253 aa  237  1e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  53.23 
 
 
248 aa  237  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 
255 aa  237  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  50 
 
 
256 aa  236  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10411  triosephosphate isomerase  46.53 
 
 
241 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 
249 aa  236  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  50 
 
 
257 aa  236  3e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  53.23 
 
 
248 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 
256 aa  235  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 
252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 
252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 
251 aa  235  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  52.61 
 
 
251 aa  235  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  54.4 
 
 
251 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  54.4 
 
 
251 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  50.8 
 
 
255 aa  234  7e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 
251 aa  234  8e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 
251 aa  234  8e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 
251 aa  234  8e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 
251 aa  234  8e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 
251 aa  234  9e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  47.22 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 
263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  46.96 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  48.81 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4494  triosephosphate isomerase  51.19 
 
 
251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 
251 aa  232  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10411  triosephosphate isomerase  46.12 
 
 
241 aa  232  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  52.8 
 
 
251 aa  231  9e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>