More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1476 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  38.62 
 
 
1496 aa  666    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  36.43 
 
 
1032 aa  657    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  39.59 
 
 
1071 aa  653    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  39.94 
 
 
1470 aa  672    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  39.21 
 
 
1038 aa  672    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  38.86 
 
 
1041 aa  660    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  92.9 
 
 
1028 aa  1844    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  38.03 
 
 
1050 aa  670    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1028 aa  1999    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  36.94 
 
 
1095 aa  640    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  37.67 
 
 
1036 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  48.62 
 
 
1055 aa  869    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  43.49 
 
 
1047 aa  730    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  40.59 
 
 
1039 aa  691    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  63.8 
 
 
1028 aa  1191    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  40.23 
 
 
1033 aa  641    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  39.03 
 
 
1062 aa  676    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  93.19 
 
 
1028 aa  1843    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  38.61 
 
 
1069 aa  641    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  37.74 
 
 
1065 aa  634  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  36.26 
 
 
1070 aa  620  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  41.26 
 
 
1038 aa  618  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  37.43 
 
 
1075 aa  618  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  36.53 
 
 
1009 aa  613  9.999999999999999e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  40.74 
 
 
1045 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 
1014 aa  609  1e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  39.06 
 
 
1054 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  39.16 
 
 
1054 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  40.94 
 
 
1044 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.76 
 
 
1024 aa  600  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  39.06 
 
 
1054 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  38.73 
 
 
1067 aa  598  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  36.68 
 
 
1066 aa  596  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  36.74 
 
 
1022 aa  598  1e-169  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  36.29 
 
 
1043 aa  593  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  34.38 
 
 
1053 aa  593  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  34.67 
 
 
1013 aa  590  1e-167  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  33.37 
 
 
1040 aa  590  1e-167  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  36.54 
 
 
1024 aa  587  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  35.5 
 
 
1040 aa  587  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  34.1 
 
 
1073 aa  588  1e-166  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  37.57 
 
 
1042 aa  583  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  34.45 
 
 
1022 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  36.06 
 
 
1026 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  34.17 
 
 
1048 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  34.02 
 
 
1039 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  35.62 
 
 
1050 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  35.85 
 
 
1042 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  35.95 
 
 
1060 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  35.82 
 
 
1040 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  32.42 
 
 
1050 aa  570  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  33.5 
 
 
1034 aa  570  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1941  acriflavin resistance protein  37.09 
 
 
1041 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143318  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  34.63 
 
 
1044 aa  568  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1856  acriflavin resistance protein  36.99 
 
 
1041 aa  569  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0557  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  36.45 
 
 
1046 aa  567  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644093  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  32.94 
 
 
1011 aa  567  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  32.56 
 
 
1059 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  32.72 
 
 
1044 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.02 
 
 
1024 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  33.75 
 
 
1058 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  35.16 
 
 
1058 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  34.38 
 
 
1040 aa  565  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  36.7 
 
 
1048 aa  564  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  35.82 
 
 
1088 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1338  acriflavin resistance protein  35.56 
 
 
1044 aa  559  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  32.94 
 
 
1068 aa  560  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  35.1 
 
 
1029 aa  559  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  36.2 
 
 
1023 aa  561  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  31.97 
 
 
1063 aa  561  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  35.92 
 
 
1031 aa  560  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  35.63 
 
 
1088 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0885  acriflavin resistance protein  35.53 
 
 
1053 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1787  acriflavin resistance protein  35.59 
 
 
1044 aa  558  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.342493 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  34.28 
 
 
1041 aa  559  1e-157  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  35.61 
 
 
1088 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  32.88 
 
 
1036 aa  553  1e-156  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2022  acriflavin resistance protein  36.7 
 
 
1041 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625222  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  34.51 
 
 
1048 aa  555  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  31.78 
 
 
1034 aa  552  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  35.76 
 
 
1037 aa  552  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  31.69 
 
 
1058 aa  551  1e-155  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0907  acriflavin resistance protein  35.45 
 
 
1043 aa  549  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.582716  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  32.39 
 
 
1058 aa  548  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  32.5 
 
 
1030 aa  548  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  32.56 
 
 
1035 aa  546  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  34.98 
 
 
1036 aa  547  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  35.87 
 
 
1025 aa  548  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  33.13 
 
 
1034 aa  544  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  31.99 
 
 
1033 aa  545  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1515  acriflavin resistance protein  33.73 
 
 
1038 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1667  acriflavin resistance protein  35.41 
 
 
1037 aa  545  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29656  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  32.15 
 
 
1041 aa  546  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  35.74 
 
 
1031 aa  543  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0427  acriflavin resistance protein  35.31 
 
 
1039 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513566  normal  0.0142489 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  34.06 
 
 
1027 aa  542  9.999999999999999e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  31.69 
 
 
1037 aa  536  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 
1032 aa  537  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  36.62 
 
 
1035 aa  539  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  32.81 
 
 
1055 aa  537  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.931818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>