More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0977 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 311 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  96.14 
 
 		 311 aa  558  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  90.68 
 
 		 294 aa  517  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  64.77 
 
 		 313 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  66.78 
 
 		 313 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  66.11 
 
 		 313 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  65.44 
 
 		 313 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  40.2 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3944  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 290 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3433  transcriptional regulator LysR family  37.37 
 
 		 297 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0126  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3911  transcriptional regulator, LysR family  40.4 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3798  transcriptional regulator, LysR family  40.4 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  35.07 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  34.67 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  37.19 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3048  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3368  transcriptional regulator, LysR family  35.53 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0722  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 294 aa  153  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2367  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 299 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3207  transcriptional regulator, LysR family  33.21 
 
 		 302 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118279  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4568  transcriptional regulator, LysR family  34.65 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.759587 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0148  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.148101  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0386  transcriptional regulator, LysR family  33.99 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4731  helix-turn-helix, Fis-type  34.53 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210244  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6201  transcriptional regulator, LysR family  33.08 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0706  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265048  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2844  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223887  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0074  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183793  hitchhiker  0.0000000265009 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.49 
 
 		 295 aa  149  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4165  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2725  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 283 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1259  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1199  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 313 aa  145  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 332 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5859  transcriptional regulator, LysR family  31.48 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3974  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 328 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3357  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0055  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 295 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 315 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 303 aa  142  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3073  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.33 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.857861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 295 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 306 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 306 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3189  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 279 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4058  LysR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0555  transcriptional regulator LysR family  35.38 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0653  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  34.71 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1860  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 328 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547107 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  33.8 
 
 		 317 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3977  transcriptional regulatory protein  31.4 
 
 		 315 aa  138  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0412  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2242  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163141  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0492  transcriptional regulator, LysR family  33.96 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0963862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0673  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.294522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3779  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.750193 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>