More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1104 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 138 aa  277  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  98.55 
 
 		 138 aa  274  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  97.12 
 
 		 139 aa  267  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1143  ribosome-binding factor A  74.14 
 
 		 122 aa  181  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  46.9 
 
 		 118 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  45.54 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  48.18 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  46.73 
 
 		 119 aa  110  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  45.79 
 
 		 119 aa  110  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  48.62 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  46.02 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  40.77 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  45.13 
 
 		 118 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  44.44 
 
 		 127 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  45.13 
 
 		 118 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  45.13 
 
 		 118 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  45.13 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  45.13 
 
 		 118 aa  105  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  44.25 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  44.25 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  45.13 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  45.13 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  45.13 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  47.86 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  40.5 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  42.52 
 
 		 133 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  44.74 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  44.64 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  38.74 
 
 		 119 aa  97.4  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  38.05 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  41.23 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  38.28 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  39.55 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  44.14 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  45.95 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  41.59 
 
 		 132 aa  94  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  39.66 
 
 		 120 aa  94  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  37.69 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  38.32 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0070  ribosome-binding factor A  40.16 
 
 		 134 aa  92.8  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.196892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0075  ribosome-binding factor A  40.16 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.122288  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  43.44 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  45.37 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  34.78 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  39.09 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  44.04 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  36.99 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  38.84 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0158  ribosome-binding factor A  38.58 
 
 		 140 aa  90.9  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 116 aa  89.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  42.28 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  44.04 
 
 		 118 aa  87.4  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  38.26 
 
 		 128 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  38.26 
 
 		 128 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3604  ribosome-binding factor A  37.04 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  36.3 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  36.3 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  36.3 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3347  ribosome-binding factor A  37.6 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  37.04 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  37.04 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  37.04 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  37.04 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  37.04 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  43.12 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  34.4 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  37.04 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3604  ribosome-binding factor A  37.04 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  37.04 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  37.04 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  42.99 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1427  ribosome-binding factor A  41.23 
 
 		 175 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000533542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3474  ribosome-binding factor A  36.3 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  41.23 
 
 		 126 aa  84  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3642  ribosome-binding factor A  36.3 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  35.25 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  34.62 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  35.61 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1417  ribosome-binding factor A  37.72 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0421454  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  35.78 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  35.78 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1184  ribosome-binding factor A  37.82 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.352255 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  42 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3033  ribosome-binding factor A  37.04 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000370905  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1354  ribosome-binding factor A  39.83 
 
 		 117 aa  80.1  0.000000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 133 aa  80.1  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3560  ribosome-binding factor A  38.6 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466003  normal  0.834335 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  38.18 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  39.64 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1105  ribosome-binding factor A  37.74 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.657587  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>