More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1462 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  100 
 
 		 387 aa  786    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  49.18 
 
 		 451 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  44.92 
 
 		 381 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  41.34 
 
 		 392 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  33.68 
 
 		 275 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  28.11 
 
 		 397 aa  96.7  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  30.77 
 
 		 274 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  28.06 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  25.48 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  29.84 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  23.16 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  26.51 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  23.16 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  26.11 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  30.47 
 
 		 300 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  32.54 
 
 		 188 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  32.34 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  30.77 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  30.77 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  27.85 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  28.68 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  28.68 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  28.32 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  35.18 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  29.29 
 
 		 284 aa  72.8  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  35.35 
 
 		 402 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  31.41 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.99 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  25.09 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  29.69 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  25.34 
 
 		 346 aa  72  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  32.79 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  25.46 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  30.04 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  28.03 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  30.27 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  33.47 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  24.15 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  27.62 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0989  integrase family protein  27.8 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000138199  hitchhiker  0.00000000000000368709 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  28.18 
 
 		 209 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.23 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  28.83 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  25 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  27.16 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2647  phage integrase family protein  26.17 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  31.96 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0915  Tn916, transposase  27.78 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.67 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.67 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  27.4 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25.54 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  29.37 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  26.1 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  25.64 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  27.73 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  28.46 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  28.99 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  29.46 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 299 aa  67  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 299 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  26.84 
 
 		 372 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  30.37 
 
 		 422 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 299 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  34.07 
 
 		 477 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  26.6 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  23.28 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  25.55 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  31.18 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  26.26 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  28.49 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  29.17 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  28.7 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.45 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.32 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2414  phage integrase family protein  27.12 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  26.42 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  27.71 
 
 		 506 aa  64.3  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0196  integrase family protein  31.37 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000565414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  25.82 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.81 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  23.53 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  27.85 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  28.06 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  26.91 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  28.46 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  25.74 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  26.91 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  27.99 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  35.03 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  25 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  27.5 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>