More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1100 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1228  NusA antitermination factor  99.46 
 
 		 557 aa  1118    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1139  NusA antitermination factor  93.41 
 
 		 556 aa  1041    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1160  NusA antitermination factor  99.46 
 
 		 557 aa  1118    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1100  NusA antitermination factor  100 
 
 		 557 aa  1123    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  56.03 
 
 		 538 aa  511  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  55.18 
 
 		 381 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  54.26 
 
 		 383 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  53.09 
 
 		 383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  53.09 
 
 		 382 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  53.49 
 
 		 385 aa  405  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  44.68 
 
 		 449 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  53.91 
 
 		 406 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  47.17 
 
 		 475 aa  395  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  52.45 
 
 		 401 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  44.24 
 
 		 537 aa  380  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  51.87 
 
 		 385 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  44.42 
 
 		 538 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  43.8 
 
 		 535 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  45.05 
 
 		 534 aa  375  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  43.6 
 
 		 537 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  43.6 
 
 		 537 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  48.05 
 
 		 536 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  43.74 
 
 		 535 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  45.84 
 
 		 552 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  43.23 
 
 		 536 aa  365  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  44.11 
 
 		 533 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  45.85 
 
 		 537 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  46.31 
 
 		 516 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  46.21 
 
 		 544 aa  362  8e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  45.73 
 
 		 538 aa  362  1e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  45.62 
 
 		 506 aa  362  1e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  43.26 
 
 		 539 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  45.61 
 
 		 560 aa  359  6e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  45.39 
 
 		 545 aa  359  6e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  45.39 
 
 		 545 aa  359  6e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  44.27 
 
 		 540 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  44.37 
 
 		 532 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  45.27 
 
 		 545 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  42.17 
 
 		 534 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  45.78 
 
 		 531 aa  356  5.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  45.16 
 
 		 572 aa  354  2.9999999999999997e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  45.19 
 
 		 541 aa  353  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3561  transcription elongation factor NusA  43.51 
 
 		 544 aa  353  5e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  41.16 
 
 		 535 aa  351  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  41.16 
 
 		 535 aa  351  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  45.66 
 
 		 548 aa  350  3e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  45.34 
 
 		 506 aa  350  3e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  45.08 
 
 		 537 aa  350  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  46.09 
 
 		 536 aa  350  5e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  45.81 
 
 		 544 aa  349  6e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0031  transcription elongation factor NusA  45.23 
 
 		 568 aa  347  3e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0061  transcription elongation factor NusA  42.13 
 
 		 449 aa  346  6e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.941395  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2515  transcription elongation factor NusA  42.86 
 
 		 443 aa  346  6e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  44.74 
 
 		 538 aa  345  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  45.43 
 
 		 440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  45.78 
 
 		 404 aa  342  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3161  transcription elongation factor NusA  41.71 
 
 		 429 aa  339  8e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00111335  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2592  transcription elongation factor NusA  41.97 
 
 		 559 aa  335  9e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.808645  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2431  transcription elongation factor NusA  40.6 
 
 		 428 aa  334  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.786529  normal  0.585225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3819  transcription elongation factor NusA  46.24 
 
 		 529 aa  333  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  43.31 
 
 		 441 aa  332  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0040  transcription elongation factor NusA  43.4 
 
 		 590 aa  332  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  43.85 
 
 		 538 aa  332  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  42.89 
 
 		 523 aa  330  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4491  N utilization substance protein A  40.72 
 
 		 493 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.119546  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4181  transcription elongation factor NusA  40.72 
 
 		 493 aa  327  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3609  transcription elongation factor NusA  40.18 
 
 		 493 aa  325  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0720  transcription elongation factor NusA  40.72 
 
 		 493 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0992944 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  40.27 
 
 		 495 aa  321  3e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  44.95 
 
 		 365 aa  319  7.999999999999999e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4713  transcription elongation factor NusA  40.49 
 
 		 493 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4713  transcription elongation factor NusA  40.49 
 
 		 493 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0778  transcription elongation factor NusA  40.62 
 
 		 493 aa  318  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311397  normal  0.0634223 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  46.05 
 
 		 362 aa  318  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4578  transcription elongation factor NusA  40.49 
 
 		 493 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00867288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42830  transcription elongation factor NusA  40.63 
 
 		 493 aa  317  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  45.48 
 
 		 382 aa  316  7e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  45.38 
 
 		 383 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  45.43 
 
 		 382 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0554  NusA antitermination factor  40 
 
 		 493 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557873  normal  0.218927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0390  transcription termination factor NusA  40 
 
 		 493 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  44.92 
 
 		 380 aa  313  3.9999999999999997e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5463  transcription elongation factor NusA  38.83 
 
 		 493 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  37.93 
 
 		 492 aa  313  5.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62770  transcription elongation factor NusA  38.83 
 
 		 493 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  47.31 
 
 		 377 aa  312  7.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0066  transcription elongation factor NusA  39.37 
 
 		 488 aa  311  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000185989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  43.75 
 
 		 346 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1228  transcription elongation factor NusA  37.79 
 
 		 493 aa  310  4e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00625796  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0562  transcription elongation factor NusA  40.05 
 
 		 503 aa  310  5e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2453  transcription elongation factor NusA  38.24 
 
 		 490 aa  310  5.9999999999999995e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000540151  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  43.97 
 
 		 373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1601  transcription elongation factor NusA  39.82 
 
 		 503 aa  308  1.0000000000000001e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2709  transcription elongation factor NusA  40.73 
 
 		 493 aa  308  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2032  transcription elongation factor NusA  37.45 
 
 		 491 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395424  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  43.97 
 
 		 493 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1116  transcription elongation factor NusA  37.45 
 
 		 491 aa  306  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.749384 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  45.08 
 
 		 368 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1209  transcription elongation factor NusA  37.23 
 
 		 491 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  43.09 
 
 		 384 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>