98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1278 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  93.56 
 
 
407 aa  652    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  100 
 
 
407 aa  813    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  77.29 
 
 
343 aa  532  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2105  cytochrome c, class I  39.11 
 
 
315 aa  183  6e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  38.55 
 
 
728 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  38.14 
 
 
269 aa  156  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  39.32 
 
 
698 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  38.98 
 
 
773 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  37.71 
 
 
272 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.03 
 
 
689 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  36.96 
 
 
329 aa  150  4e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.83 
 
 
699 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.38 
 
 
726 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  38.72 
 
 
721 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  38.72 
 
 
694 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  38.59 
 
 
669 aa  149  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  39.82 
 
 
712 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  38.3 
 
 
721 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  33.66 
 
 
675 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  37.92 
 
 
691 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  33 
 
 
675 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0259  cytochrome c class I  34.57 
 
 
331 aa  140  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  38.46 
 
 
708 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  32.41 
 
 
351 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0690  cytochrome c class I  34.18 
 
 
303 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  32.72 
 
 
355 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  33.13 
 
 
351 aa  138  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  32.1 
 
 
355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  32.1 
 
 
351 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  33.69 
 
 
311 aa  137  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  32.1 
 
 
355 aa  136  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0128  putative cytochrome C  33.33 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0408235  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  37.72 
 
 
313 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  33.02 
 
 
352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  39.64 
 
 
310 aa  134  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  31.27 
 
 
355 aa  133  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  36.1 
 
 
309 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  36.68 
 
 
282 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000643985  hitchhiker  0.0000202689 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0527  cytochrome c family protein  33.82 
 
 
352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000661478  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1476  cytochrome c class I  34.71 
 
 
317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4236  cytochrome c class I  36.4 
 
 
343 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185461  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  37.19 
 
 
327 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6947  cytochrome c class I  32.63 
 
 
358 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2599  cytochrome c family protein  31.02 
 
 
306 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.349522  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0193  cytochrome c, class I  37.07 
 
 
327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  37.26 
 
 
329 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  34.67 
 
 
327 aa  127  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  35.14 
 
 
291 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  33.33 
 
 
369 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1496  cytochrome c class I  33.05 
 
 
308 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  33.33 
 
 
357 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4873  cytochrome c class I  34.47 
 
 
306 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  30.47 
 
 
372 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  36.2 
 
 
304 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  36.2 
 
 
304 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  36.2 
 
 
304 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  33.07 
 
 
353 aa  123  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003030  cytochrome c family protein  34.57 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  34.7 
 
 
293 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  34.14 
 
 
304 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1309  diheme-containing SoxA-like protein  31.12 
 
 
346 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  34.07 
 
 
337 aa  117  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1092  cytochrome c class I  31.6 
 
 
333 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2608  cytochrome c class I  33.01 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  30.54 
 
 
671 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0885  cytochrome C  42.15 
 
 
181 aa  99  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2754  Cytochrome c-like protein  43.18 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0564833  hitchhiker  0.0019216 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0653  cytochrome c  41.67 
 
 
130 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963006  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4179  cytochrome c, class I  27.6 
 
 
347 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402721  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  33.59 
 
 
139 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1187  cytochrome C  50 
 
 
79 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0075  cytochrome c family protein  24.57 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.667536  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0051  cytochrome c family protein  24.57 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0036  cytochrome c family protein  24.57 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.170219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  56.52 
 
 
656 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2708  cytochrome c, class I  23.74 
 
 
343 aa  63.2  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_003296  RS03090  putative cytochrome C signal peptide protein  25.64 
 
 
363 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.649207  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0884  cytochrome c family protein, degenerate  44.44 
 
 
125 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7671  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  27.54 
 
 
258 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0514  hypothetical protein  27.15 
 
 
268 aa  54.7  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000430045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1761  cytochrome c family protein  46.15 
 
 
511 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745977  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4159  putative sulfur oxidation protein (SoxA); cytochrome c precursor  28.7 
 
 
288 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0706  hypothetical protein  49.15 
 
 
553 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.31357  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0063  putative cytochrome c  28.97 
 
 
261 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3674  putative sulfur oxidation protein (SoxA)  32.95 
 
 
274 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2761  putative diheme cytochrome C  33.71 
 
 
258 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0432  hypothetical protein  22.33 
 
 
284 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1906  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  26.4 
 
 
294 aa  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.556317  normal  0.0839186 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3714  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  26.4 
 
 
294 aa  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.873772  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  54.17 
 
 
683 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0369  hypothetical protein  50 
 
 
535 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1881  cytochrome c family protein  42.86 
 
 
510 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6959  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  29.63 
 
 
262 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0534  hypothetical protein  44.64 
 
 
182 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0313  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  26.11 
 
 
239 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450378  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  32.97 
 
 
149 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  40.7 
 
 
427 aa  43.1  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1563  cytochrome c-like protein  29.27 
 
 
145 aa  42.7  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>