22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0964 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0964  PGAP1-like  100 
 
 
414 aa  798    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1023  PGAP1 family protein  90.7 
 
 
399 aa  696    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0358046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1026  PGAP1 family protein  90.2 
 
 
399 aa  686    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3594  PGAP1 family protein  50.46 
 
 
449 aa  388  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3545  PGAP1-like  50.87 
 
 
423 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3190  PGAP1 family protein  51.76 
 
 
396 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4373  PGAP1-like  49.33 
 
 
374 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0056  PGAP1 family protein  40.66 
 
 
387 aa  267  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0514  PGAP1 family protein  33.7 
 
 
474 aa  233  7.000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.513101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0300  PGAP1 family protein  37.93 
 
 
407 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76857  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1198  PGAP1-like protein  37.87 
 
 
413 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1215  PGAP1 family protein  37.87 
 
 
413 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.765286  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0301  hypothetical protein  35.78 
 
 
488 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  35.06 
 
 
487 aa  210  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2070  PGAP1 family protein  35.14 
 
 
495 aa  197  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2983  PGAP1 family protein  41.34 
 
 
437 aa  196  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2497  PGAP1 family protein  40.43 
 
 
418 aa  182  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  37.26 
 
 
378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3693  hypothetical protein  33.44 
 
 
304 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475055  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  36.29 
 
 
286 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  27.35 
 
 
382 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  36.8 
 
 
361 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>