More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1244 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  100 
 
 
128 aa  257  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  98.44 
 
 
128 aa  254  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  98.44 
 
 
128 aa  254  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  82.68 
 
 
127 aa  224  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  59.2 
 
 
126 aa  168  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  54.4 
 
 
140 aa  154  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  53.91 
 
 
130 aa  153  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  53.6 
 
 
126 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  54.76 
 
 
127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  53.97 
 
 
127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  52.76 
 
 
127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  55.83 
 
 
127 aa  149  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 
126 aa  147  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  55 
 
 
127 aa  148  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 
126 aa  147  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  55 
 
 
127 aa  147  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  55 
 
 
127 aa  147  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  55 
 
 
127 aa  147  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  55 
 
 
127 aa  147  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  55 
 
 
127 aa  147  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  55 
 
 
127 aa  147  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  51.56 
 
 
129 aa  147  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  55 
 
 
127 aa  147  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  55 
 
 
127 aa  147  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 
131 aa  147  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  55 
 
 
127 aa  146  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  52 
 
 
126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  54.4 
 
 
126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  55.91 
 
 
126 aa  144  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 
127 aa  143  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  54.84 
 
 
126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  54.03 
 
 
126 aa  143  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 
126 aa  142  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  53.12 
 
 
127 aa  142  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  55.56 
 
 
127 aa  142  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 
125 aa  142  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 
130 aa  141  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 
131 aa  140  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 
126 aa  140  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 
126 aa  140  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  55.3 
 
 
134 aa  139  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 
126 aa  139  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  53.72 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  53.91 
 
 
129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  55.28 
 
 
127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 
129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  52.38 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  54.03 
 
 
126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  51.61 
 
 
128 aa  138  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 
129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  48.41 
 
 
129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 
129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 
129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 
129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 
129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  48.41 
 
 
129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 
129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 
129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 
129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 
129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 
129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  47.62 
 
 
128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 
129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 
127 aa  137  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
125 aa  137  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  51.13 
 
 
134 aa  137  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  46.09 
 
 
128 aa  137  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  53.04 
 
 
126 aa  137  7e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 
130 aa  135  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  50.78 
 
 
131 aa  135  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  47.66 
 
 
132 aa  136  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  52.38 
 
 
125 aa  136  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 
127 aa  135  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 
129 aa  135  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  47.62 
 
 
129 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 
130 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  50.83 
 
 
134 aa  135  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  47.66 
 
 
127 aa  135  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1615  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 
127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  48.39 
 
 
129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 
127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  48.39 
 
 
129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  51.61 
 
 
126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  51.56 
 
 
134 aa  134  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 
126 aa  134  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 
129 aa  134  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 
126 aa  134  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 
124 aa  134  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 
127 aa  134  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 
132 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 
127 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 
129 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 
125 aa  133  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 
127 aa  133  7.000000000000001e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  51.69 
 
 
124 aa  133  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01656  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 
131 aa  133  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.671039  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  58.25 
 
 
129 aa  132  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  132  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2348  glycine cleavage system H protein  51.97 
 
 
134 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>