More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1381 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  100 
 
 
181 aa  353  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  89.73 
 
 
185 aa  318  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  89.19 
 
 
185 aa  316  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  53.46 
 
 
163 aa  194  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  55 
 
 
164 aa  186  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  53.46 
 
 
164 aa  184  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  54.97 
 
 
164 aa  184  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  53.16 
 
 
178 aa  183  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  53.85 
 
 
164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  55.1 
 
 
164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  55.94 
 
 
164 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  52.67 
 
 
171 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  54.05 
 
 
162 aa  181  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  53.69 
 
 
157 aa  180  8.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  47.62 
 
 
169 aa  178  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  51.92 
 
 
167 aa  175  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  48.1 
 
 
167 aa  157  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  47.26 
 
 
164 aa  155  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  50 
 
 
179 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  46.98 
 
 
163 aa  147  8e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  45.83 
 
 
173 aa  147  9e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  45.64 
 
 
161 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  46.85 
 
 
161 aa  144  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  48.7 
 
 
160 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  42.31 
 
 
169 aa  142  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  44.24 
 
 
185 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  44.67 
 
 
194 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  43.33 
 
 
194 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  43.33 
 
 
192 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  42.58 
 
 
179 aa  131  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  44.9 
 
 
194 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  41.07 
 
 
194 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  41.07 
 
 
194 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  41.56 
 
 
185 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  42.57 
 
 
179 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  40.67 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  39.19 
 
 
176 aa  125  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  42.25 
 
 
170 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  37.84 
 
 
187 aa  121  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  43.26 
 
 
179 aa  121  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  42.95 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.14 
 
 
178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  40.29 
 
 
184 aa  117  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  46.62 
 
 
169 aa  118  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  40.79 
 
 
171 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  36.24 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  37.58 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  41.38 
 
 
160 aa  114  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  38.06 
 
 
169 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  38.1 
 
 
164 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  39.62 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  35.9 
 
 
156 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  40.56 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  40.56 
 
 
162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  42.47 
 
 
212 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  35.09 
 
 
179 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  37.09 
 
 
174 aa  112  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  37.16 
 
 
163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  36.99 
 
 
162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  37.5 
 
 
162 aa  111  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  37.09 
 
 
174 aa  110  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  41.61 
 
 
158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  35.37 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  35.29 
 
 
163 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  37.16 
 
 
175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.78 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  37.42 
 
 
162 aa  109  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6732  CheW protein  38.62 
 
 
165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0258565  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  39.19 
 
 
163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  39.16 
 
 
167 aa  108  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  32.9 
 
 
163 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  37.24 
 
 
169 aa  107  9.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  40.27 
 
 
160 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  31.58 
 
 
169 aa  107  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  39.19 
 
 
164 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  39.74 
 
 
164 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  38.3 
 
 
164 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  37.41 
 
 
163 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  33.96 
 
 
159 aa  106  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  30.52 
 
 
165 aa  106  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  37.59 
 
 
166 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  36.77 
 
 
162 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  37.41 
 
 
161 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  34 
 
 
183 aa  106  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  33.76 
 
 
165 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.3 
 
 
164 aa  105  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  44.19 
 
 
194 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  36.18 
 
 
187 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  38.3 
 
 
164 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  38.3 
 
 
164 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  38.3 
 
 
164 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  38.1 
 
 
164 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  38.1 
 
 
164 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  38.3 
 
 
164 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  38.1 
 
 
164 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  38.03 
 
 
163 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  34.69 
 
 
171 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  38.03 
 
 
163 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  37.42 
 
 
159 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.13 
 
 
174 aa  105  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>