More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1195 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  100 
 
 
212 aa  377  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  93.4 
 
 
212 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  92.45 
 
 
212 aa  274  8e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  33.98 
 
 
205 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  36.41 
 
 
199 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  36.65 
 
 
183 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  33.15 
 
 
200 aa  99.8  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  33.14 
 
 
189 aa  98.6  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  35.38 
 
 
200 aa  95.5  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  31.21 
 
 
344 aa  95.1  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3202  CheW protein  40 
 
 
182 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.525075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  39.51 
 
 
181 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  32.52 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  34.76 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  32.52 
 
 
159 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  29.27 
 
 
154 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  42.61 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4816  CheW protein  39.06 
 
 
189 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  35.34 
 
 
163 aa  79  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  30.22 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  28.81 
 
 
159 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  30.97 
 
 
164 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.61 
 
 
164 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  41.74 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  32.09 
 
 
163 aa  77  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  36.13 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  29.71 
 
 
161 aa  77  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  41.74 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  32.09 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  32.84 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.89 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  30.89 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  31.71 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  30.89 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  30.89 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  30.65 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5776  CheW protein  38.28 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.727432  normal  0.120994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  30.89 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  30.89 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  31.43 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.57 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  30.57 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  30.57 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  30.57 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.82 
 
 
164 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  30.57 
 
 
164 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  31.16 
 
 
164 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  30.57 
 
 
164 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  30.57 
 
 
164 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  29.56 
 
 
164 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  30.57 
 
 
164 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2380  CheW protein  35.25 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  29.66 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  31.34 
 
 
163 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2218  chemotaxis protein CheW  38.26 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  34.19 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  30.92 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  32.09 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.34 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  40 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  34.84 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  32.09 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  32.09 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1000  putative CheW protein  39.26 
 
 
182 aa  72  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  34.72 
 
 
184 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  30.37 
 
 
169 aa  72  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  28.66 
 
 
162 aa  72  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  34.72 
 
 
184 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1838  CheW protein  35.25 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00299326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  28.46 
 
 
161 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  31.34 
 
 
161 aa  72  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  33.82 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  29.71 
 
 
163 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  25.17 
 
 
149 aa  71.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  29.86 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  31.06 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  37.61 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  41.12 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  27.03 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  31.71 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  37.06 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  28.35 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  28.47 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  31.58 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  32.77 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  43.48 
 
 
479 aa  68.6  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.3 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.06 
 
 
164 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.52 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.3 
 
 
164 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  27.42 
 
 
170 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  33.81 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  33.61 
 
 
163 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6736  CheW protein  30.94 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17041  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  35.48 
 
 
169 aa  67.8  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  31.16 
 
 
162 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0598  CheW protein  31.19 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  31.16 
 
 
162 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  31.91 
 
 
162 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  28.16 
 
 
168 aa  67  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>