More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0903 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  100 
 
 		 290 aa  584  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  98.28 
 
 		 291 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  98.28 
 
 		 291 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  81.66 
 
 		 303 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  55.44 
 
 		 331 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  55.09 
 
 		 331 aa  324  9e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  55.44 
 
 		 331 aa  324  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  57.68 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  57.68 
 
 		 331 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  57.3 
 
 		 331 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  55.09 
 
 		 334 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  54.84 
 
 		 336 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  54.2 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  55.28 
 
 		 331 aa  319  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  55.28 
 
 		 331 aa  319  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  55.28 
 
 		 331 aa  319  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  55.28 
 
 		 331 aa  319  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  55.28 
 
 		 331 aa  319  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  55.28 
 
 		 331 aa  319  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  55.28 
 
 		 331 aa  319  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  58.92 
 
 		 340 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  58.51 
 
 		 302 aa  316  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  57.68 
 
 		 336 aa  316  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  54.58 
 
 		 317 aa  312  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  54.58 
 
 		 317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0548366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  57.98 
 
 		 316 aa  312  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  50.52 
 
 		 314 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4231  PP-loop domain-containing protein  55.64 
 
 		 310 aa  310  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.191142 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1708  PP-loop domain protein  56.43 
 
 		 302 aa  308  9e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  56.15 
 
 		 274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  55.74 
 
 		 274 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  56.15 
 
 		 274 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  51.43 
 
 		 298 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0942  PP-loop domain-containing protein  57.72 
 
 		 294 aa  305  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.907512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  56.15 
 
 		 274 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  54.3 
 
 		 312 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  54.9 
 
 		 314 aa  305  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  59 
 
 		 289 aa  305  6e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2064  PP-loop superfamily ATPase  56.15 
 
 		 318 aa  305  6e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  54.92 
 
 		 274 aa  305  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  54.1 
 
 		 274 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  54.94 
 
 		 313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  55.47 
 
 		 315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0554  C32 tRNA thiolase  52.67 
 
 		 313 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  55.06 
 
 		 315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4089  C32 tRNA thiolase  52.42 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1778  C32 tRNA thiolase  53.66 
 
 		 311 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  54.69 
 
 		 311 aa  301  6.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  53.66 
 
 		 311 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  53.66 
 
 		 311 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800343 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1738  C32 tRNA thiolase  54.07 
 
 		 313 aa  301  8.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  53.66 
 
 		 311 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  53.66 
 
 		 311 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  53.66 
 
 		 311 aa  301  9e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  53.66 
 
 		 311 aa  301  9e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  53.66 
 
 		 311 aa  301  9e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  54.03 
 
 		 313 aa  300  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  53.66 
 
 		 311 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  54.69 
 
 		 274 aa  300  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  53.66 
 
 		 311 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  53.66 
 
 		 311 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  53.66 
 
 		 311 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  54.69 
 
 		 274 aa  300  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  53.66 
 
 		 311 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  55.06 
 
 		 312 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1589  C32 tRNA thiolase  53.66 
 
 		 311 aa  300  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  54.07 
 
 		 311 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2230  PP-loop domain-containing protein  54.88 
 
 		 279 aa  300  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.653141 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  54.47 
 
 		 310 aa  299  4e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1684  hypothetical protein  54.51 
 
 		 274 aa  298  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  54.25 
 
 		 302 aa  299  5e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  50.93 
 
 		 303 aa  298  7e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0974  PP-loop domain protein  54.84 
 
 		 309 aa  298  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  49.45 
 
 		 307 aa  296  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  54.73 
 
 		 284 aa  296  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0695  C32 tRNA thiolase  56.67 
 
 		 317 aa  296  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283768  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2962  C32 tRNA thiolase  54.92 
 
 		 274 aa  296  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828296  normal  0.0229557 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  53.66 
 
 		 310 aa  296  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  51.42 
 
 		 317 aa  295  6e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  52.65 
 
 		 319 aa  295  8e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2142  C32 tRNA thiolase  51.84 
 
 		 311 aa  293  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.614557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1596  ATPase  50.94 
 
 		 302 aa  292  4e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.612685  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  51.63 
 
 		 314 aa  292  5e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0863  C32 tRNA thiolase  53.66 
 
 		 314 aa  292  5e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33230  C32 tRNA thiolase  53.88 
 
 		 274 aa  291  6e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259091  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  51.63 
 
 		 313 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  51.63 
 
 		 313 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  51.63 
 
 		 313 aa  291  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2880  hypothetical protein  53.66 
 
 		 289 aa  290  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  53.82 
 
 		 319 aa  290  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0815  PP-loop  51.85 
 
 		 338 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  52.85 
 
 		 287 aa  290  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  51.84 
 
 		 309 aa  289  5.0000000000000004e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1995  C32 tRNA thiolase  51.82 
 
 		 317 aa  288  7e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0619881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  50.61 
 
 		 322 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  50.61 
 
 		 322 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  50.61 
 
 		 322 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  51.84 
 
 		 323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2225  C32 tRNA thiolase  51.42 
 
 		 310 aa  285  4e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28353 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1733  C32 tRNA thiolase  53.63 
 
 		 299 aa  285  5e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>