73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1076 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1135  hypothetical protein  99.25 
 
 
531 aa  1084    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1204  hypothetical protein  99.25 
 
 
531 aa  1084    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.117287  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1332  hypothetical protein  58.52 
 
 
539 aa  640    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0801  hypothetical protein  58.75 
 
 
536 aa  660    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0045  glycoside hydrolase family protein  57.41 
 
 
527 aa  638    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1076  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
531 aa  1090    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5064  hypothetical protein  59.17 
 
 
529 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224358 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1304  hypothetical protein  58.52 
 
 
539 aa  639    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1889  hypothetical protein  60.3 
 
 
531 aa  644    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.804439 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2006  Domain of unknown function DUF1957  58.06 
 
 
528 aa  660    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1115  hypothetical protein  89.04 
 
 
532 aa  993    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.096996  normal  0.0392314 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1045  glycoside hydrolase family protein  57.71 
 
 
529 aa  634  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2325  glycoside hydrolase family protein  56.23 
 
 
537 aa  625  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3806  hypothetical protein  58.79 
 
 
529 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0382  glycoside hydrolase family protein  59.09 
 
 
529 aa  623  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0047  hypothetical protein  54.56 
 
 
537 aa  617  1e-175  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.666843  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16000  hypothetical protein  53.7 
 
 
542 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1983  hypothetical protein  58.14 
 
 
529 aa  605  9.999999999999999e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1915  glycoside hydrolase family protein  53.79 
 
 
528 aa  583  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0191786  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0306  hypothetical protein  51.71 
 
 
528 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0294  hypothetical protein  50 
 
 
524 aa  566  1e-160  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0429  hypothetical protein  55.62 
 
 
528 aa  560  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0339  hypothetical protein  48.87 
 
 
534 aa  557  1e-157  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0867  hypothetical protein  49.91 
 
 
533 aa  550  1e-155  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1330  glycoside hydrolase family protein  51.22 
 
 
528 aa  547  1e-154  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00276943  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1356  hypothetical protein  51.41 
 
 
528 aa  544  1e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000931698  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0560  glycoside hydrolase family 57  48.94 
 
 
513 aa  538  1e-151  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0588  hypothetical protein  45.59 
 
 
538 aa  533  1e-150  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  51.62 
 
 
935 aa  524  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0099  glycoside hydrolase family protein  49.71 
 
 
533 aa  502  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1854  glycoside hydrolase family protein  49.62 
 
 
582 aa  493  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15211  hypothetical protein  40.8 
 
 
521 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.270721  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0687  hypothetical protein  40.79 
 
 
521 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.034103  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11711  hypothetical protein  38.35 
 
 
527 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1940  hypothetical protein  40.9 
 
 
531 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1076  hypothetical protein  37.9 
 
 
527 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0726  hypothetical protein  40.61 
 
 
527 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11701  hypothetical protein  37.52 
 
 
527 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0208787  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11551  hypothetical protein  38.17 
 
 
527 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.512762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09171  hypothetical protein  40.71 
 
 
522 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.127848 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11251  hypothetical protein  37.77 
 
 
520 aa  360  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.448443  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0895  glycoside hydrolase family 57  31.16 
 
 
520 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4461  hypothetical protein  36.21 
 
 
649 aa  274  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.608634  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0433  glycoside hydrolase family 57  33.51 
 
 
514 aa  255  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.188798  hitchhiker  0.0014488 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1094  hypothetical protein  29.41 
 
 
525 aa  254  2.0000000000000002e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28290  hypothetical protein  31.99 
 
 
505 aa  196  7e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.964818  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3262  hypothetical protein  30.33 
 
 
522 aa  194  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2919  glycoside hydrolase family 57  29.53 
 
 
512 aa  193  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.597647  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1868  glycoside hydrolase family protein  30.24 
 
 
521 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1914  glycoside hydrolase family protein  30.24 
 
 
521 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0322006  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1501  hypothetical protein  30.35 
 
 
520 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.53215  normal  0.500126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1848  glycoside hydrolase family protein  30.24 
 
 
521 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6057  glycoside hydrolase family 57  30.9 
 
 
499 aa  187  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3734  glycoside hydrolase family protein  29.76 
 
 
511 aa  187  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2097  glycoside hydrolase family protein  29.87 
 
 
532 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13047  hypothetical protein  29.78 
 
 
526 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4261  glycoside hydrolase family protein  29.48 
 
 
531 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0114  hypothetical protein  27.57 
 
 
480 aa  150  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.54756  normal  0.147271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4653  glycoside hydrolase family 57  30.45 
 
 
491 aa  127  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4743  hypothetical protein  25.38 
 
 
478 aa  124  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  29 
 
 
686 aa  47.4  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0531  glycoside hydrolase family 57  24.06 
 
 
361 aa  45.8  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3241  glycoside hydrolase family 57  24.46 
 
 
709 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  28.46 
 
 
726 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  26.86 
 
 
722 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  28.46 
 
 
726 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  28.46 
 
 
726 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  22.3 
 
 
1162 aa  45.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2350  glycoside hydrolase family protein  38.98 
 
 
807 aa  43.9  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  26.96 
 
 
731 aa  43.9  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  25.71 
 
 
749 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  25.71 
 
 
749 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  25.51 
 
 
743 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>