More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1294 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
364 aa  718    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  96.98 
 
 
364 aa  670    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  96.98 
 
 
364 aa  669    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  81.92 
 
 
363 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.97 
 
 
367 aa  316  5e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.17 
 
 
361 aa  313  1.9999999999999998e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.1 
 
 
344 aa  309  4e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.25 
 
 
377 aa  308  9e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  50.68 
 
 
357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.54 
 
 
343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  49.18 
 
 
367 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.16 
 
 
360 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.3 
 
 
349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.75 
 
 
348 aa  302  8.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  51.88 
 
 
361 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  49.15 
 
 
356 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.75 
 
 
339 aa  300  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.45 
 
 
339 aa  300  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.45 
 
 
339 aa  299  4e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.45 
 
 
339 aa  299  4e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.87 
 
 
336 aa  299  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00949  dihydroorotate dehydrogenase  46.87 
 
 
336 aa  299  6e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  46.87 
 
 
336 aa  299  6e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.87 
 
 
336 aa  299  6e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.87 
 
 
336 aa  299  6e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1109  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.87 
 
 
336 aa  299  6e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000226851  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.87 
 
 
336 aa  299  6e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  46.87 
 
 
336 aa  299  6e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.87 
 
 
336 aa  299  6e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.45 
 
 
356 aa  298  7e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.45 
 
 
356 aa  298  7e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.45 
 
 
356 aa  298  7e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.81 
 
 
344 aa  296  3e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  48.07 
 
 
348 aa  296  4e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.07 
 
 
339 aa  296  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  50.14 
 
 
361 aa  296  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  46.76 
 
 
355 aa  295  7e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.24 
 
 
336 aa  295  8e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.24 
 
 
336 aa  294  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1457  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.57 
 
 
336 aa  294  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.56 
 
 
339 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.56 
 
 
339 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.27 
 
 
336 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1016  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.67 
 
 
336 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845277  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.37 
 
 
336 aa  293  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1099  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.67 
 
 
336 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000085324  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1167  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.67 
 
 
336 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0101504  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.37 
 
 
336 aa  293  4e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.37 
 
 
336 aa  293  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1133  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.67 
 
 
336 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000040512  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1120  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.67 
 
 
336 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  45.59 
 
 
336 aa  293  5e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  47.93 
 
 
360 aa  292  5e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.97 
 
 
339 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.89 
 
 
336 aa  291  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 
339 aa  291  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  44.12 
 
 
339 aa  290  2e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  47.59 
 
 
336 aa  291  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  47.74 
 
 
348 aa  290  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.67 
 
 
339 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  50.42 
 
 
389 aa  289  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.7 
 
 
351 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.43 
 
 
341 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.7 
 
 
351 aa  289  6e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  46.71 
 
 
340 aa  289  6e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1593  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.22 
 
 
339 aa  288  9e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000395197  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.53 
 
 
361 aa  288  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.26 
 
 
356 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  45.43 
 
 
363 aa  287  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.26 
 
 
356 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.29 
 
 
364 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.89 
 
 
342 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  44.61 
 
 
335 aa  286  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  46.83 
 
 
356 aa  286  5e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2141  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.72 
 
 
340 aa  286  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 
364 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  48.37 
 
 
349 aa  285  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.94 
 
 
357 aa  285  7e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2475  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.31 
 
 
339 aa  285  9e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00234751  hitchhiker  0.00462057 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0409  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.77 
 
 
336 aa  285  1.0000000000000001e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.845411  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.43 
 
 
336 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1677  dihydroorotate dehydrogenase  44.78 
 
 
335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.67 
 
 
345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  48 
 
 
364 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.02 
 
 
358 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.31 
 
 
355 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.67 
 
 
347 aa  283  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.67 
 
 
347 aa  283  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.36 
 
 
347 aa  282  6.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.94 
 
 
358 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  49.43 
 
 
396 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.43 
 
 
364 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 
340 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.65 
 
 
339 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.67 
 
 
337 aa  281  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.29 
 
 
364 aa  281  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 
353 aa  281  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.81 
 
 
344 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1284  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.64 
 
 
344 aa  280  3e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.718117  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1101  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.64 
 
 
344 aa  280  4e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.423507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>